Рнк энтеровирус что это: Enterovirus, РНК [ПЦР]

Содержание

ПЦР-ДИАГНОСТИКА ЭНТЕРОВИРУСА (КАЧЕСТВЕННО) 

22. Клиническая лабораторная диагностика
22.01 Общий (клинический) анализ крови 400
22.02 Общий (клинический) анализ крови развернутый (5-diff) 500
22.02.1 Общий (клинический) анализ крови развернутый + микроскопия (5-diff) 700
22.03 Определение основных групп крови (А,В,0) и резус -принадлежности 400
22.04 Аллоиммунные антитела (включая антитела к Rh-антигену) 400
22.05 Общий (клинический анализ крови развернутый (5-diff) + подсчет числа тромбоцитов (по Фонио) 600
22.06 Длительность кровотечения по Дьюку 100
22.07 Свертываемость крови по Сухареву 100
22.08 Общий (клинический) анализ мочи 300
22.09 Общий анализ мочи (без микроскопии осадка) 250
22.09.1 Анализ мочи по Зимницкому 700
22.09.2 Трехстаканная проба мочи 600
22.10 Анализ мочи по Нечипоренко 200
22.11 Анализ эякулята с фоторегистрацией и MAR-тестом (Спермограмма) 1 800
22.13 Антиспермальные антитела IgG в сперме (прямой MAR-тест) 800
22.14 Определение фрагментации ДНК сперматозоидов 5 400
22. 15 Посткоитальный тест 500
22.16 Микроскопическое исследование осадка секрета простаты
300
22.18 Микроскопическое исследование на грибковые заболевания (кожа, ногти, волосы) 300
22.19 Микроскопическое исследование на демодекоз 300
22.19.1 Микроскопическое исследование соскоба пораженной кожи (выявление чесоточного клеща/ Sarcoptes scabiei) 300
22.20 Соскоб урогенитальный на флору 350
22.22 Системная красная волчанка. Определение LE-клеток (микроскопия) 400
22.23 Цитологическое исследование биоматериала 500
22.24 Цитологическое исследование соскоба шейки матки и цервикального канала 500
22.25 Цитологическое исследование пунктата молочной железы (1 образование) 1 000
22.26 Цитологическое исследование отделяемого молочных желез (мазок-отпечаток) 500
22.27 Цитологическое исследование пунктата молочной железы (2 и более образований) 3 000
22.28 Гистологическое исследование (1 элемент) 1 400
22.29 Исследование на уреамикоплазмы с определением чувствительности к антибиотикам 1 550
22.29.1 Исследование на уреаплазму (Ureaplasma urealyticum) с определением чувствительности к антибиотикам 750
22. 29.2 Исследование на микоплазму (Mycoplasma hominis) с определением чувствительности к антибиотикам 750
22.30 Бактериологическое исследование на микрофлору 1 150
22.31 Бактериологическое исследование отделяемого половых органов 1 150
22.32
Бактериологическое исследование мочи 1 150
22.33 Соскоб со слизистой носа на эозинофилы (нозограмма) 200
22.34 Соскоб на яйца гельминтов/энтеробиоз 300
22.35 Исследование кала на яйца гельминтов и простейшие 350
22.36 Копрологическое исследование 1 000
22.37 Бактериологическое исследование секрета простаты/эякулята с определением чувствительности к антимикробным препаратам 2 560
22.38 Посев отделяемого из уха на микрофлору, определение чувствительности к антимикробным препаратам и бактериофагам (Eye Culture, Routine. Bacteria Identification. Antibiotic Susceptibility and Bacteriophage Efficiency testing) 1 600
22.39 Исследование уровня ретикулоцитов в крови 195
22.40 Исследование уровня эозинофильного катионного белка в крови 675
23. ПЦР-диагностика показать
23.01 ПЦР-диагностика хламидии трахоматис (в соскобе) 265
23.02 ПЦР-диагностика хламидии трахоматис (в синовиальной жидкости) 380
23. 03 ПЦР-диагностика уреаплазмы уреалитикум + парвум (в соскобе) 265
23.04 ПЦР-диагностика микоплазмы хоминис (в соскобе) 265
23.05 ПЦР-диагностика микоплазмы гениталиум (в соскобе) 265
23.06 ПЦР-диагностика гонококка (в соскобе) 265
23.07 ПЦР-диагностика гонококка (в синовиальной жидкости) 380
23.08 ПЦР-диагностика вируса герпеса 1,2 типа (в соскобе) 265
23.09 ПЦР-диагностика вируса герпеса 6 типа в крови 500
23.10 ПЦР-диагностика вируса герпеса 6 типа в крови (количественно) 980
23.11 ПЦР-диагностика цитомегаловируса (в соскобе) 265
23.12 ПЦР-диагностика трихомонады (в соскобе) 265
23.13 ПЦР-диагностика гарднереллы (в соскобе) 265
23.14 ПЦР-диагностика кандиды (в соскобе) 265
23.15
ПЦР-диагностика кандиды (в синовиальной жидкости) 380
23.16 ПЦР-диагностика кандиды - типирование (Candida albicans/glabrata/krusei) 610
23. 16.1 Выявление и типирование возбудителей грибковых инфекций рода Candida,Malassezia, Saccharomyces b Debaryomyces (Микозоскрин) 1 500
23.17 ПЦР-диагностика папилломавируса 16 тип (в соскобе) 300
23.18 ПЦР-диагностика папилломавируса 18 тип (в соскобе) 300
23.19 ПЦР-диагностика папилломавирусной инфекции 16,18 тип (количественно) 700
23.20 ПЦР-диагностика папилломавируса 6, 11 типы (в соскобе) 350
23.21 ПЦР-диагностика папилломавирусов (КВАНТ-21) 1 500
23.21.1 ПЦР-диагностика ВПЧ (вирус папилломы человека,HPV) скрининг 15 типов: 16,18,31,33,35,39,45,51,52,56,58,59,6,11,68) 650
23.21.2 ПЦР-диагностика ВПЧ (вирус папилломы человека, НРV) скрининг 14 + определение интегрированных форм вируса 900
23.22 ПЦР-диагностика 1 инфекции в крови 500
23.23 ПЦР-диагностика 1 инфекции в эякуляте 500
23.24 ПЦР-диагностика биоценоза урогенитального тракта (ФЕМОФЛОР 16) 2 500
23.24.1 Исследование микрофолоры урогенитального тракта женщин (ФЕМОФЛОР Скрин) 1 800
23. 25 ПЦР-диагностика биоценоза урогенитального тракта (Андрофлор) 3 000
23.25.1 Исследование микрофлоры урогенитального тракта мужчин (Андрофлор Скрин) 1 800
23.25.2 Исследование микрофлоры урогенитального тракта мужчин -  Вирафлор-А (АФ скрин +Квант 15) 2 500
23.25.3 Исследование микрофолоры урогенитального тракта женщин -  Вирафлор-Ф  (ФФ скрин +Квант 15) 2 500
23.26 Определение ДНК вируса гепатита B (Hepatitis B virus) в крови методом ПЦР, качественное исследование 700
23.27
ПЦР-диагностика гепатита В (количественно)
3 000
23.28 Определение РНК вируса гепатита C (Hepatitis C virus) в крови методом ПЦР, качественное исследование 700
23.29 Определение генотипа вируса гепатита C (Hepatitis C virus) 800
23.30 ПЦР-диагностика гепатита С (количественно ) 3 000
23.31 ПЦР-диагностика гепатита D (качественно) 550
23.32 ПЦР-диагностика гепатита D+В (качественно) 1 000
23.33 ПЦР-диагностика ротавируса,норовируса, астровируса (качественно) 1 000
23.
33.1
ПЦР-диагностика норовирусов 1,2 геногруппы (кал) 800
23.33.2 ПЦР-диагностика ротавируса, норовируса, астровируса, энтеровируса (качественно) 1 200
23.34 ПЦР-диагностика хеликобактера пилори (кал) 600
23.35 ПЦР-диагностика энтеровируса (кал) 439
23.36 ПЦР-диагностика энтеровируса (зев, нос) 1 000
23.37 ПЦР-диагностика ОКИ (острые кишечные инфекции) Аденовирусы группы F, Ротавирусы группы А, Норовирусы 2 генотипа, Астровирусы, Энтеровирус, - Шигелла, Энтероинвазивные E. coli, Сальмонелла, Термофильные Кампилобактерии (кал) 1 500
23.38 ПЦР-диагностика вируса герпеса 4 типа (Эпштейна -Барр) 350
23.39 ПЦР-диагностика вируса герпеса 4 типа (Эпштейна -Барр) в крови, качественное исследование 500
23.40 ПЦР-диагностика вируса герпеса 4 типа (Эпштейна -Барр) в крови (количественно) 980
23.41 ПЦР-диагностика мононуклеоза (Вирус Эпштейна-Барр/ Цитомегаловирус/ Вирус герпеса 6 типа) (качественно) 740
23.42 ПЦР-диагностика мононуклеоза (Вирус Эпштейна-Барр/ Цитомегаловирус/ Вирус герпеса 6 типа) (количественно) 1 330
23. 43 ПЦР-диагностика токсоплазмы (кровь) 500
23.44 ПЦР-диагностика вируса краснухи (кровь) 500
23.46 ПЦР-диагностика вирусов гриппа А+В (Influenza А-В) 1500
23.47 ПЦР-диагностика ОРВИ-скрин (респираторно-синцитиальный вирус, метапневмовирус, вирус парагриппа 1,2,3,4, коронавирусы, риновирусы, аденовирусы В,С,Е, бокавирусы) 1600
23.48 ПЦР-диагностика вируса гриппа A h2N1 (свиной), h4N2 (Гонконг) 1000
23.49 ПЦР-диагностика хламидия пневмония (Chlamydophila pneumoniae) 480
23.50 ПЦР-диагностика вируса герпеса 3 типа (ветряная оспы и опоясывающий лишай) (Varicella-Zoster Virus) 350
23.51 Генетика тромбофилии (8 генов) с описанием 3 600
23.52 Генетика тромбофилии (2 гена) (для контрацепции) с описанием 2 300
23.53 ПЦР-диагностика микоплазма пневмония (Mycoplasma pneumoniae) 480
23.55 Генетика нарушения обмена фолатов с описанием  3 100
23.57 Генетика тромбофилии, обмен фолатов  с описанием 5 600
23.59 Генетическая предрасположенность к развитию рака молочной железы и яичников (BRCA-1, BRCA-2) с описанием 3 980
23. 61 Генетический фактор мужского бесплодия (AZF) с описанием 3 980
23.62 Типирование генов системы HLAII класса (DQB1 - репродуктивные проблемы) 12 показателей 3 080
23.62.1 Типирование генов системы HLA II класса. Полная панель. Локусы DRB1, DQA1, DQB1.  4 300
23.62.2 Типирование генов системы HLA II класса. (DRB1 - трансплантация органов и тканей) 13 показателей. 2 000
23.62.3 Типирование генов системы HLA II класса. (DQA1 - риск развития сахарного диабета I типа) 8 показателей. 2 000
23.64 Кардиогенетика гипертонии (полная панель) с описанием 3 960
23.65 Описание результатов генетических исследований врачом-генетиком 600
23.66 ПЦР-диагностика золотистого стафилококка. Качественно, количественно и выявление метициллин-чувствительного Staphylococcus aureus. 600
23.67 ПЦР-диагностика возбудителей коклюша (Bordetella pertussis), паракоклюша (Bordetella parapertussis) и бронхисептикоза (Bordetella bronchiseptica) 600
23.68 ПЦР-диагностика коронавируса (SAR.S-CoV-2) (качественное определение) 2 000
