Возбудители ГСИ 2021 (Лекция. Возбудители гнойно-септических инфекций. 2021) — PDF, страница 2
Вызывают послеоперационныеосложнения:• у ослабленных больных• у лиц пожилого возраста2. Начинаются через 1-2 неделипосле операцииHaemophilus influenzae• Грамотрицательныепалочки,• Могут иметькапсулуHaemophilus influenzaeФакторы агрессии H.influenzae :• Капсула• Ig A протеаза — инактивация секреторныхантител• Пили — обеспечивают адгезию к эпителиюреспираторного тракта• Эндотоксин — ЛПС вызывает параличресничек мерцательного эпителияреспираторного трактаГрамотрицательные бактерии• Наиболее частымвозбудителем являетсяKlebsiella pneumoniae• Грамотрицательныебактерии, неподвижные,имеют капсулу• Резистентны кантибиотикам• Госпитальные инфекцииKlebsiella pneumoniaeФакторы агрессии:••••••КапсулаФимбрииЭндотоксинДНКазаФосфатазаНейраминидазаE.coliE.coli в мазкерасполагаются одиночно,парами или хаотично.Жгутики + Споры Капсула +/- Грам (-)Факторы агрессии:•капсула•гемолизин•адгезия•уреаза•биопленка (biofilm)БиопленкаБиопленка — сообщество бактерий, необратимоприкрепленных к субстрату и друг к другу изащищенных продуцируемым этими клеткамивнеклеточным полимерным матриксом.1.Прикрепление кповерхностиотдельнойбактериальнойклетки2.
Агрегация клеток3. Включаются геныопределяющиеспособность синтезаэкзополисахаридаБиопленкаБиопленка на катетереРаспространение резистентности к антибиотикамУстойчивость микроорганизмовбиопленкиМикроорганизм ПрепаратСодержание антибиотикамкг/млжидкая среда биопленка220S.aureusванкомицинE.coliампициллин2512Pseudomonasцефтазидим8800Streptococcusдоксициклин0,0633,15Грибы рода CandidaГрибы Candida поморфологии вытянутыеклетки, имеютпсевдомицелий,размножаютсябластоспорами ихламидоспорами, чаще• C.albicans• C.tropicalis• другие виды Candida(чаще у лиц симмунодефицитами)Микробиологическая диагностикаГСИПоказания••••Лихорадка (38˚С и выше)Гипотермия (36 ˚С и ниже)Лейкоцитоз (особенно со сдвигом влево)ГранулоцитопенияДиагностикаЗабор крови• До начала антибиотикотерапии или через 8-10 часов послевведения препарата• На фоне антибиотикотерапии необходимо нейтрализоватьпрепарат:- пенициллин — пенициллиназа- цефалоспорин — цефалоспориназа- тетрациклины — ионы магния• Кровь берут из вены на фоне лихорадки, соблюдая правилаасептики в стерильную посуду (стерильные пробирки с0,3% раствором цитрата натрия или 1мл гепарина) ибыстро доставляют в лабораториюЗабор крови• Вымыть руки• Обработать кожу пациента спиртом 2-х кратно по 30 сек ,тампон удалить• Надеть стерильные перчатки• Взять кровь из локтевой вены у взрослых 10-20 мл, удетей 1-5 мл• Посеять во флакон с питательной средой в соотношении1:10 или в специальные флаконы непосредственно упостели больного ( 2 флакона для аэробов и анаэробов)Диагностика (материал)••••••МокротаБронхиальный лаважАспиратТкань легкого при биопсииПлевральная жидкостьКровь (при септицемии)Лабораторная диагностика• Микроскопия мазка из материала• Посев, выделение чистой культурывозбудителя и ее идентификация• Определениечувствительностик антибиотикамЗаключение• Золотым стандартом диагностики ГСИ является выделениеи определение вида возбудителя• Для клинициста важным является проведение этиотропнойтерапии (назначение антибиотиков) на основании данныхчувствительности выделенного возбудителя кантибиотикам.• Все это возможно при взаимодействии клиницистов иврачей бактериологов, эпидемиологов, начиная справильного забора биоматериала больного, его храненияи транспортировки в лабораторию, качественногопроведения лабораторного исследования, правильнойинтерпретации результатов исследования в лаборатории иумения клинициста качественного использоватьполученный результат.Благодарю за внимание!.
» Страница не найдена ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт
Всероссийская региональная научно-практическая конференция молодых специалистов• Пятница, Март 11th, 2022
10 марта 2022 года состоялась Всероссийская региональная научно-практическая конференция молодых специалистов «Современное состояние эпидемиологии и профилактики новой коронавирусной инфекции COVID-19», в формате on-line с применением дистанционных технологий.В работе мероприятия приняли участие студенты, ординаторы Ростовского государственного медицинского университета и молодые научные сотрудники ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора и Ростовский научно-исследовательский институт микробиологии и паразитологии Роспотребнадзора. Читать полностью…
• Вторник, Февраль 22nd, 2022
Совет молодых учёных Ростовского-на-Дону противочумного института поздравляет всех мужчин с замечательным праздником 23 февраля! От всей души желаем вам упорства, стойкости, железной воли, верить в себя и всегда добиваться поставленных целей! Успехов вам во всём и пусть сбудутся все ваши мечты! Крепкого здоровья и долголетия!
• Вторник, Февраль 08th, 2022
Памяти Юрия Михайловича Ломова
Федеральное казенное учреждение здравоохранения «Ростовский-на-Дону ордена Трудового Красного Знамени научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора с глубоким прискорбием сообщает, что 8 февраля 2022 года в возрасте 85 лет ушёл из жизни доктор медицинских наук, профессор, академик Российской академии естественных наук Ломов Юрий Михайлович.
Всю свою трудовую деятельность он посвятил Ростовскому-на-Дону ордена Трудового Красного Знамени научно-исследовательскому противочумному институту, начав ее после окончания Ростовского государственного медицинского института с должности младшего научного сотрудника лаборатории генетики фагов. С 1988 по 2010 годы работал директором Института. Читать полностью…
Научные публикации института за 2021 год• Понедельник, Январь 24th, 2022
Монографии
- COVID-19: научно-практические аспекты борьбы с пандемией в Российской Федерации / под. ред. д-ра мед. наук, проф. А.Ю. Поповой [Авторы: А.Ю. Попова, Е.Б. Ежлова, В.Ю. Смоленский,… А.К. Носков, О.С. Чемисова, Н.Е. Гаевская, Н.В. Павлович, В.Д. Кругликов, А.Б. Мазрухо, Н.Л. Пичурина, Е.Г. Соболева, Е.Г. Янович, Д.А. Кузнецова, Н.В. Аронова, С.И. Стенина, А.С. Водопьянов, С.О. Водопьянов, М.В. Цимбалистова, Р.В. Писанов, О.П. Добровольский, Е.Н. Сокиркина, А.А. Кононенко, М.И. Ежова…и др.] — Саратов: Амирит,2021.-608 с.