23.69 ПЦР-диагностика коронавируса (SARS-CoV-2) (качественное определение) с выездом для забора биоматериала 2 250
23. 70 ПЦР-диагностика коронавируса (SARS-CoV-2) (качественное определение) (результат на английском языке) 2 200
24. ИФА-диагностика показать
24.01 Экспресс-анализ крови на ВИЧ 330
24.03 Экспресс-анализ крови на сифилис 330
24.04.1 Сифилис РПГА (реакция пассивной гемагглютинации), качественно 330
24.04.2 Сифилис РПГА (реакция пассивной гемагглютинации), количественно (титр) 660
24.05 Экспресс-анализ крови на гепатит В 330
24.08 Экспресс-анализ крови на гепатит С 330
24.10 Исследование уровня 25-OH витамина Д в крови 1 600
24.10.1 Исследование уровня фолиевой кислоты (Folic Acid) в крови 770
24.10.2 Исследование уровня витамина В12 (цианокобаламин) в крови 615
24.11 Исследование уровня тиреотропного гормона (ТТГ) в крови 450
24.12 Исследование уровня свободного тироксина (Т4) сыворотки крови 450
24.13 Исследование уровня общего трийодтиронина (Т3) в крови 300
24. 14 Исследование уровня антител к тиреоидной пероксидазе (АТ-ТПО) в крови 450
24.15 Исследование уровня антител к рецептору тиреотропного гормона (ТТГ) в крови 1 200
24.16  Исследование уровня антител к тиреоглобулину (АТ-ТГ) в крови 360
24.16.1 Исследование уровня Тиреоглубина  (Тиреоглобулин; Thyroglobulin, TG) 550
24.17 Исследование уровня адренокортикотропного (АКТГ) гормона в крови 570
24.17.1 Исследование уровня соматотропного гормона в крови (соматотропин, СТГ) 350
24.18 Исследование уровня лютеинизирующего гормона (ЛГ) в сыворотке крови 450
24.19 Исследование уровня фолликулостимулирующего гормона (ФСГ) в сыворотке крови 450
24.20 Исследование уровня пролактина в крови 450
24.21 Исследование уровня общего кортизола в крови 450
24.22 Исследование уровня прогестерона в крови 450
24.23 Исследование уровня эстрадиола в крови 650
24.25 Исследование уровня хорионического гонадотропина (бета-ХГЧ) в крови (срок выполнения 1 день) 500
24. 26 Исследование уровня паратиреоидного гормона в крови 500
24.27 Исследование уровня ферритина в крови 500
24.28 Исследование уровня общего тестостерона в крови 450
24.28.1 Исследование уровня свободного тестостерона в крови 800
24.28.2 Исследование уровня дигидротестостерона (Dihydrotestosterone) в крови 1 100
24.29 Исследование уровня глобулина, связывающего половые гормоны (ССГ), в крови 650
24.30 Исследование уровня гормона ДГЭА-С(дегидроэпиандростерон-сульфат) 450
24.31 Исследование уровня 17-гидроксипрогестерона (17-OH прогестерон) в крови 500
24.32 Определение уровня антимюллерова гормона в крови 1 200
24.33 Исследование уровня Ингибина В, в крови 1 000
24.34 Исследование уровня C-пептида в крови 600
24.35 Исследование уровня инсулина крови 600
24.36 Определение антител класса M (IgM) к вирусу краснухи (Rubella virus) в крови 400
24. 37 Определение антител класса G (IgG) к вирусу краснухи (Rubella virus) в крови 400
24.38 Определение антител класса M (IgM) к токсоплазме (Toxoplasma gondii) в крови 400
24.39 Определение антител класса G (IgG) к токсоплазме (Toxoplasma gondii) в крови 400
24.40 Определение антител класса M (IgM) к вирусу простого герпеса в крови 400
24.41 Определение антител класса G (IgG) к вирусу простого герпеса в крови 400
24.42 Определение антител класса M (IgM) к цитомегаловирусу (Cytomegalovirus) в крови 400
24.43 Определение антител класса G (IgG) к цитомегаловирусу (Cytomegalovirus) в крови 400
24.44 Определение антител класса G (IgG) к возбудителю описторхоза (Opisthorchis felineus) в крови 400
24.48 Определение антител класса G (Ig G) к антигенам токсокар 410
24.49 Определение антител класса G (Ig G) к аскаридам 760
24.50 Определение антител к возбудителю брюшного тифа Salmonella typhi (РПГА) 470
24.51 Определение суммарных антител (IgА, IgМ, Ig G) к антигену CagA Helicobacter pilori 580
24. 52 Определение суммарных антител ( IgА, IgM, IgG) к антигену лямблий  490
24.53 Системная красная волчанка. Антитела ( IgG) к двуспиральной (нативной) ДНК 470
24.54 Исследование уровня общего иммуноглобулина E в крови 450
24.55 Аллергопанель №1 – Смешанная (IgE к 20 респираторным и пищевым аллергенам) 4 000
24.56 Аллергопанель №2 - Респираторная (IgE к 20 респираторным аллергенам) 4 000
24.57 Аллергопанель №3 - Пищевая (IgE к 20 пищевым аллергенам) 4 000
24.58 Аллергопанель №4 - Педиатрическая (IgE к 20 «педиатрическим» аллергенам) 4 000
24.59 Экспресс-анализ кала на скрытую кровь 300
24.60 Исследование уровня простатспецифического (ПСА) антигена общего в крови 450
24.61 Экспресс-анализ крови на общий ПСА (простат-специфический антиген) 330
24.62 Исследование уровня антигена плоскоклеточной карциномы (SCC) 1 900
24.63 Исследование уровня РЭА (раково-эмбриональный антиген) 510
24. 64 Исследование уровня опухолеассоциированного маркера CA 15-3 в крови (углеводный антиген рака молочной железы) 560
24.65 Исследование уровня антигена аденогенных раков CA 19-9 в крови 510
24.66 Исследование уровня антигена аденогенных раков CA 125 в крови 550
24.67 Определение антифосфолипидного синдрома (Бета-2-гликопротеин, Суммарная фракция фосфолипидов, ХГЧ, Ревматоидный фактор, Двуспиральная ДНК, Коллаген), полуколичественно 3 500
24.69 Исследование уровня Кальцитонина (Calcitonin) 850
24.70 Определение антител к циклическому цитруллинированному пептиду (АЦЦП) 1 000
24.71 Исследование уровня АФП (Альфа-фетопротеин) 310
24.72 Диагностика целиакии (Антитела к тканевой трансглутаминазе IgG: IgA) 1 500
24.73 Определение антител класса М (IgM) к коронавирусу (SARS-CoV, IgM) в крови 750
24.74 Определение антител класса G (IgG) к коронавирусу (SARS-CoV, IgG) в крови 750
24.75 Определение суммарных антител (IgM+IgG) к коронавирусу (SARS-CoV-2, IgM+IgG) в крови 1 350
25. Биохимические исследования показать
25. 01 Исследование уровня глюкозы в крови 150
25.02 Глюкозотолерантный тест с определением глюкозы натощак и после нагрузки через 2 часа (включая взятие биоматериала) 600
25.03 Глюкозотолерантный тест при беременности (включая взятие биоматериала) 750
25.04 Исследование уровня гликированного гемоглобина в крови 450
25.05 НОМА Оценка инсулинорезистентности: глюкоза (натощак), инсулин (натощак), расчет индекса HOMA-IR 700
25.06 Проба Реберга (клиренс эндогенного креатинина, скорость клубочковой фильтрации) (кровь,моча) 300
25.07 Исследование уровня общего билирубина в крови 150
25.08 Исследование уровня билирубина связанного (конъюгированного) в крови 150
25.09 Определение активности аспартатаминотрансферазы (АСТ) в крови 150
25.10 Определение активности аланинаминотрансферазы (АЛТ) в крови 150
25.11 Определение активности гамма-глютамилтрансферазы (ГГТ) в крови 150
25.12 Исследование уровня лактатдегидрогеназы (ЛДГ) в крови 150
25. 13 Исследование уровня С-реактивного белка (СРБ) 300
25.14 Исследование уровня гомоцистеина в крови 1 100
25.15 Исследование уровня общего белка в крови 150
25.16 Суточная потеря белка в моче 160
25.17 Исследование уровня альбумина в крови 150
25.18 Исследование уровня микроальбумина в моче 250
25.19 Исследование уровня мочевины в крови 150
25.20 Исследование уровня креатинина в крови 150
25.21 Исследование уровня холестерина в крови 150
25.22 Исследование уровня холестерина липопротеинов низкой плотности (ЛПНП) 250
25.23 Исследование уровня холестерина липопротеинов высокой плотности в крови (ЛПВП) 250
25.24 Исследование уровня липопротеинов в крови (триглицериды) 200
25.25 Липидограмма (холестерин, ЛПВП, ЛПНП, триглицериды, коэффициент атерогенности) 800
25.26 Исследование уровня общего магния в крови 180
25. 27 Исследование уровня неорганического фосфора в крови 150
25.28 Исследование уровня общего кальция в крови 150
25.29 Исследование уровня кальция в суточной моче 160
25.30 Исследование уровня железа сыворотки крови 200
25.30.1 Исследование уровня меди (Cu) сыворотки крови 240
25.30.2 Исследование уровня цинка (Zn) сыворотки крови 240
25.31 Исследование железосвязывающей способности в крови 350
25.32 Исследование уровня трансферрина в крови 400
25.33 Электролиты (К, Na,Ca, Cl) 500
25.34 Исследование уровня амилазы в крови 150
25.35 Исследование уровня мочевой кислоты в крови 150
25.36 Исследование уровня мочевой кислоты в моче 150
25.37 Исследование уровня АСЛО в крови (антистрептолизин О, полуколичественно) 250
25.38 Исследование уровня ревматоидного фактора (полуколичественно) 250
25.39 Исследование уровня изоферментов креатинкиназы в крови(Креатинфосфокиназа КФК) 190
25.40 Исследование уровня изоферментов креатинкиназы в крови (Креатинфосфокиназа КФК -МВ) 250
25.40.1 Исследование уровня маркеров: Миоглобин/Креатинкиназа МВ/Тропонин-I 850
25.41 Исследование уровня иммуноглобулина G в крови 200
25.42 Исследование уровня щелочной фосфатазы в крови 150
25.43 Исследование уровня простатической кислой фосфатазы в крови 160
26. Коагулологические исследования(оценка системы гемостаза)показать
26.01 Активированное частичное тромбопластиновое время 200
26.02 Протромбиновый комплекс по Квику(протромбиновое время, ПТИ, МНО) 200
26.03 Исследование уровня фибриногена в крови (по Клауссу) 200
26.04 Определение тромбинового времени в крови 200
26.05 Определение концентрации Д-димера в крови 900
26.06 Определение активности антитромбина III в крови 300

Анализ на энтеровирус

 Энтеровирусные инфекции – большая группа острых инфекционных заболеваний, характеризующихся лихорадкой и полиморфизмом клинических симптомов, обусловленных поражением ЦНС, сердечно-сосудистой системы, ЖКТ, мышечной системы, легких, печени, почек и др. органов.
Возбудителями заболевания являются энтеровирусы Коксаки А, В и ЭКХО. Это РНК-содержащие вирусы, малых размеров (18–30 нм), длительно сохраняются во внешней среде и пищевых продуктах, чувствительны к нагреванию свыше 56°С, хлорсодержащим дезинфицирующим растворам, ультрафиолетовому облучению. Размножаются на культуре тканей, обладают цитопатогенным действием.
Источник инфекции – больной человек или вирусоноситель.
Выделение энтеровирусов с фекалиями происходит с первого дня болезни и на протяжении двух недель, из носоглотки – в течение первой недели болезни. Длительность вирусоносительства после перенесенной инфекции от 5 до 15 мес.
Механизмы передачи инфекции – фекально-оральный, воздушно-капельный, трансплацентарный.
Восприимчивость к энтеровирусным инфекциям всеобщая и высокая, но чаще болеют дети в возрасте от 3 до 10 лет. Инфекция высококонтагиозная, может протекать как спорадически, так и в виде групповых вспышек в детских коллективах; сезонность – весенне-летне-осенняя. Иммунитет нестойкий, типоспецифический.
Входные ворота инфекции – слизистые оболочки верхних дыхательных путей или пищеварительного тракта, где вирус размножается, накапливается и вызывает местную воспалительную реакцию, что проявляется симптомами герпетической ангины, ОРЗ, фарингита или кишечной дисфункцией. В результате последующей вирусемии вирусы гематогенно разносятся по всему организму и оседают в различных органах и тканях.
Тропность энтеровирусов к нервной ткани, мышцам, эпителиальным клеткам обусловливает многообразие клинических форм инфекции. При проникновении вируса в ЦНС возможно ее поражение с развитием асептического менингита, менингоэнцефалита или паралитических полиомиелитоподобных форм.
Вирусы ЭКХО обычно не диссеминируют из мест первичного проникновения, лишь иногда гематогенно заносятся в другие органы.
Клинические проявления энтеровирусных инфекций
Инкубационный период длится от 2-х до 7 дней. Начало заболевания острое, внезапное, бурное, температура быстро повышается до 39°–40° С, нередко с ознобом. Больных беспокоят сильная головная боль, головокружение, расстройство сна. Характерен внешний вид больного – яркие щеки и губы, гиперемия конъюнктив, инъекция сосудов склер, бледный носогубный треугольник. Часто отмечаются боли в животе, тошнота, могут быть рвота, диарея или запоры. Течение большинства форм доброкачественное, длительностью 3–7 дней, но склонное к рецидивам и волнообразному течению.
Выделяют несколько клинических форм энтеровирусной инфекции, которые могут быть либо единственным проявлением болезни либо комбинироваться с другими формами.
1. Герпетическая ангина. В первые сутки заболевания появляются красные папулы, которые располагаются на умеренно гиперемированной слизистой небных дужек, язычка, мягком и твердом нёбе, быстро превращаются в везикулы размером 1–2 мм, числом от 3–5 до 15–18, не сливающиеся между собой. Через 1–2 дня пузырьки вскрываются с образованием эрозий либо бесследно рассасываются к 3–6 дню болезни. Боль при глотании отсутствует или незначительная, иногда появляется слюнотечение. Увеличение шейных и подчелюстных лимфоузлов небольшое, но пальпация их болезненна.
2. Эпидемическая миалгия (болезнь Борнхольма, «чертова пляска», плевродиния). Характеризуется острыми болями с локализацией в мышцах передней брюшной стенки живота, нижней части грудной клетки, спине, конечностях. Боли носят приступообразный характер, продолжительностью от 30–40 секунд до 15–20 минут, повторяются на протяжении нескольких дней, могут носить рецидивирующий характер, но уже с меньшей интенсивностью и продолжительностью.
Менингеальный синдром сохраняется от 2–3 дней до 7-10 дней, санация ликвора происходит на 2-й - 3-й неделе. Возможны остаточные явления в виде астенического и гипертензионного синдромов.
Из других неврологических симптомов при менингите энтеровирусной этиологии могут быть расстройства сознания, повышение сухожильных рефлексов, отсутствие брюшных рефлексов, нистагм, клонус стоп, кратковременные глазодвигательные расcтройства.
4. Паралитические формы энтеровирусной инфекции отличаются полиморфизмом: могут развиться спинальная, бульбоспинальная, понтинная, полирадикулоневрическая формы. Чаще других встречается спинальная форма, которая характеризуется развитием острых вялых параличей одной или обеих ног, реже – рук с выраженным болевым синдромом мышечного характера. Течение этих форм легкое, не оставляет стойких парезов и параличей.
5. Энтеровирусная лихорадка (малая болезнь, 3-х дневная лихорадка). Это наиболее частая форма энтеровирусной инфекции, но трудно диагностируемая при спорадической заболеваемости. Характеризуется кратковременной лихорадкой без выраженных симптомов локальных поражений. Протекает с умереными общеинфекционными симптомами, самочувствие нарушено мало, токсикоза нет, температура сохраняется 2–4 дня. Клинически может быть диагносцирована при наличии вспышки в коллективе, когда встречаются и другие формы энтеровирусной инфекции.
6. Энтеровирусная экзантема («бостонская лихорадка»). Характеризуется появлением с 1-го – 2 дня болезни на лице, туловище, конечностях высыпаний розового цвета, пятнисто- или пятнисто-папулезного характера, иногда могут быть геморрагические элементы. Сыпь держится 1–2 дня, реже – дольше и исчезает бесследно.
7. Кишечная (гастроэнтеритическая) форма. Протекает с водянистой диареей до 5–10 раз в сутки, болями в животе, метеоризмом, нечастой рвотой. Симптомы интоксикации умеренные. У детей до 2-х летнего возраста кишечный синдром часто сочетается с катаральными явлениями со стороны носоглотки. Продолжительность болезни у детей раннего возраста в течение 1–2-х недель, у детей старшего возраста 1–3 дня.
8. Респираторная (катаральная) форма проявляется слабо выраженными катаральными явлениями в виде заложенности носа, ринита, сухого редкого кашля. При осмотре выявляется гиперемия слизистой ротоглотки, мягкого нёба и задней стенки глотки. Могут отмечаться легкие диспепсические расстройства. Выздоровление наступает через 1–1,5 недели.
9. Миокардит, энцефаломиокардит новорожденных, гепатит, поражение почек, глаз (увеит) – эти формы энтеровирусной инфекции у детей встречаются редко. Клиническая диагностика их возможна только при наличии манифестных форм энтеровирусной инфекции или эпидемических вспышек заболевания. Чаще они диагносцируются при проведении вирусологических и серологических исследований.


  

Энтеровирусная инфекция у детей

Энтеровирусные инфекции включают в себя группу заболеваний. Их специфика такова, что после перенесенной инфекции образуется пожизненный иммунитет. Однако иммунитет будет только к тому типу вируса, разновидностью которого переболел ребенок. Поэтому энтеровирусной инфекцией ребенок может болеть несколько раз за свою жизнь. По этой же причине не существует вакцины от данного заболевания. 

Болеют чаще всего дети в возрасте от 3 до 10 лет. У детей, находящихся на грудном вскармливании, в организме присутствует иммунитет, полученный от матери через грудное молоко, однако, этот иммунитет не стойкий и после прекращения грудного вскармливания быстро исчезает.

Вирус передается от больного ребенка или от ребенка, который является вирусоносителем. Вирусы хорошо сохраняются в воде и почве, при замораживании могут выживать на протяжении нескольких лет, устойчивы к действию дезинфицирующих средств, однако восприимчивы к действию высоких температур (при нагревании до 45ºС погибают через 45-60 секунд). 

Пути передачи вируса: 

-  воздушно-капельный (при чихании и кашле с капельками слюны от больного ребенка к здоровому)

- фекально-оральный при не соблюдении правил личной гигиены 

- через воду, при употреблении сырой (не кипяченой) воды

- возможно заражение детей через игрушки, если дети их берут в рот 

Симптомы энтеровирусной инфекции

У энтеровирусных инфекций есть как схожие проявления, так и различные, в зависимости от вида. Попав в организм ребенка, вирусы мигрируют в лимфатические узлы, где они оседают и начинают размножаться. Инкубационный период у всех энтеровирусных инфекций одинаковый – от 1 до 10 дней (чаще 2-5 дней).

Заболевание начинается остро - с повышения температуры тела до 38-39º С. Температура чаще всего держится 3-5 дней, после чего снижается до нормальных цифр. Очень часто температура имеет волнообразное течение: 2-3 дня держится температура, после чего снижается и 2-3 дня находится на нормальных цифрах, затем снова поднимается на 1-2 дня и вновь нормализуется уже окончательно. При повышении температуры ребенок ощущает слабость, сонливость, может наблюдаться головная боль, тошнота, рвота. При снижении температуры тела все эти симптомы проходят, однако при повторном повышении могут вернуться. Также увеличиваются шейные и подчелюстные лимфоузлы, так как в них происходит размножение вирусов.

В зависимости от того, какие органы больше всего поражаются, выделяют несколько форм энтеровирусной инфекции. Энтеровирусы могут поражать: центральную и периферическую нервные системы, слизистую ротоглотки, слизистую глаз, кожу, мышцы, сердце, слизистую кишечника, печень, у мальчиков возможно поражение яичек.

Наиболее тяжелое последствие энтеровируса – это развитие  серозного энтеровирусного менингита. Он может развиться у ребенка любого возраста и распознается по следующим признакам: 

- головная боль разлитого характера, интенсивность которой нарастает с каждым часом;

- рвота без тошноты, после которой ребенок не ощущает облегчения;

- усиление боли и повторный эпизод рвоты может быть спровоцирован ярким светом или громким звуком;

- ребенок может быть заторможен или, наоборот, чрезвычайно возбужден;

- в тяжелых случаях развиваются судороги всех мышечных групп;

Окончательный диагноз менингита может поставить только доктор после проведения люмбальной пункции и изучения лабораторных показателей полученной спинномозговой жидкости.

Лечение энтеровирусной инфекции

Специфического лечения энтеровирусной инфекции не существует. Лечение проводят в домашних условиях, госпитализация показана при наличии поражения нервной системы, сердца, высокой температуры, которая долго не поддается снижению при использовании жаропонижающих средств. Ребенку показан постельный режим на весь период повышения температуры тела.

Питание должно быть легким, богатым белками. Необходимо достаточное количество жидкости: кипяченая вода, минеральная вода без газов, компоты, соки, морсы.

Лечение проводят симптоматически в зависимости от проявлений инфекции. В некоторых случаях (ангина, понос, конъюнктивит) проводят профилактику бактериальных осложнений.

Дети изолируются на весь период заболевания. В детском коллективе могут находиться после исчезновения всех симптомов заболевания.

Профилактика энтеровирусной инфекции

Для профилактики необходимо соблюдение правил личной гигиены: мыть руки после посещения туалета, прогулки на улице, пить только кипяченую воду или воду из заводской бутылки, недопустимо использование для питья ребенка воды из открытого источника (река, озеро).

Специфической вакцины против энтеровирусной инфекции не существует, так как в окружающей среде присутствует большое количество серотипов этих вирусов.

ВАЖНО при первых признаках заболевания обращаться к врачу, которые определит тактику лечения! 

Covid-мутанты: что мы знаем о разных штаммах коронавируса?

  • Ольга Дьяконова
  • Би-би-си

Автор фото, Artem Geodakyan/TASS

По мере развития пандемии Covid-19 вызывающий это заболевание коронавирус SARS-CoV-2 продолжает мутировать, то есть изменяться. А значит, меняются и его свойства, причем новые штаммы вполне могут представлять большую угрозу - например, легче передаваться от человека к человеку или вызывать более тяжелое заболевание.

Уже описаны случаи повторного заражения, когда выздоровевший человек заболевал снова, встретившись с другой версией той же инфекции - причем известно, что болезнь в таком случае может протекать даже в более тяжелой форме.

Какие штаммы вируса известны ученым на данный момент и насколько они опасны? И сможет ли потенциальная вакцина защитить от всех известных вариаций коронавируса?

Что такое штамм?

Каждый вирус имеет свой геном - уникальную специфическую последовательность ДНК или РНК.

Геном SARS-CoV-2 - это длинная последовательность РНК, состоящая примерно из почти 30 тысяч знаков (нуклеотидов), идущих друг за другом в строгом порядке. Этот порядок может меняться: при сборке каждой новой копии вируса в любом из этих звеньев может произойти ошибка - замена одного нуклеотида другим, - и в результате немного изменится код всей цепочки.

В каждом новом "хозяине" геном вируса немного изменяется. Эти изменения могут быть совсем незначительными, но они позволяют установить связь между инфицированными или проследить путь, который проделал вирус.

Используя слово "штамм", ученые имеют в виду генетически отличную ветвь вируса, отличающуюся одной или несколькими мутациями от своего "родителя". Разница может составлять лишь долю процента от всего генома, но каждая новая последовательность РНК может положить начало новой ветви вируса - то есть новому штамму.

Скорость, с которой происходят генетические изменения, у разных вирусов различна - и SARS-CoV-2 мутирует относительно медленно. Большинство геномов этого вируса отличаются друг от друга небольшим количеством точечных замен, а число отличий от исходного варианта не превышает 30 на почти 30 тысяч нуклеотидов.

Какие штаммы коронавируса существуют?

Основных штаммов нового коронавируса семь, они обозначаются буквами GR, G, GH, O, S, L и V. Все началось со штамма L - именно его обнаружили в китайском Ухане в декабре 2019 года. Однако теперь он постепенно исчезает.

Остальные штаммы распределены по миру неоднородно: на каждом континенте наиболее распространено, как правило, не более двух основных вариаций. Их распространение можно наблюдать на составленной учеными интерактивной карте Nextstrain, отслеживающей мутации вируса.