Читать полностью…
• Четверг, Декабрь 30th, 2021
30 декабря 2021 г. в ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора состоялось заключительное заседание Ученого совета, на котором были подведены итоги года, в том числе по результатам конкурсов молодых ученых ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора в 2021 г. Читать полностью…
• Четверг, Декабрь 30th, 2021
30 декабря 2021 г. в ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора состоялось заключительное заседание Учёного совета, на котором были подведены итоги уходящего года. Директор института Алексей Кимович Носков поблагодарил сотрудников за активную работу, рассказал о перспективах на будущий год и поздравил с наступающим 2022 годом. Читать полностью…
• Четверг, Декабрь 30th, 2021
27 декабря 2021 г. в ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора состоялось заключительное заседание СМУ, на котором были подведены итоги уходящего года и определены перспективы на будущий год. Молодые ученые установили эко-ели из книг с целью мотивации сотрудников института не только больше читать, но и активнее публиковать результаты своих исследований.
Совет молодых учёных ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора поздравляет всех с новым 2022 годом!
• Среда, Декабрь 29th, 2021
17 декабря 2021 г. состоялась X Межрегиональная научно-практическая конференция «Микробиологические аспекты диагностики и вакцинопрофилактики инфекционных заболеваний» (on-line) на базе ФГБОУ ВО «Ростовский государственный медицинский университет» Минздрава России. На конференции молодых ученых были представлены 10 докладов молодых ученых, студентов и ординаторов.
ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора представляла ординатор 1 года обучения по специальности «Бактериология» ФГБОУ ВО «Ростовский государственный медицинский университет» Минздрава России, лаборант отдела микробиологии холеры и других острых кишечных инфекций Горох Алевтина Михайловна с докладом на тему: «Полногеномное секвенирование».
• Пятница, Декабрь 24th, 2021
23 декабря 2021 г. сотрудники ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора и.о. начальника отдела эпидемиологии Пичурина Н.Л. и стажер-исследователь Савина И.В. провели учебный семинар-совещание для руководителей отделений (структурных подразделений) инфекционного госпиталя ГБУ РО «РОКБ» для лечения COVID-19. Семинар «Омикрон. Особенности вируса и его распределения в мире» был организован в рамках оказания консультативно-методической помощи медицинским организациям области.
Читать полностью…
16 декабря 2021 г. на базе ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора состоялась научная конференция, в которой приняли участие молодые ученые. Читать полностью…
• Среда, Декабрь 15th, 2021
10 декабря 2021 г. сотрудники ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора и.о. начальника отдела эпидемиологии Пичурина Н.Л. и младший научный сотрудник отдела эпидемиологии Кононенко А.А. приняли участие в работе межрегиональной научно-практической конференции «Школа НАСКИ. ИСМП: проблемы и решения». Конференция организована «Национальной ассоциацией специалистов по контролю инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи» для врачей, участвующих в реализации мероприятий по обеспечению эпидемиологической безопасности в инфекционных госпиталях: эпидемиологов, инфекционистов, терапевтов и других. Читать полностью…
• Пятница, Декабрь 10th, 2021
08.12.2021 г. конкурсной комиссией ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора проведен конкурс на замещение вакантных должностей научных работников. В работе конкурсной комиссии приняли участие 10 из 10 членов конкурсной комиссии. Читать полностью…
Конкурс фотографий ко Дню народного единства «Мы вместе»• Пятница, Октябрь 29th, 2021
В ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора ко Дню народного единства состоялся конкурс фотографий «Мы вместе». В мероприятии приняли активное участие не только молодые ученые Ростовского-на-Дону противочумного института, но и специалисты других организаций, проходящие обучение в нашем институте.
• Среда, Октябрь 13th, 2021
5–6 октября 2021 г. в рамках реализации плана мероприятий Года науки и технологий на базе Иркутского научно-исследовательского противочумного института состоялась XV Межгосударственная научно-практическая конференция «Актуальные вопросы обеспечения эпидемиологического благополучия в трансграничных природных очагах чумы и других опасных инфекционных болезней» с участием сотрудников ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора. Читать полностью…
XV Межгосударственная научно-практическая конференция «Актуальные вопросы обеспечения эпидемиологического благополучия в трансграничных природных очагах чумы и других опасных инфекционных болезней»5–6 октября 2021 г. в рамках реализации плана мероприятий Года науки и технологий на базе Иркутского научно-исследовательского противочумного института состоялась XV Межгосударственная научно-практическая конференция «Актуальные вопросы обеспечения эпидемиологического благополучия в трансграничных природных очагах чумы и других опасных инфекционных болезней» с участием сотрудников ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора. Читать полностью…
Видео-селекторное совещание со специалистами лечебной сети на тему «Вопросы эпидемиологии, клиники, лабораторной диагностики, лечения и профилактики ГЛПС».• Пятница, Октябрь 01st, 2021
29 сентября 2021 года сотрудники ФКУЗ Ростовского-на-Дону противочумного института Пичурина Н.Л. и Сокиркина Е.Н. приняли участие в видео-селекторном совещании со специалистами лечебной сети на тему «Вопросы эпидемиологии, клиники, лабораторной диагностики, лечения и профилактики ГЛПС».
В мероприятии приняли участие более 50 медицинских организаций Ростовской области,
которым была представлена лекция, освятившая актуальные вопросы геморрагической лихорадки с почечным синдромом. Помимо теоретических аспектов проблемы, освещены особенности эпидемиологической ситуации по этой инфекции в Ростовской области, дифференциальной диагностики, особенно, в период эпидемии COVID-19, причины летальных исходов.
• Пятница, Сентябрь 24th, 2021
15-17 сентября 2021 г. состоялась XIII Всероссийская научно-практическая конференция молодых учёных и специалистов Роспотребнадзора «Современные проблемы эпидемиологии, микробиологии и гигиены». Читать полностью…
• Понедельник, Сентябрь 13th, 2021
11 сентября 2021 г. члены Совета молодых ученых ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора по приглашению студии старинного танца «Галантный век» приняли участие в «Первом фестивале купечества им. А.П. Чехова «В Городском саду», посвященном 272-ой годовщине со дня основания города Ростова-на-Дону, который проходил в парке им. Горького и на котором были представлены образы жителей и гостей города рубежа XIX-XX века. Читать полностью…
Межрегиональная научно-практическая конференция «Актуальные вопросы эпидемиологического надзора за инфекционными и паразитарными заболеваниями на юге России.• Понедельник, Сентябрь 13th, 2021
9 сентября 2021 г. состоялась межрегиональная научно-практическая конференция «Актуальные вопросы эпидемиологического надзора за инфекционными и паразитарными заболеваниями на юге России. Ермольевские чтения», посвященная памяти и заслугам выдающегося советского учёного-микробиолога и эпидемиолога, академика Зинаиды Виссарионовны Ермольевой. Читать полностью…
CovAnalyzer — программа для определения геновариантов SARS-CoV-2• Среда, Июль 14th, 2021
Предлагаемая программа предназначена для поиска мутаций в последовательностях штаммов SARS-CoV-2 с выравниванием на референсную последовательность и определения геновариантов вируса.
Отличительные особенности программы CovAnalyzer:
- Высокая скорость работы – за секунду анализируется около 3 геномов (около 30 кб)
- Простота запуска – программа запускается с помощью .sh скрипта
- Простота оценки результатов – данные анализа представляют собой файл в табличном формате, открываемый в любом редакторе.