Российский научный центр "Вектор" в октябре сообщил, что выявил более 80 мутаций коронавируса на территории страны. Но широко распространены в основном два штамма - европейский и азиатский, сообщили в Роспотребнадзоре. При этом последний завезен не из Китая, а из других азиатских стран.

Эти два штамма находят у 99% исследуемых образцов в России, сообщали в ведомстве.

Как вирус мутировал в России?

"Общее число мутаций, которые в совокупности выявлены в секвенированных геномах вируса SARS-CoV-2, составляет многие тысячи, однако только единичные из них зафиксировались и стабильно наследуются", - поясняют в Роспотребнадзоре. Сейчас насчитывается около 22 таких единичных мутаций, они произошли в январе-марте этого года. Позднее новые штаммы уже широко не распространялись, считают в ведомстве.

В начале эпидемии в России в геноме вируса стабильно зафиксировались три основные группы мутаций, которые сформировали, по данным исследования Роспотребнадзора, "три ветви эволюционного развития". К концу марта 2020 года развитие этих трех направлений замедляется - и основными циркулирующими в стране стали штаммы с мутацией в гене ORF1b (P314L) и S (D614G).

Эти две мутации стали самым существенным устойчивым изменением в геноме вируса SARS-CoV-2, подчеркивается в исследовании. В Роспотребнадзоре считают, что мутация в гене S ассоциируется со снижением патогенности (способности вызывать заболевание, проникая в организм). Ведомство отмечает, что это можно объяснить и улучшением лечения больных в течение пандемии.

Влияние мутации в гене ORF1b (P314L) еще мало изучено.

Автор фото, Kirill Kukhmar/TASS

Подпись к фото,

Изучением генома коронавируса в России занимаются научные центры "Вектор" и Чумакова. Эти же центры недавно разработали две потенциальные вакцины

"Вирусы мутируют постоянно, однако коронавирусы мутируют значительно медленнее по сравнению с другими РНК-вирусами", - рассказывает Любовь Козловская, заведующая лабораторией полиомиелита и других энтеровирусных инфекций федерального научного центра исследований и разработки иммунобиологических препаратов им. М.П. Чумакова.

"Несмотря на активную циркуляцию по всему миру, SARS-CoV-2 изменился менее чем на 0,1% по сравнению с вирусом, изначально выделенным в Китае 11 месяцев назад. Основные изменения выявлены в первые месяцы распространения, и варианты вируса, широко циркулирующие в настоящее время, сходны с теми, которые выделяли весной", - говорит Козловская.

Штамм S (D614G) сейчас является объектом пристального внимания ученых. Его впервые выявили в Индонезии в августе; тогда сообщалось, что этот штамм якобы в 10 раз более заразен, чем первоначальный штамм вируса.

Некоторые исследования, которые пока находятся на стадии препринта (то есть не отрецензированы и не опубликованы в научных изданиях), приходят к выводу, что у этой мутации действительно может быть более высокая инфицирующая способность, а вирусная нагрузка при инфицировании этим штаммом - более высокой. Но окончательных выводов по этому поводу нет.

"Вирус довольно быстро приобрёл замену в поверхностном белке вириона S (спайк), которая увеличивает его контагиозность (свойство инфекционных болезней передаваться от больных организмов - здоровым - Би-би-си), но не утяжеляет течение заболевания", - рассказывает Козловская. По ее словам, остальные отличия в штаммах вируса минимальны.

Первые варианты вируса с распространенными в России двумя мутациями выявлены в конце января в Китае, затем - в Австралии. В феврале эти варианты обнаружили в большинстве стран Западной Европы, Саудовской Аравии, США, Канаде, Мексике, Бразилии, Марокко и Сенегале.

Детальное сравнение геномов вируса на территории России и зарубежных стран говорит о том, что в стране циркулируют штаммы, завезенные из Западной Европы. Их завезли в марте и апреле 2020 года, отмечают в Роспотребнадзоре.

"[Коронавирус] в течение этих девяти месяцев мутировал очень мало и не изменялся в тех его локусах, которые отвечают за проявления эпидпроцесса, за его, так скажем, агрессивность и злость", - заявила на прошлой неделе глава Роспотребнадзора Анна Попова. В ведомстве считают, что у вируса низкая способность к мутациям - он накапливает лишь около двух точечных замен в месяц, то есть за год может произойти около 24 мутаций.

"Распределение основных вариантов вируса, циркулирующих в России, в общем похоже на таковое в Европе. Некоторые отличия наблюдаются, но у нас нет оснований полагать, что эти отличия как-то изменяют клиническое течение или эпидемиологию Covid-19 в России по сравнению со странами Европы", - говорит Козловская из центра им. М.П. Чумакова.

В Роспотребнадзоре в ответ на запрос Би-би-си сообщили, что ежемесячно ученые ФБУН ГНЦ ВБ "Вектор" расшифровывают полностью более 150 геномов нового коронавируса. "Получаемые данные используются для анализа актуальности используемых диагностических тест-систем, помогают выявлять завозные случаи, оценивать региональные особенности генетического разнообразия SARS-CoV-2", - заявили в ведомстве.

Сейчас проводится секвенирование геномов вирусов и накопление данных в различных лабораториях по всему миру, в том числе и в центре Чумакова, рассказывает Козловская. Ученые, по ее словам, проведут корелляции геномов вирусов с клинической картиной пациентов, от которых они выделены, что даст возможность пролить свет на значение наиболее распространенных мутаций.

Изучить влияние каждой конкретной мутации на клиническую картину заболевания Covid-19 сложно, признает она. Ученым предстоит изучить значение каждой конкретной мутации для структуры мутантных белков, а также определить роль этих мутаций в развитии клинических симптомов и поражения легких в экспериментах на животных.

В "Векторе" не ответили на вопросы Би-би-си относительно процесса изучения штаммов коронавируса. Там, как и в ФНЦИРИП им. М.П. Чумакова, на данный момент разработали и анонсировали новые вакцины от SARS-CoV-2, которые ждут клинических исследований.

Стоит ли бояться мутаций?

Основные вопросы, которые стоят перед учеными в связи с мутациями коронавируса - это способность вакцины сформировать иммунную защиту, которая будет одинаково устойчива к разным штаммам. Важен также вопрос различий в воздействии на инфицированного - например, могут ли одни штаммы быть заразнее других.

Из заявлений Роспотребнадзора следует, что мутации вируса не так страшны. Но в научной литературе уже сообщалось о нескольких случаях повторного заражения коронавирусом.

Чтобы признать заражение повторным, ученые каждый раз проверяют генетический состав возбудителя и убеждаются, что штамм вируса отличается от того, что вызвал заболевание в первый раз - иначе нельзя с уверенностью утверждать, что это именно вторичная инфекция, а не затянувшийся первичный случай.

Голландское информагентство BNO ведет счетчик всех повторных заболеваний, о которых когда-либо сообщалось, сопроводив каждый ссылкой на источник. Согласно информации агентства, в мире известно о 24 случаях повторных заражений, одно из них стало смертельным. Умерла 89-летняя пациентка из Нидерландов с онкологическим заболеванием.

Повторные заражения происходили также в Гонконге, Бельгии, США и Эквадоре.

"Каждый день в России регистрируется почти 20 тысяч случаев заболевания, часть из них ассоциированы с вирусами, давно циркулирующими на территории страны, часть - с импортированными вариантами, ассоциированными с заражением вирусом на территории других стран, часто очень отдаленных, - рассказывает Любовь Козловская. - Поэтому, конечно, возможен завоз и последующее выделение варианта вируса, который ранее не встречался в России, как это недавно произошло в Норвегии. Однако, по ее словам, это не означает моментальное изменение эпидемиологической ситуации с Covid-19.

В октябре в журнале Lancet было опубликовано исследование, описывающее два случая повторного заражения коронавирусной инфекцией. У одного из пациентов из штата Невада, США после повторного заражения болезнь протекала тяжелее. 25-летнему больному потребовалась госпитализация из-за кислородной недостаточности, компьютерная томография выявила у него наличие вирусной пневмонии.

Ученые выяснили, что он заразился другим штаммом, генетически отличным от прошлого возбудителя болезни. "Таким образом, прошлое воздействие SARS-CoV-2 может не гарантировать полного иммунитета", - делают вывод ученые. Они напоминают, что все люди, независимо от того, был ли у них ранее диагностирован коронавирус или нет, должны принимать одни и те же меры предосторожности.

Будут ли эффективны вакцины, если вирус мутирует?

Известно, что коронавирус мутирует медленнее, чем вирус гриппа: по разным оценкам, в два раза медленнее или на треть. В связи с этим вакцина от коронавируса "вероятно, будет стабильной и эффективной дольше, чем вакцина против гриппа", - говорит в беседе с HuffPost почетный доцент и клинический вирусолог университета Лестера Джулиан Танг.

При этом пока неизвестно, как долго будет сохраняться приобретенный с помощью вакцины иммунитет, даже если она будет работать как следует, напоминает ученый. Эффективность вакцины может зависеть и от индивидуальных особенностей организма - так же, как и у вакцины против гриппа, говорит Танг.

Пока что ученые считают, что вакцины, разрабатываемые во всем мире для борьбы с первыми штаммами нового коронавируса, будут столь же эффективны и в отношении новых мутаций. Исследование австралийских и американских ученых, которое проводили с помощью компьютерного моделирования и опытов на хорьках, 8 октября опубликовал научный журнал NPJ Vaccines. Животным вводили потенциальную вакцину INO-4800, разработанную американской компанией Inovio Pharmaceuticals.

Большинство вакцин, разрабатываемых во всем мире, были смоделированы на основе исходного D-штамма вируса, который был более распространен среди последовательностей, опубликованных в начале пандемии, пояснили ученые.

С тех пор вирус мутировал в штамм G, вариации которого сейчас являются доминирующими по всему миру. У исследователей были опасения, что эта мутация негативно отразится на эффективности разрабатываемых вакцин.

Автор фото, AFK Sistema

Подпись к фото,

Пока ученые склоняются к тому, что кандидаты на вакцину будут эффективны для любых штаммов коронавируса

"Несмотря на мутацию D614G в шиповидном белке, мы подтвердили экспериментами и моделированием, что вакцины-кандидаты по-прежнему эффективны", - заявил один из авторов исследования, профессор Йоркского университета Сешадри Васан.

По словам ученого, обнаружилось, что наиболее часто встречающийся штамм G вряд ли потребует частого подбора новых вакцин - в отличие от гриппа, вакцину от циркулирующих штаммов которого разрабатывают каждый год.

Так как отличия штаммов, циркулирующих в России, минимальны они, скорее всего, не оказывают значительного влияния на структуру вирусных белков, говорит Любовь Козловская из центра им. М.П. Чумакова. Это, по ее словам, делает возможным создание и применение вакцины от Covid-19, которую не придется переделывать каждый год.

Не стоит забывать, что ни одна из разработок вакцин в мире пока не прошла третью фазу клинических исследований, в которых делается вывод о ее эффективности.

В России эту стадию сейчас проходит вакцина центра имени Гамалеи "Спутник V". Две другие российские вакцины лишь готовятся к прохождению этой стадии.

Только после этих исследований, в которых примут участие десятки тысяч человек, можно будет делать выводы по поводу стойкости сформированного вакцинами иммунитета к коронавирусу.

тест для определения антигенов энтеровирусов в кале

АНМО «Ставропольский краевой клинический консультативно-диагностический центр»:

355017, г. Ставрополь, ул. Ленина 304

(8652) 951-951, (8652) 35-61-49 (факс)

(8652) 951-951, (8652) 31-51-51 (справочная служба)

Посмотреть подробнее

Обособленное подразделение «Диагностический центр на Западном обходе»:

355029 г. Ставрополь, ул. Западный обход, 64

(8652) 951-951, (8652) 31-51-51 (контактный телефон)

(8652) 31-68-89 (факс)

Посмотреть подробнее

Клиника семейного врача:

355017 г. Ставрополь, пр. К. Маркса, 110 (за ЦУМом)

(8652) 951-951, (8652) 31-51-51 (контактный телефон)

(8652) 31-50-60 (регистратура)

Посмотреть подробнее

Невинномысский филиал:

357107, г. Невинномысск, ул. Низяева 1

(86554) 95-777, 8-962-400-57-10 (регистратура)

Посмотреть подробнее

Обособленное структурное подразделение в г. Черкесске :

369000, г. Черкесск, ул. Умара Алиева 31

8(8782) 26-48-02, +7-988-700-81-06 (контактные телефоны)

Посмотреть подробнее

Обособленное структурное подразделение в г. Элисте :

358000, г. Элиста, ул. Республиканская, 47

8(989) 735-42-07 (контактные телефоны)

Посмотреть подробнее

ЗАО "Краевой клинический диагностический центр":

355017 г. Ставрополь, ул. Ленина 304

(8652) 951-951, (8652) 35-61-49 (факс)

(8652) 951-951, (8652) 31-51-51 (справочная служба)

Посмотреть подробнее

Обособленное структурное подразделение на ул. Савченко, 38 корп. 9:

355021, г. Ставрополь, ул. Савченко, 38, корп. 9

8 (8652) 316-847 (контактный телефон)

Посмотреть подробнее

Обособленное структурное подразделение на ул. Чехова, 77 :

355000, г. Ставрополь, ул. Чехова, 77

8(8652) 951-943 (контактный телефон)

Посмотреть подробнее

Обособленное структурное подразделение в г. Михайловске:

358000, г. Михайловск, ул. Ленина, 201 (в новом жилом районе «Акварель»).

8(988) 099-15-55 (контактный телефон)

Посмотреть подробнее

Памятка для населения по профилактике энтеровирусных инфекций

Понедельник,  29  Июля  2019

Памятка

Энтеровирусные инфекции (ЭВИ) - группа острых заболеваний, вызываемых энтеровирусами, характеризующихся многообразием клинических проявлений от легких лихорадочных состояний до тяжелых менингитов. Энтеровирусы устойчивы во внешней среде и длительное время могут сохраняться в сточных водах, плавательных бассейнах, открытых водоемах, предметах обихода, продуктах питания (молоко, фрукты, овощи). Вирус быстро погибает при прогревании, кипячении. ЭВИ характеризуются быстрым распространением заболевания.

Сезонность – летне-осенняя, чаще май-август.

Возможные пути передачи инфекции: воздушно-капельный, контактно-бытовой, пищевой и водный. Серозный вирусный менингит является наиболее типичной и тяжелой формой энтеровирусной инфекции.

Источником инфекции являются больные и вирусоносители, в том числе больные бессимптомной формой.

Заболевание начинается остро, с подъема температуры тела до 39-40 градусов. Появляется сильная головная боль, головокружение, рвота, иногда боли в животе, спине, судорожный синдром, нередко выраженные катаральные проявления со стороны ротоглотки, верхних дыхательных путей. При появлении аналогичных жалоб необходимо срочно изолировать больного, т.к. он является источником заражения, для окружающих, и обратиться к врачу.

Учитывая возможные пути передачи, меры личной профилактики должны заключаться в соблюдении правил личной гигиены, соблюдении питьевого режима (кипяченая вода, бутилированная вода), тщательной обработки употребляемых фруктов, овощей и последующим ополаскиванием кипятком. Следует избегать посещения массовых мероприятий, мест с большим количеством людей (общественный транспорт, кинотеатры и т.д.). Рекомендуется влажная уборка жилых помещений не реже 2 раз в день, проветривание помещений.

Ни в коем случае не допускать посещения ребенком организованного детского коллектива (школа, детские дошкольные учреждения) с любыми проявлениями заболевания. При первых признаках заболевания необходимо немедленно обращаться за медицинской помощью, не заниматься самолечением!

Энтеровирусный менингит

Энтеровирусный менингит – вирусное инфекционное заболевание, характеризующееся лихорадкой, сильными головными болями, рвотой.

Инкубационный период при энтеровирусных серозных менингитах составляет в среднем около 1 недели. Чаще болеют городские жители, преимущественно дети до 7 лет, посещающие детские дошкольные учреждения. Менингеальный синдром протекает обычно доброкачественно, с улучшением в течение нескольких дней. Смертельные исходы редки.

Серозный менингит сопровождается лихорадкой, головными болями, фотофобией и менингеальными симптомами. Клиническая картина энтеровирусного менингита в значительной степени зависит от возраста пациентов. Новорожденные дети и дети раннего возраста (до 2 - 3 месяцев) входят в особую группу риска. Энтеровирусное поражение ЦНС в указанном возрасте обычно является частью тяжелого системного заболевания. При этом серозный менингит и/или менингоэнцефалит может быть диагностирован у 27 - 62% детей с энтеровирусной инфекцией. В случае прогрессирующего развития системных проявлений инфекции, таких как некроз печени, миокардит, некротизирующий энтероколит, внутрисосудистая коагуляция, заболевание напоминает бактериальный сепсис. Наблюдаемый у части детей летальный исход связан при этом не с поражением ЦНС, а является результатом острой печеночной недостаточности (вирусы ЕСНО) или миокардита (вирусы Коксаки). У детей более старшего возраста и у взрослых лиц заболевание энтеровирусным менингитом начинается остро, с внезапного повышения температуры до 38 – 40о C. Вслед за этим наблюдается развитие ригидности затылочных мышц, головные боли, светобоязнь. У части пациентов отмечены рвота, потеря аппетита, диарея, сыпь, фарингит, миалгии. Болезнь длится обычно менее одной недели. Многие пациенты чувствуют себя значительно лучше вскоре после люмбальной пункции. Неврологические симптомы, связанные с воспалением менингеальных оболочек у детей раннего возраста, включают ригидность затылочных мышц и выбухание родничка. Симптомы могут носить стертый характер. Развитию серозного менингита часто сопутствуют такие признаки болезни, как повышение температуры, беспокойство, плохой сон, высыпания на кожных покровах, ринит, диарея. В случае легкого течения энтеровирусной инфекции менингеальный синдром у детей протекает доброкачественно и, как правило, быстро, в течение 7 - 10 дней, заканчивается полным выздоровлением без остаточных явлений. Благотворное воздействие на течение серозного менингита оказывает спинальная пункция, ведущая к снижению внутримозгового давления и способствующая быстрому улучшению состояния ребенка.

Прогноз у детей и взрослых, перенесших энтеровирусный менингит, как правило, благоприятный. Есть, однако, указания, что отдельные дети, переболевшие энтеровирусным менингитом, страдают нарушениями речи и имеют трудности в школьном обучении. У взрослых лиц в течение нескольких недель после перенесенной инфекции могут сохраняться головные боли.

Энтеровирусные менингиты могут быть вызваны вирусами Коксаки А и Коксаки В, ECHO, энтеровирусами 68 и 71 серотипов, содержат РНК. Возможны эпидемические вспышки серозных менингитов с высокой контагиозностью. Преимущественно заболевают дети в возрасте 5-9 лет. Заболеваемость значительно повышается весной и летом.

Энтеровирусная инфекция у детей. Симптомы и лечение

Энтеровирусные инфекции – это группа заболеваний, в основе причин которых лежит несколько разновидностей вирусов. Вызывают заболевание вирусы Коксаки, полиовирусы и ЕСНО (экхо). Эти вирусы имеют в своем строении капсулу и ядро, содержащее РНК. Строение капсулы может очень сильно отличаться, поэтому выделяют так называемые серотипы (разновидности). У полиовирусов выделяют 3 серологических типа. Вирусы группы Коксаки делятся на Коксаки А и Коксаки В. У вирусов Коксаки А выделяют 24 серологических разновидности, у Коксаки В – 6. У вирусов ЕСНО выделяют 34 серологических типа. После перенесенной энтеровирусной инфекции образуется стойкий пожизненный иммунитет, однако, он сероспицефичен. Это значит, что иммунитет образуется только к тому серологическому типу вируса, которым переболел ребенок и не защищает его от других разновидностей этих вирусов. Поэтому энтеровирусной инфекцией ребенок может болеть несколько раз за свою жизнь. Так же эта особенность не позволяет разработать вакцину, чтобы защитить наших детей от данного заболевания. Заболевание имеет сезонность: вспышки заболевания чаще всего наблюдаются в летне-осенний период.

Причины заражения энтеровирусной инфекцией

Заражение происходит несколькими путями. Вирусы в окружающую среду могут попадать от больного ребенка или от ребенка, который является вирусоносителем. У вирусоносителей нет никаких проявлений заболеваний, однако вирусы находятся в кишечнике и выделяются в окружающую среду с калом. Такое состояние может наблюдаться у переболевших детей после клинического выздоровления либо у детей, у которых вирус попал в организм, но не смог вызвать заболевание из-за сильного иммунитета ребенка. Вирусоносительство может сохраняться на протяжении 5 месяцев.

Попав в окружающую среду, вирусы могут сохраняться довольно долго, так как хорошо переносят неблагоприятное воздействие. Хорошо сохраняются вирусы в воде и почве, при замораживании могут выживать на протяжении нескольких лет, устойчивы к действию дезинфицирующих средств (при воздействии растворов высокой концентрации фенола, хлора, формалина вирусы начинают погибать только через три часа), однако восприимчивы к действию высоких температур (при нагревании до 45º С погибают через 45-60 секунд). Вирусы хорошо переносят перепады рН среды и отлично себя чувствуют в среде с рН от 2,3 до 9,4, поэтому кислая среда желудка не оказывает на них никакого воздействия и кислота не выполняет своей защитной функции.

Как передается энтеровирусная инфекция

Механизм передачи может быть воздушно-капельный (при чихании и кашле с капельками слюны от больного ребенка к здоровому) и фекально-оральный при не соблюдении правил личной гигиены. Чаще всего заражение происходит через воду, при употреблении сырой (не кипяченой) воды. Так же возможно заражение детей через игрушки, если дети их берут в рот. Болеют чаще всего дети в возрасте от 3 до 10 лет. У детей, находящихся на грудном вскармливании, в организме присутствует иммунитет, полученный от матери через грудное молоко, однако, этот иммунитет не стойкий и после прекращения грудного вскармливания быстро исчезает.

Симптомы энтеровирусной инфекции

В организм вирусы попадают через рот или верхние дыхательные пути. Попав в организм ребенка, вирусы мигрируют в лимфатические узлы, где они оседают и начинают размножаться. Дальнейшее развитие заболевания связано со многими факторами, такими как вирулентность (способность вируса противостоять защитным свойствам организма), тропизмом (склонностью поражать отдельные ткани и органы) вируса и состоянием иммунитета ребенка.

У энтеровирусных инфекций есть как схожие проявления, так и различные, в зависимости от вида и серотипа. Инкубационный период (период от попадания вируса в организм ребенка, до появления первых клинических признаков) у всех энтеровирусных инфекций одинаковый – от 2 до 10 дней (чаще 2-5 дней).

Заболевание начинается остро - с повышения температуры тела до 38-39º С. Температура чаще всего держится 3-5 дней, после чего снижается до нормальных цифр. Очень часто температура имеет волнообразное течение: 2-3 дня держится температура, после чего снижается и 2-3 дня находится на нормальных цифрах, затем снова поднимается на 1-2 дня и вновь нормализуется уже окончательно. При повышении температуры ребенок ощущает слабость, сонливость, может наблюдаться головная боль, тошнота, рвота. При снижении температуры тела все эти симптомы проходят, однако при повторном повышении могут вернуться. Также увеличиваются шейные и подчелюстные лимфоузлы, так как в них происходит размножение вирусов. В зависимости от того, какие органы больше всего поражаются, выделяют несколько форм энтеровирусной инфекции. Энтеровирусы могут поражать: центральную и периферическую нервные системы, слизистую ротоглотки, слизистую глаз, кожу, мышцы, сердце, слизистую кишечника, печень, у мальчиков возможно поражение яичек.

При поражении слизистой ротоглотки происходит развитие энтеровирусной ангины. Она проявляется повышением температуры тела, общей интоксикацией (слабость, головная боль, сонливость) и наличие везикулярной сыпи в виде пузырьков, заполненных жидкостью, на слизистой ротоглотки и миндалинах. Пузырьки эти лопаются, и на их месте образуются язвочки, заполненные белым налетом. После выздоровления на месте язвочек не остается никаких следов.