Скачать
• Понедельник, Июль 12th, 2021
9 июля 2021 года молодые ученые ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора приняли участие в on-line семинаре-конференции «Совершенствование методов диагностики инфекционных болезней, анализа генома и протеома патогенных микроорганизмов». Читать полностью…
Цикл заседаний СМУ, посвященных анализу материалов научных работ по актуальным на сегодняшний день направлениям• Вторник, Июль 06th, 2021
Молодые ученые ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора и студенты ФГБОУ ВО РостГМУ Минздрава России, заключившие договор с институтом о целевом обучении, провели цикл заседаний СМУ, посвященных анализу материалов научных работ по актуальным на сегодняшний день направлениям: Читать полностью…
Конкурс фотографий «Моя Россия»• Среда, Июнь 16th, 2021
В ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора ко дню России состоялся конкурс фотографий «Моя Россия», в котором приняли участие молодые ученые института. Читать полностью…
Всероссийская научно-практическая конференция «Актуальные проблемы обеспечения биологической безопасности на Дальнем Востоке России»• Понедельник, Май 31st, 2021
27 мая 2021 г. на базе ФГБНУ «НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.П. Сомова» состоялась Всероссийская научно-практическая on-line конференция «Актуальные проблемы обеспечения биологической безопасности на Дальнем Востоке России», посвященная 80-летию образования Научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени Г.П. Сомова Роспотребнадзора. В рамках конференции проведены «Вторые Сомовские чтения», в которых приняли участие молодые ученые. Читать полностью…
2021 год – Год науки и технологий• Понедельник, Май 31st, 2021
В декабре 2020 года президент Российской Федерации В.В. Путин подписал Указ о проведении в 2021 году в России Года науки и технологий. Задача Года – привлечь талантливую молодежь в сферу науки и технологий, повысить вовлеченность профессионального сообщества в реализацию Стратегии научно-технологического развития Российской Федерации, а также сформировать у граждан нашей страны четкое представление о реализуемых сегодня государством и бизнесом инициативах в области науки и технологий. Работает официальный сайт Года науки и технологий, на котором размещается информация обо всех запланированных событиях. Большое внимание уделяется популяризации достижений отечественных ученых. Сотрудниками ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора в рамках проведения Года науки и технологий опубликованы в научных журналах не только оригинальные статьи (собственные исследования авторов), но и обзорные статьи: Читать полностью…
Семинар по вопросам профилактики природно-очаговых и особо опасных инфекций• Пятница, Май 28th, 2021
27 мая 2021 года на базе Министерства здравоохранения Ростовской области в режиме видеоконференции состоялся семинар медицинских работников лечебно-профилактических организаций области посвящённый вопросам профилактики инфекционных заболеваний и «сигнальным признакам» природно-очаговых, особо опасных болезней, требующих проведения мероприятий по санитарной охране территории, в работе которого приняли участие сотрудники ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Пичурина Н.Л. и Стенина С.И.
Читать полностью…
• Четверг, Май 20th, 2021
20 мая 2021 г. в ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора в рамках реализации мероприятий, приуроченных к Году науки и технологий, состоялся семинар «Гибридомная технология получения моноклональных антител для диагностики холеры», в котором приняли участие молодые ученые Ростовского-на-Дону противочумного института и студенты ФГБОУ ВО РостГМУ Минздрава России, заключившие договор с институтом о целевом обучении. Читать полностью…
IX Всероссийская научно-практическая конференция (on-line) «Микробиологические аспекты диагностики инфекционных заболеваний• Четверг, Май 20th, 2021
13 мая 2021 г. на базе ФГБОУ ВО «Ростовский государственный медицинский университет» Минздрава России состоялась IX Всероссийская научно-практическая конференция (on-line) «Микробиологические аспекты диагностики инфекционных заболеваний». Читать полностью…
«Есть такая профессия – Родину защищать»• Четверг, Май 13th, 2021
8 мая 2021 года члены Совета молодых ученых ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора в составе военно-исторического клуба «Казачья Слава» приняли участие в акции «Есть такая профессия – Родину защищать», которая состоялась в г. Азове в преддверии Дня Великой Победы. Стояли в парадном строю во время возложения цветов к памятнику морякам Азовской военной флотилии, почтили память участников Великой Отечественной войны, салютовали грядущему Дню Победы и продемонстрировали всем желающим деактивированные образцы вооружения времен Великой Отечественной войны.
История санитарной службы России
История санитарной службы России
История санитарной службы России
Врачебно-санитарное дело в России во времена своего зарождения в начале XIX века находилось под управлением Медицинского департамента Министерства полиции, переданного в 1826 году Министерству внутренних дел (МВД). В губерниях имелись подчиненные этому департаменту врачебные управления, осуществляющие врачеб но-полицейские задачи по предотвращению причин, служивших источником болезней населения, врачебно-хозяйственную деятельность по лечению больных путем устройства больниц и обеспечения их работы, а также судебно-медицинскую деятельность. Работа врачебных управлений регламентировалась «Уставом врачебным», в котором значились вопросы в области санитарного надзора, наблюдения за чистотой в городах и съестными припасами, издание правил и наставлений по соблюдению «народного здравия» в губернии, участие в обсуждении устройства новых фабрик и заводов в медицинском отношении, контроль за рабочими помещениями и жильем рабочих, пищей, напитками и пр.
1842-1915 гг. Создатель основополагающих принципов общественной гигиены и социально-гигиенического направления медицины.
Формирование гигиены как области научного знания произошло во второй половине XIX века. В это же время в соответствии с уставами 1863 и 1884 годов гигиена стала предметом преподавания.
В 1881 году Совет Московского университета пригласил читать
доцентский курс молодого, но уже известного своими руководствами Ф.Ф. Эрисмана. В 1-й же лекции 1 декабря 1882 года Ф.Ф. Эрисман изложил цели и задачи гигиены, сформулировал новую концепцию данной науки.
Важнейшими ее положениями были: «гигиена
есть наука об общественном здоровье»; «не каждый врач… может быть специалистом по гигиене, но каждый может и должен усвоить гигиенический способ мышления»; «умение устранять санитарные недуги общества… вернее спасает от болезни и смерти, нежели
все рецепты и лекарства вместе взятые»; «санитарное направление (профилактическое) в медицине одержит блестящую победу над чисто врачебными тенденциями»; «предупредительной медицине — гигиене — предстоит большое будущее».
Ф.Ф. Эрисман стремился
найти «те закономерности, которые управляют здоровьем общества». Для осуществления этих целей Ф.Ф. Эрисман создает гигиеническую лабораторию, в которой проходили практические занятия студентов.
Важной вехой в истории гигиены явилось классическое
исследование проведенное Ф.Ф. Эрисманом, Е.М. Дементьевым и А.В. Погожевым фабрично-заводских предприятий Московской губернии в 1879-85 годах. Результаты исследований были обобщены в 17 томах. Принципиальные положения гигиены и материалы проведенных
исследований были обобщены Ф.Ф. Эрисманом в трехтомном «Курсе гигиены» (1887-88) и «Кратком учебнике по гигиене» (1898).
Ф.Ф. Эрисман проявил себя в Московском университете как блестящий организатор. По его плану и под его руководством был построен
на Девичьем Поле Гигиенический институт (1890). В 1891 году при институте создана городская санитарная станция, которая анализировала пищевые продукты московских рынков.
Он способствовал рождению в недрах общей гигиены самостоятельных гигиенических
наук: гигиены умственного и физического труда, гигиены питания, школьной и коммунальной гигиены.