При поражении глаз развивается конъюнктивит. Он может быть одно- и двусторонним. Проявляется в виде светобоязни, слезотечения, покраснения и припухлости глаз. Возможно наличие кровоизлияний в конъюнктиву глаза.

При поражении мышц развивается миозит – боли в мышцах. Боли появляются на фоне повышения температуры. Болезненность наблюдается в грудной клетке, руках и ногах. Появление болей в мышцах, как и температуры, может носить волнообразный характер. При снижении температуры тела боли уменьшаются или исчезают совсем.

При поражении слизистой кишечника наблюдается наличие жидкого стула. Стул обычной окраски (желтый или коричневый), жидкий, без патологических (слизь, кровь) примесей. Появление жидкого стула может быть как на фоне повышение температуры, так, и изолировано (без повышения температуры тела).

Энтеровирусные инфекции могут поражать различные участки сердца. Так при поражении мышечного слоя развивается миокардит, при поражении внутреннего слоя с захватом клапанов сердца, развивается эндокардит, при поражении внешней оболочки сердца – перикардит. У ребенка может наблюдаться: повышенная утомляемость, слабость, учащенное сердцебиение, падение артериального давления, нарушения ритма (блокады, экстрасистолы), боли за грудиной.

При поражении нервной системы могут развиваться энцефалиты, менингиты. У ребенка наблюдается: сильная головная боль, тошнота, рвота, повышение температуры тела, судороги, парезы и параличи, потеря сознания.

При поражении печени развивается острый гепатит. Он характеризуется увеличением печени, чувством тяжести в правом подреберье, болью в этом месте. Возможно появление тошноты, изжоги, слабости, повышения температуры тела.

При поражении кожи возможно появление экзантемы – гиперемия (красное окрашивание) кожи, чаще всего на верхней половине туловища (голова, грудь, руки), не приподнимается над уровнем кожи, появляется одномоментно.

Также наблюдается энтеровирусная инфекция с кожным проявлением в виде везикулярной сыпи на ладонях и стопах. Пузырьки через 5-6 дней сдуваются, не вскрываясь, и на их месте образовывается участок пигментации (коричневая точка), которая исчезает через 4-5 дней.

У мальчиков возможно наличие воспаления в яичках с развитием орхита. Чаще всего такое состояние развивается через 2-3 недели после начала заболевания с другими проявлениями (ангина, жидкий стул и другие). Заболевание довольно быстро проходит и не несет никаких последствий, однако, в редких случаях возможно развитие в половозрелом возрасте аспермии (отсутствие спермы).

Также существуют врожденные формы энтеровирусной инфекции, когда вирусы попадают в организм ребенка через плаценту от матери. Обычно такое состояние имеет доброкачественное течение и излечивается самостоятельно, однако в некоторых случаях энтеровирусная инфекция может вызвать прерывание беременности (выкидыш) и развитие у ребенка синдрома внезапной смерти (смерть ребенка наступает на фоне полного здоровья).

Очень редко возможно поражение почек, поджелудочной железы, легких. Поражение различных органов и систем может наблюдаться как изолированное, так и сочетанное.

Диагностика энтеровирусной инфекции

Диагноз энтеровирусной инфекции подтверждается только лабораторно – обнаружение энтеровирусов или их рибонуклеиновой кислоты (РНК) в стерильных типах клинического материала, а также выявление энтеровирусов или их РНК в двух пробах нестерильных клинических материалов разных типов.

Лечение энтеровирусной инфекции

Специфического лечения энтеровирусной инфекции не существует. Лечение проводят в домашних условиях, госпитализация показана при наличии поражения нервной системы, сердца, высокой температуры, которая долго не поддается снижению при использовании жаропонижающих средств. Ребенку показан постельный режим на весь период повышения температуры тела. Питание должно быть легким, богатым белками. Необходимо достаточное количество жидкости: кипяченая вода, минеральная вода без газов, компоты, соки, морсы.

Лечение проводят симптоматически в зависимости от проявлений инфекции – ангина, конъюнктивит, миозит, жидкий стул, поражения сердца, энцефалиты, менингиты, гепатит, экзантема, орхит. В некоторых случаях (ангина, понос, конъюнктивит и др.) проводят профилактику бактериальных осложнений.

Дети изолируются из организованного коллектива на весь период заболевания. В детском коллективе могут находиться после исчезновения всех симптомов заболевания.

Профилактика энтеровирусной инфекции

Для профилактики необходимо соблюдение правил личной гигиены: мыть руки после посещения туалета, прогулки на улице, пить только кипяченую воду или воду из заводской бутылки, недопустимо использование для питья ребенка воды из открытого источника (река, озеро).

Специфической вакцины против энтеровирусной инфекции не существует, так как в окружающей среде присутствует большое количество серотипов этих вирусов. Однако в Европе часто используют вакцины, содержащие наиболее часто встречающиеся энтеровирусные инфекции (Коксаки А-9, В-1, ЕСНО -6). Использование таких вакцин снижает риск заболеваемости у детей энтеровирусными инфекциями.

Начинается сезон энтеровирусных инфекций, будьте внимательнее к своему здоровью и соблюдайте все рекомендованные правила профилактики энтеровирусных инфекций.


Управление Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человекапо Ханты-Мансийскому автономному округу - Югре

Роспотребнадзор напоминает о профилактике энтеровирусных инфекции в летний период

Ежегодно в весенне-летний период отмечается подъем уровня заболеваемости энтеровирусными инфекциями на территории России и других стран.

Случаи энтеровирусной инфекции (далее ЭВИ) в Советском районе и г. Югорске стали регистрироваться с 2017 года, когда была налажена регистрация и лабораторное подтверждение методом ПЦР случаев энтеровирусной инфекции. С того времени каждый год регистрируется до десятка случаев этой инфекции. Выявляются и завозные случаи из других стран, например - из Турции.

В 2019 году зарегистрирована вспышка энтеровирусной инфекции среди военнослужащих в воинской части № 40278-17, микрорайон Югорск-2 г. Югорска – 13 человек, диагнозы подтверждены лабораторно методом ПЦР.

Ежегодно в рамках эпидмониторинга проводится исследование сточных вод и воды рекреационных зон на энтеровирусы. Обнаружение в сточной воде РНК-энтеровируса свидетельствует о циркуляции ЭВИ среди населения.

ЧТО ТАКОЕ  ЭНТЕРОВИРУСНАЯ ИНФЕКЦИЯ И ЧЕМ ОНА ОПАСНА.

Энтеровирусная инфекция – это группа острых инфекционных болезней, вызываемые кишечными вирусами (энтеровирусами), характеризующихся лихорадкой и полиморфизмом клинических симптомов.

Возбудители инфекции – энтеровирусы групп Коксаки А, Коксаки В, ЕСНО. Вирусы устойчивы во внешней среде, устойчивы к низким температурам, заморозке и оттаиванию. При комнатной температуре способны выживать до 15 суток. Погибают при кипячении, высушивании и дезинфекции.

Единственным источником инфекции является человек, больной клинически выраженной формой, с бессимптомным течением или вирусоноситель, который выделяет вирусы в окружающую среду с испражнениями, а также с отделяемым верхних дыхательных путей.

Механизм передачи инфекции – фекально-оральный.

Основные пути передачи инфекции – водный (при купании в водоемах зараженных энтеровирусами) и алиментарный (употребление в пищу зараженной воды, грязных овощей и фруктов, молока и других продуктов). Не исключен и воздушно-капельный путь передачи (при чихании, кашле, разговоре).

Клиническая картина.

  • Инкубационный период составляет от 2 до 10 суток.

Общие для всех форм симптомы:

  • Острое начало с повышением температуры тела до 38-39оС.
  • Головная боль.
  • Боли в мышцах.
  • Тошнота, рвота.
  • Гиперемия лица и шеи, слизистых оболочек миндалин, мягкого неба, глотки.
  • Увеличение шейных лимфатических узлов.

Профилактика энтеровирусных инфекций.

Специфическая профилактика не разработана. Сегодня ученые работают над разработкой вакцины. Необходимо проводить следующий комплекс мероприятий:

  • Мероприятия по контролю загрязнений объектов окружающей среды канализационными отходами.
  • Благоустройство источников водоснабжения.
  • Ранняя диагностика и изоляция больных на 2 недели.
  • Текущая и заключительная дезинфекция в очаге инфекции.
  • Гигиеническое воспитание детей и подростков (мытье рук перед едой и после туалета, соблюдение гигиены).
  • Детям до 3 лет, имевшим контакт с больными, назначают интерферон и иммуноглобулин интраназально на 7 дней.
  • Не допускать больного ребенка в детское образовательное учреждение

Что нужно знать, чтобы избежать заражения?

  • Всегда мойте руки с мылом после посещения туалета, перед едой, после смены подгузника у детей.
  • Всегда тщательно мойте фрукты и овощи перед употреблением кипяченой или бутилированной водой.
  • Избегай контактов с людьми с признаками инфекционного заболевания, с сыпью, температурой и другими симптомами.
  • Купайтесь только в тех бассейнах, где происходит обеззараживание воды. Не заглатывай воду во время купания.
  • Купайтесь только в тех водоемах, где купание разрешено, где не установлена табличка «купание запрещено».
  • Защищайте пищу от мух и насекомых.
  • Не трогайте лицо, нос, глаза грязными руками.
  • Пейте только бутилированную воду.
  • Не используйте лед для охлаждения напитков, приготовленный из воды неизвестного качества.
  • Не покупайте напитки и пищу у уличных торговцев.
  • Употребляйте термически обработанную пищу.

При появлении симптомов инфекционных заболеваний – немедленно обратитесь к врачу.

Крылова Ирина Алексеевна, главный специалист-эксперт

Просмотров: 310

Энтеровирус - обзор | Темы ScienceDirect

Введение

Энтеровирусы являются одними из самых распространенных инфекций человека и, по оценкам, заражают 50 миллионов человек ежегодно в США и 1 миллиард ежегодно во всем мире. Хотя большинство (~ 90%) инфекций протекает бессимптомно, энтеровирусы связаны с широким спектром проявлений заболевания, включая лихорадку и сыпь, острый геморрагический конъюнктивит, инфекцию верхних дыхательных путей, миокардит и перикардит, плевродинию, асептический менингит, энцефалит, полиомиелит. , тяжелая неонатальная инфекция и хроническая инфекция у пациентов с ослабленным иммунитетом.Большинство острых энтеровирусных инфекций (> 80%) возникает у детей в возрасте до 15 лет, отчасти из-за отсутствия иммунологического опыта и перекрестного защитного иммунитета от энтеровирусной инфекции, а также из-за поведения детей, которое способствует фекально-оральному и передача инфекции от человека к человеку.

Человеческие энтеровирусы - это небольшие вирусы с положительной РНК, которые принадлежат к семейству Picornaviridae и традиционно подразделяются на эховирусы, вирусы Коксаки А и В и полиовирусы на основе их свойств роста в культуре клеток и у новорожденных мышей.Поскольку эта система классификации в некоторой степени произвольна, с середины 1960-х вновь идентифицированным энтеровирусам просто присваивались числовые обозначения, первым из которых был «энтеровирус D68». Число отдельных штаммов энтеровирусов, признанных в настоящее время, превышает 120. Недавний молекулярный анализ генома энтеровирусов привел к принятию новой таксономии, в которой энтеровирусы делятся на четыре вида: энтеровирусы человека A, B, C и D. 1

В этой главе представлены эпидемиология, патофизиология, клинические проявления, дифференциальная диагностика и лечение энтеровирусных инфекций, вызывающих неврологические заболевания, в частности полиовирусов и энтеровируса A71.Энтеровирусы, которые преимущественно вызывают только кожно-слизистые заболевания, обсуждаются в главе 32.3.

Детские энтеровирусные инфекции: основы практики, история вопроса, патофизиология

Автор

Дэниел Оуэнс, BM, MRCPCH (Великобритания) Научный сотрудник по клиническим исследованиям, Центр клинических исследований NIHR, Больница общего профиля Саутгемптона, Великобритания

Раскрытие: Ничего не разглашать.

Соавтор (ы)

Саул Н. Фауст, MA, MBBS, PhD, MRCPCH (Великобритания) Старший преподаватель детской иммунологии и инфекционных заболеваний, Медицинский факультет Саутгемптонского университета; Директор Центра клинических исследований NIHR, Университетская больница Саутгемптона, Фонд NHS Foundation Trust, Великобритания

Сол Н. Фауст, Массачусетс, MBBS, доктор философии, MRCPCH (Великобритания) является членом следующих медицинских обществ: Британской педиатрической группы аллергии, иммунитета и инфекций, Европейской Общество детских инфекционных заболеваний, Международное общество инфекционных заболеваний, Королевский колледж педиатрии и здоровья детей

Раскрытие информации: выступать (d) в качестве докладчика или члена бюро докладчиков по вопросам: менингококковых вакцин Pfizer
Получен грант на исследования от : Учреждение Pfizer
(без личных гонораров) получало консультационные услуги от Pfizer, Sanofi, Seqrius, Merck, Medimmune, AstraZeneca.

Специальная редакционная коллегия

Мэри Л. Виндл, PharmD Адъюнкт-профессор, Фармацевтический колледж Медицинского центра Университета Небраски; Главный редактор Medscape Drug Reference

Раскрытие информации: нечего раскрывать.

Mark R Schleiss, MD Minnesota Американский легион и вспомогательный фонд исследований сердца Председатель педиатрии, профессор педиатрии, директор отделения, Отделение инфекционных болезней и иммунологии, Департамент педиатрии, Медицинская школа Университета Миннесоты

Mark R Schleiss, MD является членом следующих медицинских обществ: Американского педиатрического общества, Американского общества инфекционных болезней, Общества педиатрических инфекционных болезней, Общества педиатрических исследований

Раскрытие информации: не подлежит разглашению.

Главный редактор

Рассел Стил, доктор медицины Клинический профессор, Медицинский факультет Тулейнского университета; Врач, штатный врач, Ochsner Clinic Foundation

Рассел Стил, доктор медицины, является членом следующих медицинских обществ: Американской академии педиатрии, Американской ассоциации иммунологов, Американского педиатрического общества, Американского общества микробиологии, Американского общества инфекционных болезней, Медицинского центра штата Луизиана Общество, Общество детских инфекционных болезней, Общество педиатрических исследований, Южная медицинская ассоциация

Раскрытие информации: нечего раскрывать.

Дополнительные участники

Джозеф Домачовске, доктор медицины Профессор педиатрии, микробиологии и иммунологии, кафедра педиатрии, отделение инфекционных заболеваний, Медицинский университет штата Нью-Йорк

Джозеф Домачовске, доктор медицины, является членом следующих медицинских обществ: Alpha Omega Alpha , Американская академия педиатрии, Американское общество микробиологии, Общество инфекционных заболеваний Америки, Общество педиатрических инфекционных болезней, Phi Beta Kappa

Раскрытие: Получен грант на исследования от: Pfizer; GlaxoSmithKline; AstraZeneca; Merck; Американской академии педиатрии, Novavax, Regeneron , Diassess, Actelion
Полученный доход в размере 250 долларов США или более от: Sanofi Pasteur.

Леонард Р. Крылов, доктор медицины Заведующий отделением детских инфекционных болезней и международного усыновления, заместитель председателя педиатрического отделения больницы Уинтропского университета; Профессор педиатрии Медицинского факультета Университета Стони Брук

Леонард Р. Крылов, доктор медицинских наук, является членом следующих медицинских обществ: Американской академии педиатрии, Американского педиатрического общества, Американского общества инфекционных болезней, Общества педиатрических инфекционных болезней, Общества педиатрических исследований

Раскрытие информации: раскрывать нечего.

Mobeen H Rathore, MD, CPE, FAAP, FIDSA Начальник отдела детских инфекционных заболеваний / иммунологии, заместитель председателя педиатрического отделения Медицинского колледжа Университета Флориды в Джексонвилле; Эпидемиолог больницы и начальник отдела инфекционных болезней и иммунологии детской больницы Вольфсона; Директор Центра исследований, образования и обслуживания в области ВИЧ / СПИДа Университета Флориды (UF CARES)

Мобин Х. Ратор, доктор медицины, CPE, FAAP, FIDSA является членом следующих медицинских обществ: Американской академии педиатрии, Американского общества микробиологов. , Медицинская ассоциация Флориды, Общество инфекционных болезней Америки, Общество педиатрических инфекционных болезней, Общество эпидемиологии здравоохранения Америки, Общество педиатрических исследований, Южная медицинская ассоциация, Южное общество педиатрических исследований, Флоридское отделение Американской академии педиатрии, Педиатрическое общество Флориды , Европейское общество детских инфекционных болезней

Раскрытие информации: нечего раскрывать.

Николас Джон Беннетт, MBBCh, PhD, MA (Cantab), FAAP Ассистент профессора педиатрии, содиректор отдела управления противомикробными препаратами, медицинский директор, Отделение детских инфекционных заболеваний и иммунологии Детского медицинского центра Коннектикута

Николас Джон Беннетт, MBBCh, PhD, MA (Cantab), FAAP является членом следующих медицинских обществ: Alpha Omega Alpha, Американская академия педиатрии

Раскрытие информации: получен исследовательский грант от: Cubist
Полученный доход в размере не менее чем 250 долларов от: Horizon Pharmaceuticals, Shire
Юридические консультации по вопросам Medico: Разн.

Благодарности

Авторы и редакторы eMedicine выражают признательность предыдущему автору Мишель Мовад, доктору медицины, за вклад в первоначальное написание и разработку этой статьи.

Рис. 5 представляет собой фотографию случая атипичной HFMD, которую видели д-р Генри Федер и д-р Николас Беннетт. Разрешение на использование фотографии было предоставлено семьей пациента. Изображение перепечатано из The Lancet Infectious Diseases, Vol.14 (1), Федер, Беннет и Модлин, Атипичное заболевание рук, ног и рта: пузырно-пузырчатая сыпь, вызванная вирусом Коксаки A6, страницы 83-86., Copyright (2014), с разрешения Elsevier.

Род: Enterovirus - Picornaviridae - Вирусы с положительной РНК

Отличительные признаки

Род выделяется на основе генетических признаков.

Вирион

Морфология

Кристаллические структуры многих энтеровирусов были разрешены ( энтеровирус A : вирус Коксаки A7, вирус Коксаки A16, энтеровирус A71; энтеровирус B : вирус Коксаки A9, вирус Коксаки В3, эховирус 1, эховирус 7, эховирус 11, эховирус 11, эховирус 11 вирус 1; энтеровирус C : полиовирус 1, полиовирус 2, полиовирус 3, вирус Коксаки A21, вирус Коксаки A24; энтеровирус D : энтеровирус D68; энтеровирус E : энтеровирус E1; риновирус A : риновирус A : риновирус A : риновирус A16; Риновирус B : риновирус B14; Риновирус C : риновирус C15).CP 1B, 1C и 1D энтеровирусов и риновирусов человека являются одними из самых крупных в семействе (длина цепи VP1-3, 238–302 а.о.), и это отражается в типичных длинных петлях между β-цепями, больше, чем средняя толщина стенки капсида (46 Å) и рельеф поверхности, который сильно выражен по сравнению с большинством других пикорнавирусов. Возвышенный участок на 5-кратной оси окружает глубокая бороздка 25 Å, или «каньон», с которым связывается клеточный рецептор полиовируса. Сайт связывания карманного фактора находится под дном этого каньона внутри 1D β-бочки.Вирионы могут быть преобразованы различными способами (мягкое нагревание, связывание с рецептором или нейтрализующими антителами) в измененные («А») частицы 135S, в которых отсутствует 1А (VP4) и которые обладают измененной антигенностью.

Физико-химические и физические свойства

Кислотостойкость переменная. Вирионы большинства энтеровирусов стабильны при pH 3,0, в то время как вирионы риновирусов нестабильны при pH 5–6. Точно так же плавучая плотность в CsCl вирионов энтеровирусов составляет 1,30–1,34 г / см -3 , а у риновирусов - от 1.От 38 до 1,42 г см -3 . Иногда небольшая доля (около 1% населения) тяжелых частиц (плотность: 1,43 г / см -3 ) может наблюдаться для энтеровирусов. В вирусных препаратах часто наблюдаются пустые капсиды.

Нуклеиновая кислота

Геном (Китамура и др., 1981, Раканиелло и Балтимор 1981, ван дер Верф и др., 1981): c. 7 100–7450 нуклеотидов (5'-UTR: 610-822 нуклеотидов; ORF: 6,417-6 645 нуклеотидов; 3'-UTR: 37-99 нуклеотидов). Геном содержит IRES типа I и не содержит поли (C) тракта. cre расположен в 2C (члены Enterovirus A , Enterovirus B , Enterovirus C и Enterovirus D ) или 2A (члены Rhinovirus A ) или 1D (члены Rhinovirus B ). ) или 1B (представители Enterovirus C ). Идентичность последовательностей для различных энтеровирусов или между энтеровирусами и риновирусами составляет более 50% по геному в целом, хотя она может быть больше или меньше для конкретных областей генома.5'-UTR риновирусов человека короче (примерно 650 нуклеотидов), чем у энтеровирусов, из-за делеции примерно 100 нуклеотидов между IRES и сайтом начала трансляции. Некоторые представители Enterovirus C и Enterovirus D также имеют меньшие делеции в этой области. Члены энтеровируса E и энтеровируса F имеют несовершенную дупликацию первых ~ 100 нуклеотидов, позволяющую формировать вторую структуру РНК, подобную листу клевера. Члены Enterovirus G имеют вставку примерно на 30 нуклеотидов примерно в 65 нуклеотидах от 5'-конца генома, что приводит к более длинной петле-стебле D в структуре клеверного листа.Различные размеры делеции в одном и том же регионе наблюдались у некоторых энтеровирусов человека. Открытая рамка считывания (uORF), кодирующая дополнительный полипептид из 67 аминокислот, названный UP, была предложена для EV-7 и других энтеровирусов (Lulla et al., 2019).

Организация и репликация генома

Схема генома:

VPg + 5'-UTR IRES-I - [1A-1B-1C-1D / 2A1 pro (/ 2A2 pro ) -2B-2C1 hel (-2C2 pro ) / 3A- 3B-3C-3D] -3'UTR-poly (A)

Выведенный полипротеин энтеровирусов колеблется от 2138 до 2214 аминокислот.Геномы не кодируют L-белок. Белок 2A обладает протеиназной активностью с остатком цистеина в активном центре (2A pro ), который относится к семейству небольших бактериальных сериновых протеаз, расщепляет полипротеин на его собственном N-конце. Члены Enterovirus K имеют второй 2A pro с остатком серина в активном центре. Различные штаммы энтеровируса G имеют свиной торовирус-подобный участок, кодирующий цистеиновую протеазу, вставленный между областями гена 2C и 3A.Определенные гидрофобные молекулы, которые связываются с капсидом, конкурируя с карманным фактором, оказывают мощное противовирусное действие, препятствуя связыванию рецептора и / или снятию покрытия. Описаны противовирусные препараты, связывающие карманы.

Биология

Вирусы размножаются в основном в желудочно-кишечном тракте или верхних дыхательных путях, а иногда и в том, и в другом, но они также могут размножаться в других тканях, например, в нервах, мышцах и т. Д. Инфекция часто может протекать бессимптомно. Клинические проявления включают простуду, менингит легкой степени, энцефалит, миелит, миокардит и конъюнктивит.Вирус везикулярной болезни свиней представляет собой вариант вируса Коксаки В5 и вызывает везикулярную болезнь у свиней, клинически неотличимую от ящура (род Aphthovirus ) и везикулярной болезни свиней, вызываемой вирусом долины Сенека (род Senecavirus ). Cap-зависимая трансляция мРНК хозяина ингибируется 2A pro , который расщепляет эукариотический фактор инициации хозяина 4G (eIF-4G). Многие молекулы на поверхности клетки, многие из которых не охарактеризованы, служат вирусными рецепторами.Хорошо охарактеризованные взаимодействия рецептор / вирус включают рецептор полиовируса (PVR) / полиовирусы, вирусы Коксаки-аденовируса (CAR) / вирусы Коксаки B, молекулу межклеточной адгезии 1 (ICAM-1) / риновирусы «основной группы» и некоторые представители Энтеровирус C видов, рецептор липопротеинов низкой плотности (LDLR) / риновирусы «минорной группы», фактор ускорения распада (DAF) / различные энтеровирусы, интегрин VLA-2 / эховирус 1 и сиаловая кислота / энтеровирус D70. Полиовирус типа 2, представитель вида Enterovirus C , как полагают, был искоренен в результате вмешательства человека из обращения в человеческих популяциях.