В 1861 г. МВД и Министерством финансов была издана инструкция по составлению
актов освидетельствования съестных припасов и напитков, установлен надзор за состоянием здоровья рабочих в частизаразных болезней и сифилиса. Низовыми штатными работниками губернских врачебных управлений были городские и уездные врачи, осуществляющие
судебно-медицинскую работу, борьбу с заразными болезнями, примитивный санитарный надзор и, конечно, занимавшиеся частной практикой, так как получали небольшое жалованье. В губернских городах эту работу выполняли городовые врачи, количество которых зависело
от числа полицейских участков города. Одним из видов их деятельности являлось осуществление санитарного надзора и противоэпидемической работы по потребностям того времени. Медицинский департамент МВД с марта 1865 г. стал выпускать журнал «Архив судебной
медицины и общественной гигиены», выходивший 4 раза в год, в котором сотрудничали многие городовые и уездные врачи.
В процессе деятельности российских земских учреждений и городских самоуправлений перед ними встал вопрос о необходимости со здания
независимой от Медицинского департамента МВД врачебно-санитарной организации. Так родилась земская и городская медицина , одним из элементов которой в ряде губерний и крупных городов стали общественные санитарные организации. Земские и городские общественные
санитарные организации были созданы не во всех земствах и городах. Поэтому санитарный надзор и противоэпидемическую работу во многих земствах и городах по-прежнему осуществляли родовые и уездные врачи Медицинского департамента МВД.
Городских
санитарных организаций не имели такие города России, как Брянск, Владикавказ, Вятка, Грозный, Калуга, Кинешма, Новгород, Петрозаводск, Псков, Сызрань, Уральск, Челябинск, Ярославль и др., где санитарный надзор продолжали осуществлять городовые врачи.
Моллесон Иван Иванович [22.2(6.3).1842, Иркутск, — 18.12.1920, Воронеж], русский санитарный врач, один из организаторов земской медицины. В 1865 окончил медицинский факультет Казанского университета. Работал в Вятской, Пермской, Саратовской, Тамбовской, Калужской губерниях. В 1872 утвержден первым земским санитарным врачом. Организовал (1873) в Шадринске первый в России врачебно-санитарный совет уездного земства. Инициатор и руководитель ряда губернских съездов земских врачей, активный участник Пироговских съездов. Разработал формы медицинской регистрации и отчётности; многие труды посвящены вопросам санитарной статистики, демографии, санитарной характеристике промыслов и производственной школьной гигиене и др.
Первая городская общественная санитарная организация в России возникла
в Москве ( 1866 г.) в составе 17 санитарных врачей – первая временная санитарная комиссия, а в 1884 г. – постоянная санитарная организация (4-я санитарная комиссия).
В Санкт-Петербурге в связи с угрозой эпидемии холеры в феврале 1867 г. Городской
думой была образована исполнительная городская санитарная комиссия из 6 человек (членов и санитарных попечителей) под председательством П.В. Жуковского и с участием врачей Е. В. Пеликана и Н. И. Розова (представителей Медицинского департамента).
До 1879 г. санитарный надзор в городе находился в ведении городовых врачей. В этом же году была организована Временная комиссия общественного здравия в связи с угрозой Вятлянской чумы. Эта комиссия продолжала работать и в последующие годы: 1879-1881
гг. – в связи с эпидемиями тифа и оспы, 1881-1883 гг. – с эпидемиями дифтерии и скарлатины. В 1881 г. в Санкт-Петербурге был составлен проект организации врачебно-санитарного надзора для борьбы с эпидемиями силами сверхштатных городовых врачей, а в
1884 г. в ведение Городской думы перешло врачебно-санитарное дело со сверхштатными городовыми врачами. В 1896 г. Городская дума создала постоянную санитарную комиссию, в составе которой с 1889 г. работали 40 городских санитарных врачей и 20 торгово-санитарных
врачей. В 1891 г. была открыта городская лаборатория со штатом 3-х врачей и 5 химиков под руководством профессора А. С. Пржбытека. В 1902 г. организовано санитарно-эпидемиологическое бюро с 3-мя врачами во главе со старшим городским санитарным врачом.
Первым старшим городским санитарным врачом г. Санкт-Петербурга был В.И. Вержейский, а после 1909 г. им стал Н.А. Иванов. В 1914 г. санитарно-эпидемиологическое бюро было введено в состав городской постоянной санитарной комиссии. Следует отметить, что
санитарные врачи наряду с другими работами проводили обследования фабрик и заводов.
Наряду с прообразами органов санитарно-эпидемиологической службы в Москве и Санкт-Петербурге, происходило формирование подобных организаций и в других городах
России.
В Саратове в 1860 г. было создано общество «Беседы Саратовских врачей», переименованное в 1898 г. в физико-медицинское общество. В 1875 г. это общество организовало медико-статистические исследования и стало деятельным советником Городской
думы по борьбе с эпидемиями. В 1877 г. из состава «Беседы Саратовских врачей» выделилась группа врачей (А.А. Кноре, И. И. Шмидт, И. И. Ельнинский и др.), образовавшая «Саратовское санитарное общество», первое в России, занявшееся разработкой вопросов
в области гигиены и организации санитарных учреждений. В 1885 г. для Городской думы был составлен план борьбы с эпидемиями и поставлен вопрос об учреждении постоянного санитарного надзора. В 1891 г. П.Д. Суходеевым и И.Н. Матвеевым (старейший санитарный
врач города, проработавший до 1933 г.) была составлена программа деятельности санитарных врачей одобренная Почетным членом общества И.И. Моллесоном. В Саратове работало два санитарных врача, в 1894 г. учреждена должность училищного врача, а в 1904 г.
приглашено еще два санитарных врача и при Городской управе образовано санитарное бюро.
В г. Перми в 1872 г. положено начало первой земской санитарной организации в России. В губернском земстве введена должность губернского санитарного врача,
на которую был приглашен опытный земский врач Иван Иванович Моллесон, ставший одним из идеологов профилактического направления в земской медицине. Работе в земствах Пермской губернии И.И. Моллесон отдал почти 20 лет и оставил о себе неизгладимую
память. В Перми в 1886 г. учреждена губернская земская санитарная станция – первая в России. Однако она не смогла развернуть серьезных исследований, и через три года была закрыта. В 1890 г. создано губернское санитарное бюро. В 1898 г. в Перми организована
земская бактериологическая лаборатория, преобразованная в 1912 г. в бактериологический институт. В 1908 г. в уездных земствах введены должности уездных санитарных врачей с главным разделом деятельности – санитарно-противоэпидемическая работа.
В Нижнем Новгороде Городская дума в октябре 1887 г. создала при управе санитарную комиссию из 8 гласных думы и пригласила на должность городского санитарного врача П.П. Розанова. Учреждены инструкции санитарной комиссии и санитарным попечителям, а также правила по санитарному надзору за учебными и другими заведениями, проведен анализ статистических сведений о естественном движении населения за 1868-1888 гг., начал работать второй городской санитарный врач, с 1897 г. – два санитарных надзирателя и с 1902 г. – школьно-санитарный врач. В 1895 г. В.И. Косаревым открыта бактериологическая лаборатория. Химические анализы съестных припасов в городе проводились с 1892 г., а в 1905 г. создана санитарная станция для анализов воды и съестных припасов. В деятельности санитарной организации Нижнего Новгорода в разное время принимали активное участие Н.А. Семашко, М.Ф. Владимирский, А.Н. Сысин, В.М. Фивейский и др.
СЕМАШКО Николай Александрович (1874-1949), государственный деятель, один из организаторов системы здравоохранения в СССР, академик АМН СССР (1944) и д.ч. АПН РСФСР (1945). В 1918-30 первый нарком здравоохранения РСФСР. Создал (1921) кафедру социальной гигиены в Московском университете (профессор и зав. кафедрой до 1929). Один из организаторов массовой пропаганды гигиенических и естественно-научных знаний среди педагогов, родителей и учащихся. В 1945-49 директор Института школьной гигиены АПН (ныне Институт возрастной физиологии РАО) и одновременно (1947-49) — Института организации здравоохранения и истории медицины АМН. Был инициатором создания Центральной медицинской библиотеки (1918), Дома учёных (1922) в Москве. В 1927-36 гл. редактор Большой медицинской энциклопедии.
Во второй половине XIX века санитарные организации при городских думах были образованы в Таганроге (1876), Воронеже (1879), Иркутске (1882), Астрахани (1883), Туле (1887), Екатеринбурге и Севастополе (1888), Екатеринодаре (Краснодаре) и Оренбурге (1892), Самаре (1895), Томске (1897) и позднее еще в 37 городах России.
Деятельность санитарно-эпидемиологических организаций, а позже системы государственного санитарного надзора в России определялись специальными постановлениями правительства. Организационные формы и методы их работы изменялись и совершенствовались в соответствии
с развитием отраслей промышленности, естественных наук, прежде всего, гигиены, эпидемиологии и микробиологии.
С первых лет существования Советской России, несмотря на огромные экономические трудности, выделялись значительные средства на благоустройство
городов, санитарно-технические и оздоровительные мероприятия в промышленности. Восстановление хозяйства страны после гражданской войны требовало создания четкой системы санитарно-эпидемиологических учреждений и установления системы государственного
санитарного надзора. Одновременно с формированием санитарных органов в отдельных районах страны стали предприниматься попытки создания сети санэпидслужбы.
15 сентября 1922 г. издан декрет Совета Народных Комиссаров РСФСР «О санитарных органах
республики». В СССР первая санэпидстанция была создана по инициативе Гомельского санэпидотдела (зав. – К.Ю. Каганович) – 29 октября 1922 г. Это прообраз единого комплексного санитарно-эпидемиологического учреждения, в котором были представлены все основные
элементы санитарной и противоэпидемической работы, включая лабораторию.
МАРЗЕЕВ Александр Никитович (1883-1956)
— академик АМН СССР (1944), доктор медицинских наук (1935), профессор (1940), заслуженный деятель науки УССР (1935). В 1911 г. окончил медицинский факультет Московского университета, совершенствовал знания в лаборатории В.Г. Хлопина. В 1922-1934 гг. заведовал санитарно-эпидемиологическим отделом Наркомздрава УССР. На протяжении 10 лет (1931-1941) возглавлял созданный по его инициативе Украинский (Харьков) научно-исследовательский институт коммунальной гигиены, одновременно заведовал кафедрой гигиены Украинского (Харьков) института усовершенствования врачей (1930-1941) и кафедрой коммунальной гигиены Харьковского медицинского института (1934-1941). В 1941-1944 гг. – научный руководитель и заведующий санитарно-гигиеническим отделом Казахского института эпидемиологии и микробиологии, заведующий кафедрой эпидемиологии Алма-Атинского медицинского института. С 1944 г. по 1956 г. – директор Киевского научно-исследовательского института коммунальной гигиены, заведующий кафедрой коммунальной гигиены Киевского государственного института усовершенствования врачей (до 1946 г.) и Киевского медицинского института (до 1956 г.). Инициатор создания и организатор в бывшем СССР первых санитарно-эпидемиологических станций. Первым в бывшем СССР начал изучения загрязнения атмосферного воздуха. Проведенное ним изучение водохранилищ Донбасса было положено в основу
Первый закон «О санитарных органах республики» был принят Совнаркомом РСФСР 19 февраля 1927 г. и положение о них – 8 октября 1927 г., согласно которым значительно расширялись функции и права санитарных органов, устанавливались дифференцированные нормативы обеспечения районов и городов санитарными кадрами в зависимости от их промышленного значения, бактериологическими лабораториями и дезинфекционными станциями. Важнейшим обязательным элементом работы санитарных органов Российской Федерации стал предупредительный санитарный надзор на всех этапах промышленного и жилищно-гражданского строительства. В августе 1929 г. Совнарком РСФСР заслушал вопрос «О санитарном состоянии республики». В принятом постановлении констатировалось снижение общей и детской смертности и заболеваемости рядом эпидемических болезней. Однако отмечалось и низкое санитарное состояние республики. В числе причин была недостаточная согласованность в работе органов здравоохранения, неудовлетворительная постановка изучения санитарного состояния отдельных районов, в особенности промышленных. В 1931 г. Совнарком РСФСР утвердил положение «О Санитарном Совете при Народном комиссариате здравоохранения РСФСР». В состав Совета входили представители профсоюзов, а Наркомтяжпрома, Наркомлегпрома, Наркомлеса, Наркомзема, Наркомсовхозов, Наркомснаба и других организаций. 20-26 мая 1932 г. на созданной Госпланом СССР Всесоюзной конференции по планированию здравоохранения и рабочего отдыха на основании доклада А.Н. Сысина и А.Н. Марзеева принято решение о повсеместной организации санитарно-эпидемиологических станций, как самостоятельных постоянно действующих учреждений санэпидслужбы, состоящих на государственном бюджете. Широкое развитие они получили в последующие годы. 23 декабря 1933 г. ЦИК и СНК РСФСР утвердили постановление «Об организации Государственной санитарной инспекции РСФСР» (ГСИ). Этим был достигнут эффективный санитарно-эпидемиологический контроль за организацией и проведением санитарно-гигиенических и противоэпидемических мероприятий. В 1935 г. было принято постановление о создании Всесоюзной Государственной санитарной инспекции (ВГСИ) при Совете Народных Комиссаров Союза ССР. Первоначально определенные цели для ГСИ в виде улучшения санитарного обслуживания населения и полного охвата санитарным надзором всех отраслей производства для ВГСИ приобрели характер планового текущего и предупредительного санитарного надзора. На ВГСИ возлагались объединение и руководство работой органов ГСИ на всей территории СССР, непосредственное осуществление санитарного надзора за предприятиями пищевой промышленности, общественного питания и торговли пищевыми продуктами. ВГСИ имела своих Уполномоченных в крупных промышленных районах и важнейших пунктах пищевой, рыбной и консервной промышленности. Впервые предусматривалось, что при ВГСИ будут состоять научно-исследовательские учреждения, занимающиеся вопросами санитарии и эпидемиологии. Во главе ВГСИ был поставлен Г.Н. Каминский (1895-1938). ВГСИ, выполнив возложенные на нее обязанности, в 1936 г. вошла в состав Народного Комиссариата здравоохранения СССР. В 1947 г. выявились существенные недостатки в организации санэпидслужбы в виде разобщенности в работе органов ГСИ и санитарно-эпидемиологической службы, проведении предупредительного и текущего санитарного надзора. На XIII съезде гигиенистов, эпидемиологов, микробиологов и инфекционистов было принято решение о целесообразности объединения функций предупредительного и текущего санитарного надзора. Практика последующих лет подтвердила правильность такого объединения в период мощного подъема и развития всех отраслей промышленности, интенсивного градостроительства и связанных с ними санитарно-гигиенических и эпидемиологических мероприятий по обслуживанию населения и целенаправленному использованию сил и средств санэпидслужбы. Положение «О государственном санитарном надзоре в СССР» утвержденное постановлением Совета Министров СССР 29 октября 1963 г. № 1107 позволило осуществить значительные комплексные мероприятия по дальнейшему расширению и укреплению всей системы санэпидслужбы в республиках, областях, краях, крупных городах и сельской местности России.
Последующие правовые акты санитарного законодательства соответствовали этапам развития санитарной службы, расширению и деятельности в области санитарного надзора ипротивоэпидемических мероприятий. Основой дальнейшего укрепления санэпидслужбы явилось постановление ЦК КПСС и Совета Министров СССР от 15 декабря 1968 г. «О мерах по дальнейшему улучшению здравоохранения и развитию медицинской науки в стране».
Положение о государственном санитарном надзоре в СССР 1973 г. потребовало разработки новых прогрессивных форм деятельности, дальнейшее совершенствование управления, направленное на повышение качества и эффективности работы. На практике оправдала себя
централизация управления и финансирования санэпидстанций. Эти организации на местах стали самостоятельно заниматься подбором кадров, оформлять в установленном порядке назначение главных врачей и специалистов, что привело к улучшению комплектования штатов
санэпидстанций кадрами.
С 19 апреля 1991 года открыта новая страница в истории санитарно-эпидемиологической службы России. Впервые за годы ее существования был принят Закон РФ «О санитарно-эпидемиологическом благополучии населения» (Постановление
Верховного Совета РСФСР 09.04.91 г. № 1035-1), который внес принципиальные изменения в содержание государственного санитарно-эпидемиологического надзора и обеспечил законодательную основу регулирования общественных отношений в области санитарно-эпидемиологического
благополучия. Этим законом служба была выведена из ведомственного подчинения, переведена на уровень централизованного управления и финансирования из федерального бюджета.
В 1999 году был принят новый Федеральный закон «О санитарно-эпидемиологическом
благополучии населения», который не только уточнил редакцию основных положений закона 1991 года, но и включил в себя ряд принципиальных положений, которые ранее регулировались подзаконными актами.
С 16 марта 2005 г. в составе санитарно-эпидемиологической службы Российской Федерации произошли коренные перемены, в результате которых в стране появилась новая организация – Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (Роспотребнадзор). Первым руководителем службы – Главным государственным санитарным врачом Российской Федерации стал Г.Г. Онищенко.
В сложных условиях социально-экономических преобразований в стране Федеральной службой Роспотребнадзора обеспечивается контроль за санитарно-эпидемиологической обстановкой, удается сдерживать ее ухудшение, добиваться снижения общей и инфекционной заболеваемости населения и смертности от инфекционных болезней, предотвращать распространение особо опасных инфекций и возникновение сотен случаев заболеваний и отравлений людей.
(PDF) [Improvment of the methods of microbiological control of hospital environment]
пробы, обуславливает достаточную результативность метода
смывов с помощью тампонов без применения нейтрализаторов.
При изучении качества стерилизации контролю стерильности
были подвергнуты ИМН, а также кожа рук персонала
операционных бригад и операционных полей больных.
За 1993-2008 года выявлено 697 нестерильных проб, что
составило 1,1% от общего числа исследований. При этом
большинство нестерильных проб приходилось на смывы с кожи рук
персонала и операционных полей больных. Это можно объяснить
тем, что кожа, как биотоп организма, не может быть подвергнута
стерилизации в полном смысле этого слова.
Внедрение методов промышленной стерилизации,
подразумевающих одновременную обработку тысяч изделий,
повлекло изменения в подходе к определению понятия
стерильность. Новые нормативные документы, регламентирующие
стерилизацию изделий медицинского назначения в лечебных
учреждениях [ГОСТ Р ИСО 13683-2000] ориентируют на
необходимость, прежде всего, валидации процесса стерилизации, а
не на контроль стерильности изделий.
Согласно современным представлениям о динамике гибели
микроорганизмов под действием неблагоприятных факторов,
невозможно достигнуть полного обеспложивания объектов
[Мунблит В.Я., Тальрозе В.Л., Трофимов В.И., 1985], и потому
стерилизация является понятием вероятностным. В связи с этим,
для обозначения степени надежности стерилизации в зарубежной
практике было введено понятие уровень гарантированной
стерильности – Sterility assurance level (SAL) [Gregg A., Mosley
G.A., 2008]. Качество стерилизации изделий медицинского
назначения принято оценивать как вероятность и сторонники этого
направления указывают, на невозможность проверки обеспечения
заданного уровня стерильности, SAL, при значениях его меньше 10-
2 (то есть 10-3,- 10-6) из-за необходимости использовать большое
количество образцов. Поэтому, испытание на стерильность даже
серийно выпускаемой продукции подвергнутой радиационной
стерилизации не предусмотрено [ГОСТ Р ИСО 11137-2000].
Тем не менее, действуют и ранее утвержденные документы,
регламентирующие проведение контроля стерильности ИМН [МУ-
287-113, 1998]. Очевидно, что невозможно определить, достигнут
ли требуемый уровень SAL при стерилизации конкретной партии
14
Сезонные и пространственные вариации микробной активности при различном филогенетическом разрешении на границе раздела подземных и поверхностных вод
Мы исследовали сезонные и пространственные вариации активности и плотности метаболически активного микробного сообщества in situ (AIMC) на границе раздела подземных и поверхностных вод (GSI) свалки, подвергшейся воздействию фильтрата. Серия ловушек AIMC была разработана и внедрена для отбора проб AIMC и исследований микробной активности и плотности.Измерения проводились не только на уровне бактериального домена, но и на уровне альфапротеобактериального порядка Rhizobiales и гаммапротеобактериального рода Pseudomonas, оба из которых включали большое количество железоокисляющих бактерий, как было выявлено в предыдущем анализе. В ловушках AIMC была измерена неизменно более высокая микробная активность с меньшими колебаниями по глубине, чем в окружающих отложениях. Возмущение паводков, по-видимому, контролировало распределение активности AIMC при постепенном повышении GSI.Самая высокая активность AIMC обычно наблюдалась в местах, ближайших к границе свободной поверхностной воды, за исключением сухого сезона, когда микробная активность была одинаковой по всему GSI. Была сконструирована библиотека клонов генов AIMC 16S рРНК, которая подтвердила преобладающую роль целевой альфа-протеобактериальной группы в активности и составе AIMC. Этот таксон составлял от 2% до 14% всех бактерий с аналогичными профилями распределения активности. Группа Pseudomonas занимала только 0.1‰-0,5‰ от общей бактериальной плотности, но его активность была в 27 раз выше, чем в среднем по бактериям. Из последовательностей 16S рРНК в библиотеке клонов AIMC 7,5% были филогенетически связаны с предполагаемым IOB, что подтверждает возникновение и сохранение активного микробного окисления железа в изученной богатой железом экосистеме GSI.
Ключевые слова: деятельность; активность; бактерии окислителя ле Фер; communautés microbiennes метаболизирует активы in situ; граница раздела грунтовые воды – поверхностные воды; интерфейс entre l’eau de surface et l’eau souterine; железоокисляющие бактерии; метаболически активное in situ микробное сообщество; сезонные колебания; пространственная изменчивость; вариация сэзоньер; пространственное варьирование.
Разработка концепции Института программного обеспечения для геномики (GSI) | Экологический микробиом
Концептуализация GSI для сообщества медико-биологических наук потребует новой глубины сотрудничества между биологами, учеными-вычислителями и учеными-компьютерщиками. Без существенного подхода совместного проектирования инструменты, форматы данных, API и другие критические аспекты и компоненты киберинфраструктуры могут быть оптимизированы для технологий или для общих вариантов использования, но не смогут стать катализатором действительно новой науки.Точно так же отсутствие достаточного технического сотрудничества между группами медико-биологических наук привело к тому, что многие дублирующие друг друга усилия не имеют критической массы, необходимой для решения проблем масштаба и сложности, необходимых для продвижения в этой области. В настоящее время возможность перемещать данные из одного сообщества в другое, объединять инструменты в сложные рабочие процессы или применять инструменты в нескольких базах данных (где это вообще возможно) ограничивается объемами данных, которые на порядок меньше.
Разорвать этот порочный круг, таким образом, должно начаться с усилий по концептуализации, которые могут работать с биологическим сообществом, чтобы определить и сосредоточиться на наборе общих проблем и возможностей, достижимых с помощью коллективных, скоординированных усилий и в то же время предлагающих революционные достижения внутри и между сообществами наук о жизни.
The Investigation/Study/Assay Сообщество ISA commons [10,12] иллюстрирует осуществимость этого подхода. ISA — это растущая образцовая экосистема решений для хранения и обмена данными, построенная на платформе отслеживания метаданных ISA. Он предоставляет инструменты и ресурсы для гармонизации описаний метаданных разрозненных наборов данных, позволяя объединять данные посредством невидимого соответствия стандартам сообщества, описанным в каталоге BioSharing [24]. Эти совместные группы, по сути, находятся на пути к созданию общих данных, обслуживающих все более разнообразный набор областей, включая здоровье окружающей среды, экологическую геномику, метаболомику, (мета)геномику, протеомику, открытие стволовых клеток, системную биологию, транскриптомику, токсикогеномику. и сообщества, работающие над характеристикой структур нуклеиновых кислот и созданием библиотеки клеточных сигнатур.ISA Commons иллюстрирует потенциал синергетического подхода и горизонтальной интеграции, которая выходит за рамки отдельных областей наук о жизни и сообществ, ориентированных на анализы или технологии.
BioSharing работает на глобальном уровне для создания стабильных связей, особенно между журналами, спонсорами, реализации политики обмена данными и хорошо организованных усилий по стандартизации в области биологических наук. Его цель состоит в том, чтобы (i) устранить дублирование усилий, которые препятствуют более широкому внедрению стандартов и мешают созданию инструментов, соответствующих стандартам, и (ii) ускорить создание интегрированной основанной на стандартах структуры для сбора и обмена высокопроизводительных данных геномики и функциональной геномной биологии.Интернет-каталог BioSharing — это «универсальный магазин» для тех, кто ищет документы по политике обмена данными и информацию о стандартах и технологиях, которые их поддерживают. Он предоставляет основную информацию о хорошо продуманных усилиях по стандартизации, инициируемых сообществом, а также ссылки на их стандарты, документацию, учебные материалы и контактные данные.
Биология выиграла от беспрецедентного роста возможностей генерации последовательностей, который превосходит даже закон Мура, который гласит, что скорость обработки вычислительных технологий удваивается каждые 18 месяцев [13].Хотя эти данные представляют собой огромные возможности для сообщества, их быстрое появление оставило существенные пробелы в культуре данных и практике в биологии. Эти пробелы включают инфраструктуру для управления данными, повторного использования и обмена. Более того, быстрое изменение стоимости данных секвенирования, а также алгоритмическая сложность анализа сместили затраты на анализ, а не на производство данных, что сделало результаты анализа наиболее ценными данными, которыми располагает сообщество. Хотя GSC добился определенного прогресса в некоторых из этих областей, таких как метаданные для повторного использования и обмен результатами вычислений [19], эта область остается зарождающейся, но критически важной [9].
Рост объема данных о секвенировании стал результатом сочетания снижения затрат и широкого внедрения технологий секвенирования нового поколения. Эти изменения привели к крупномасштабной демократизации производства данных о последовательностях, когда все большая доля производства данных происходит в умеренном масштабе в сообществе. Стало очевидным, что при таком режиме производства данных монолитные архивы неустойчивы. Кроме того, рост данных привел к серьезным проблемам анализа для сообщества.Ресурсы, предоставляющие сообществу масштабируемые аналитические возможности, стали де-факто информационными центрами для высококачественных данных. В качестве примера этих двух наблюдений сервер RAST [14], который является «частным» рабочим местом для анализа геномных данных сообщества, содержит около 11 000 новых бактериальных геномов. Эти геномы, хотя и не являются общедоступными, значительно превосходят по численности те, которые доступны в архиве GenBank. Это организационное наследие восходит к временам, когда секвенирование было дорогостоящим.
Однако все приведенные выше комментарии лишь подчеркивают проблемы с обработкой «сырых» данных последовательности.Поскольку секвенирование становится дешевле в 10 раз каждый год [15], сообществу необходимо установить способы обмена результатами вычислений, а также повысить эффективность используемых алгоритмов и рабочих процессов. Разрешив совместное использование результатов между группами, сообщество может сократить общее использование вычислений, просто загрузив уже выполненный анализ. Это поднимает ряд технических проблем, включая идентификацию набора данных, передачу данных, отслеживание происхождения и т. д.
Простые данные и обмен результатами, однако, не могут заменить постоянные усилия по увеличению числа групп и отдельных исследователей, способных создавать модели и алгоритмы для анализа и создания данных. Сообщество ограничено в «творчестве» в той же мере, в какой оно в настоящее время ограничено в анализе. Более легкий доступ для исследователей из широкого круга учреждений позволит им привлечь больше специалистов для процесса предоставления более информативных анализов, более доступных в вычислительном отношении анализов и более качественных моделей экосистем.
Одним из интересных побочных эффектов создания общей распределенной экосистемы данных, обеспечивающей легкий доступ к данным и возможность обмена данными между центрами, станет ослабление существующих хранилищ данных. Однако эти существующие системы, такие как MG-RAST [11] и IMG/M [16], разрабатывались изолированно и в настоящее время пытаются создавать обмениваемые продукты данных. Однако двух недостаточно. Объединение сообщества для создания GSI ускорит эту трансформацию и позволит форматировать обмен в соответствии с возросшей доступностью данных.Продукты данных, которыми можно поделиться сегодня, например, в метагеномика — это просто результат платформ секвенирования. Усилия группы M5 Консорциума геномных стандартов [17], а именно «формат метагеномной передачи», были сосредоточены на облегчении обмена данными с контролем качества между конвейерами аннотаций (например, MG-RAST, IMG/M, CAMERA и т. д.) экономия сотен тысяч часов вычислений на этих объектах.
Поток данных растет, чему способствует увеличение количества и размера наборов биологических данных; однако вычислительные бюджеты, доступные для биологических исследований, не растут, чтобы соответствовать этим изменениям.Разрабатываемые усилия изолированы и не обладают функциональной совместимостью, необходимой более широкому сообществу. GSI будет координировать эти изолированные усилия, чтобы облегчить интерактивность, которая позволит сообществу обмениваться наборами данных более высокого уровня, например. модели экосистем вместо «сырых» последовательностей. Но для того, чтобы это работало, все участники должны доверять передаваемым продуктам данных, иметь возможность отслеживать происхождение и иметь доступ к уровню анализа данных, который они хотят включить для повторного анализа.Благодаря этому мандату GSI создаст сообщество, основанное на доверии.
| Название | Последнее изменение | Размер | Описание | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| | |||||||||||||
| Родитель Каталог | — | ||||||||||||
| 2018-09-07 12:29 | 338K | COAS BA Communication AY 2016-2017 Оценка Cycle.pdf | 2018-09-07 12:29 | 550K | |||||||||
| COAS BA Английский Оценка.PDF | 2018-09-07 12:29 | 425K | |||||||||||
| COAS BA в либеральных артсх | 2018-09-07 12:29 | 526K | |||||||||||
| Оценка COAS BFA.PDF | 2018-09-07 12:29 | 332K | COAS BM Оценка музыки.PDF | 2018-09-07 12:29 | 568K | ||||||||
| COA BS Применяемая микробиология оценка .PDF | 2018-09-07 12:29 | 296K | COA BS BS Biology resessment.PDF | 2018-09-07 12:29 | 326K | ||||||||
| COAS Оценка бакалавра по математике.PDF | 2018-09-07 12:29 | 328K | COAS BS Физические науки Оценка.PDF | 2018-09-07 12:29 | 306K | ||||||||
| CoA Bachelor прикладные науки в ресурс Mangement.PDF | 2018-09-07 12:29 | 507K | |||||||||||
| COA COAS COUS Оценка уголовного права .PDF | 2018-09-07 12:29 | 610k | |||||||||||
| COAS History BS Assessment.PDF | 2018-09-07 12:29 | 396K | Coas Homeland Security GSI Оценка.PDF | 2018-09-07 12:29 | 476K | ||||||||
| Coas Homeland Security MA оценка.PDF | 2018-09-07 12:29 | 656K | |||||||||||
| Liberal Arts LSC BA.PDF | 2018-09-07 12:29 | 366K | |||||||||||
| COAS MA Художественная оценка.PDF | 2018-09-07 12:29 | 299k | Coas Ma English Esservment.PDF | 2018-09-07 12:29 | 459K | ||||||||
| CoA Магистр музыкальной оценки.PDF | 2018-09-07 12:29 | 339K | Coas Theatre и танцевальная оценка.PDF | 2018-09-07 12:29 | 325K | ||||||||
| COAS UPSA BS Оценка.PDF | 2018-09-07 12:29 | 535K | |||||||||||
| | |||||||||||||
| Ребекка Монтес Советник учителей Чавеса Ребекка родилась и выросла в восточной части Хьюстона, штат Техас.Она училась в колледже в Хантсвилле, штат Техас, где получила степень бакалавра и магистра химии в Государственном университете Сэма Хьюстона. После получения степени магистра Ребекка начала преподавать в средней школе Чавеса, где она преподает почти три года и в настоящее время является руководителем группы по химии. Ребекка преподает три уровня химии в старшей школе, включая химию на уровне, химию до AP и химию AP. Кроме того, она также преподает общую химию в Хьюстонском муниципальном колледже. |
| Уилмер Наранхо Советник учителей Чавеса Уилмер гордится тем, что окончил Университет Хьюстона в центре города со степенью бакалавра микробиологии и дополнительным химическим образованием. В настоящее время он преподает биологию в средней школе Чавеса. Он страстно желает обучать студентов и вдохновлять их на раскрытие своего полного потенциала. Преданные учителя поощряли его поступать в колледж. И теперь он идет по их стопам, помогая своим ученикам понять, что они тоже могут достичь своих целей. |
| Эрин Русс Консультант учителей Чавеса Эрин — учитель экологии в старшей школе Чавеса. Это ее третий год преподавания в Чавесе. Она переехала в Хьюстон после того, как в 2012 году окончила Техасский университет в Остине по специальности «биология» и получила сертификат преподавателя естественных наук в средней школе, хотя она родом из Сан-Антонио, штат Техас. С тех пор, как Эрин была маленькой девочкой, она знала, что хочет быть учителем, и на протяжении всей школы наука всегда была ее любимым предметом.Только во время стажировки в колледже она поняла, что ей не нужно выбирать между наукой и преподаванием, и решила подать заявку на участие в программе UTeach, чтобы объединить две свои страсти! Эрин стала наставником учителей инициативы Girls STEM, чтобы строить отношения с девочками из Чавеса, которые показали большой потенциал и интерес к науке. Надеемся, работая с этой программой, она сможет помочь этим девочкам развить более глубокую страсть к науке, образованию и желание учиться всю жизнь! |
| Ким Гонсалес Выпускник, аспирант, наставник Red Group Ким из района Сан-Антонио.Она поступила в Райс после окончания Техасского университета A&M. Она специализировалась на генетике и второстепенной специальности на химии и закончила Cum Laude на семестр раньше. В настоящее время она является научным сотрудником NSF и имеет докторскую степень. кандидат кафедры бионаук Райс. Она хочет оказать влияние на свое сообщество и поощрять молодых женщин и латиноамериканцев делать карьеру в области STEM. Ей нравится работать с девочками в Инициативе IBB Girls STEM, потому что она хочет продемонстрировать, что женщины могут преуспеть в научной карьере.Она любит не только науку, но и спорт и постоянно поддерживает своих «Эгги», «Шпор» и техасцев. Она большой фанатик SNL и может дословно процитировать почти любую пародию. |
| Эрин О’Брайен Выпускник Наставник, Red Group Эрин родилась в Сан-Антонио, штат Техас, и является старшей из четырех сестер. Она окончила Техасский университет A&M по двум специальностям: биохимия и генетика, а также дополнительная специальность по математике.После окончания A&M Эрин поступила в докторантуру биохимии и клеточной биологии. в Университете Райса и в настоящее время является научным сотрудником NSF. Ее дипломная работа связана с разработкой инструментов синтетической биологии для создания бактерий, способных делать классные вещи. Она увлечена поддержкой женщин в STEM, от средней школы до аспирантуры. Эти усилия включают создание годовой программы Университета Райса «Женщины в науке и технике» (RUWiSE) для студентов и аспирантов, наставничество в рамках программ IBB и создание программ ученичества STEM, таких как генная инженерия и наука о беге, для учащихся шестого класса в Citizen Schools. .Ее самая значимая программа — Инициатива STEM для девочек. Она считает, что с помощью этой программы они развивают современных женщин в науке. В свободное время Эрин увлекается рыбалкой на байдарках, бегом на длинные дистанции, футболом Эгги и музыкальными фестивалями на открытом воздухе. |
| Аниша Перес Выпускник Наставник, Red Group Аниша родилась и выросла в красивом Нью-Джерси. |