Антигенность

Примерно 75 серотипов энтеровирусов и 100 серотипов риновирусов были классифицированы посредством нейтрализации инфекционности.

Получение имен

Энтеровирус : от греческого entero n , «кишечник»

Критерии демаркации видов

Представители вида рода Enterovirus :

  • имеют менее 30% расхождения в последовательности аминокислот полипротеина
  • отличаются менее чем на 40% в последовательности P1 aa
  • отличаются менее чем на 30% в последовательности неструктурных белков 2C + 3CD
  • имеют общую геномную организацию

Дивергенция (количество различий на сайт между последовательностями) между представителями разных видов Enterovirus колеблется от 0.29–0,59 для P1 и 0,1–0,48 для 3CD.

Более 300 типов вирусов были генетически охарактеризованы филогенетической кластеризацией (Oberste et al., 1999, Palmenberg et al., 2009, Simmonds et al., 2010, McIntyre et al., 2013). Энтеровирус A : 25 типов, Энтеровирус B : 63 типа, Энтеровирус C : 23 типа, Энтеровирус D : 5 типов, Энтеровирус E : 5 типов, Энтеровирус F : 7 типов, Энтеровирус G : 22 типа, Энтеровирус H : 1 тип, Энтеровирус I : 1 тип, Энтеровирус J : 6 типов, Энтеровирус K : 2 типа, Энтеровирус L : 1 тип, Риновирус A : 80 типов, Риновирус B : 32 типа, Риновирус C : 57 типов.Недавно были опубликованы рекомендации по номенклатуре энтеровирусов (Simmonds et al., 2020).

Виды-члены

Образцовый изолят вида

А3 Вирус 9029 9029 CVA2 A

Полный геном 9030 Энтеровирус B -1 (Огайо / США / 47) 298 X iev 903 903 Echovirus 16300 9029 3 Энтеровирус B 9029 B 9029 8 Caldwell (Канзас / 55) -12 ген CA CA EV-B290ov2 9031 9 EV-B86 9030 9030 -B88 19 Enter300 Вирус 19 Enter300 19 - 9 25 ген CVA EV-C196 / BBla Полный геном 8 0 E ; JQ6 ген геном F 1960) 3 / KOR 6 EV-G8 19 sw / 744257/2012 / Вьетнам sw / 714270 / CaoLanh / VN / 2012-02-16

19674 9 0298 энтеровирус J115 энтеровирус L1 rhinovirus A 90 319 903 FJ445127 геном Риновирус A 8 A 9029 9029 9029 -A38 вирус 90 геном 14 FJ445144 геном Риновирус A 9 0319 RV296 902 98 RV-A67 9030

9030 A78 298 90 Риновирус A A A3 B3 FJ -B5 Rhinirus Rhinirus / 59) 300 Вирус 90 319 Вирус 9030 Вирус 300 Rhinovirus 300 1 / ATCC VR-1189 903ov 902 80 9 0298 C4 -C7 C8_300 Rhinov300 903 C Rhinovirus 10 - C8_300 rhinov300 3 9029 C3 903 19 9029 8 RV-C42 90 319 RV-C50 9030 9030 RV-C50 69

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ламберт, Э. Х. (1966). Дефекты нервно-мышечной передачи при синдромах, отличных от миастении. Ann. Акад. Sci. 135, 367–384. DOI: 10.1111 / j.1749-6632.1966.tb45484.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ли Ю. Р., Ван П. С., Ван Дж. Р. и Лю Х. С. (2014). Аутофагия, индуцированная энтеровирусом 71, увеличивает репликацию вируса и патогенез в модели сосущих мышей. J. Biomed. Sci. 21:80. DOI: 10.1186 / s12929-014-0080-4

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ли, Л., Фань, Х., Сун, З., Лю, X., Бай, Дж., И Цзян, П. (2019a). Белок 2C вируса энцефаломиокардита противодействует сигнальному пути интерферона-бета посредством взаимодействия с MDA5. Antiviral Res. 161, 70–84. DOI: 10.1016 / j.antiviral.2018.10.010

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ли Т.Ф., Хосмилло, М., Шванке, Х., Шу, Т., Ван, З., Инь, Л. и др. (2018b). Человеческий норовирус NS3 обладает РНК-геликазой и шаперонирующей активностью. J. Virol. 92, e01606 – e01617. DOI: 10.1128 / JVI.01606-17

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ли Ю., Цзянь X., Инь П., Чжу Г. и Чжан Л. (2019b). Выявление хозяина, взаимодействующего с EV-A71 2C, выявляет факторы вирусной зависимости. Фронт. Microbiol. 10: 636. DOI: 10.3389 / fmicb.2019.00636

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ли, Д., Лей, К., Сюй, З., Ян, Ф., Лю, Х., Чжу, З. и др. (2016a). Неструктурный белок 3A вируса ящура подавляет сигнальный путь интерферона-бета. Sci. Реп. 6: 21888. DOI: 10.1038 / srep21888

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ли, З., Нин, С., Су, X., Лю, X., Ван, Х., Лю, Ю. и др. (2018c). Энтеровирус 71 противодействует ингибированию внутреннего противовирусного фактора хозяина A3G. Nucleic Acids Res. 46, 11514–11527.DOI: 10.1093 / nar / gky840

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Li, J., Pan, H., Wang, X., Zhu, Q., Ge, Y., Cai, J., et al. (2018a). Эпидемиологический надзор за болезнями рук, ящура и рта в Шанхае в 2014-2016 гг., До внедрения вакцины против энтеровируса 71. Emerg. Микробы заражают. 7:37. DOI: 10.1038 / s41426-018-0035-z

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ли, К., Чжэн, З., Лю, Ю., Zhang, Z., Liu, Q., Meng, J., et al. (2016b). Белки 2С энтеровирусов подавляют фосфорилирование IKKbeta путем привлечения протеинфосфатазы 1. J. Virol. 90, 5141–5151. DOI: 10.1128 / JVI.03021-15

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Линдквист, С., Стангел, М. (2011). Обновленная информация о вариантах лечения миастенического синдрома Ламберта-Итона: акцент на использовании амифампридина. Neuropsychiatr. Дис. Относиться. 7, 341–349. DOI: 10.2147 / NDT.S10464

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Лю Ю., Ван, К., Мюллер, С., Пол, А. В., Виммер, Э., и Цзян, П. (2010). Прямое взаимодействие между двумя вирусными белками, неструктурным белком 2C и капсидным белком VP3, необходимо для морфогенеза энтеровируса. PLoS Pathog. 6: e1001066. DOI: 10.1371 / journal.ppat.1001066

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Лю, Х., Чжу, З., Сюэ, К., Ян, Ф., Цао В., Чжан К. и др. (2019). Вирус ящура противодействует опосредованным NOD2 противовирусным эффектам, подавляя экспрессию белка NOD2. J. Virol. 93, e00124 – e00119. DOI: 10.1128 / JVI.00124-19

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Лью, Х., Доробанту, К. М., ван дер Шаар, Х. М., и ван Куппевельд, Ф. Дж. М. (2017). Модуляция протеолитического процессинга полипротеина мутантами вируса Коксаки, устойчивыми к ингибиторам, нацеленным на фосфатидилинозитол-4-киназу IIIbeta или оксистерин-связывающий белок. Antiviral Res. 147, 86–90. DOI: 10.1016 / j.antiviral.2017.10.006

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ма, К., Ху, Ю., Чжан, Дж., И Ван, Дж. (2020). Фармакологическая характеристика механизма действия R523062, перспективного противовирусного средства против энтеровируса D68. ACS Infect. Дис. 6, 2260–2270. DOI: 10.1021 / acsinfecdis.0c00383

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Манганаро, Р., Zonsics, B., Bauer, L., Lorenzo Lopez, M., Donselaar, T., Zwaagstra, M., et al. (2020). Синтез и противовирусное действие новых аналогов флуоксетина как ингибиторов энтеровируса 2С. Antiviral Res. 178: 104781. DOI: 10.1016 / j.antiviral.2020.104781

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Макминн, П. С. (2002). Обзор эволюции энтеровируса 71 и его клинического значения и значения для общественного здравоохранения. FEMS Microbiol. Ред. 26, 91–107.DOI: 10.1111 / j.1574-6976.2002.tb00601.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Морелли Э., Гинефра П., Мастродонато В., Безнуссенко Г. В., Рустен Т. Э., Билдер Д. и др. (2014). Множественные функции белка SNARE Snap29 в аутофагии, эндоцитозе и экзоцитозе во время формирования эпителия у Drosophila . Аутофагия 10, 2251–2268. DOI: 10.4161 / 15548627.2014.981913

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Мушаррафие, Р., Zhang, J., Tuohy, P., Kitamura, N., Bellampalli, S. S., Hu, Y., et al. (2019). Открытие аналогов хинолина как мощных противовирусных средств против энтеровируса D68 (EV-D68). J. Med. Chem. 62, 4074–4090. DOI: 10.1021 / acs.jmedchem.9b00115

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Нордер, Х., Де Пальма, А. М., Селиско, Б., Костенаро, Л., Папагеоргиу, Н., Арнан, К. и др. (2011). Неструктурные белки пикорнавируса как мишени для новых антивирусных препаратов с широкой активностью. Antiviral Res. 89, 204–218. DOI: 10.1016 / j.antiviral.2010.12.007

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

О’Доннелл, В., Пачеко, Дж. М., ЛаРокко, М., Беррейдж, Т., Джексон, В., Родригес, Л. Л. и др. (2011). Вирус ящура использует аутофагический путь во время репликации вируса. Вирусология 410, 142–150. DOI: 10.1016 / j.virol.2010.10.042

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Пауль, А.В., Молла А. и Виммер Э. (1994). Исследования предполагаемой амфипатической спирали на N-конце полиовирусного белка 2C. Вирусология 199, 188–199. DOI: 10.1006 / viro.1994.1111

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Пол А. В., Петерс Дж., Мугаверо Дж., Инь Дж., Ван Бум Дж. Х. и Виммер Э. (2003). Биохимические и генетические исследования реакции уридилилирования VPg, катализируемой РНК-полимеразой полиовируса. J. Virol. 77, 891–904.DOI: 10.1128 / jvi.77.2.891-904.2003

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Пфистер Т., Джонс К. В. и Виммер Э. (2000). Богатый цистеином мотив в белке 2С полиовируса (АТФаза) участвует в репликации РНК и связывает цинк in vitro. J. Virol. 74, 334–343. DOI: 10.1128 / jvi.74.1.334-343.2000

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Пфистер Т. и Виммер Э. (1999). Характеристика нуклеозидтрифосфатазной активности полиовирусного белка 2C раскрывает механизм, с помощью которого гуанидин ингибирует репликацию полиовируса. J. Biol. Chem. 274, 6992–7001. DOI: 10.1074 / jbc.274.11.6992

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Пинкус, С. Э., Даймонд, Д. К., Эмини, Э. А., и Виммер, Э. (1986). Отобранные гуанидином мутанты полиовируса: картирование точечных мутаций полипептида 2C. J. Virol. 57, 638–646. DOI: 10.1128 / JVI.57.2.638-646.1986

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Пинкус, С. Э., Рол, Х., Виммер, Э.(1987). Гуанидин-зависимые мутанты полиовируса: идентификация трех классов с различными требованиями к росту. Вирусология 157, 83–88. DOI: 10.1016 / 0042-6822 (87) -3

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ридер, Э., Пол, А. В., Ким, Д. У., ван Бум, Дж. Х., и Виммер, Э. (2000). Генетические и биохимические исследования цис-действующего элемента репликации полиовируса cre в связи с уридилилированием VPg. J. Virol. 74, 10371–10380.DOI: 10.1128 / jvi.74.22.10371-10380.2000

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Райтсел, У. А., Дайс, Дж. Р., Мак, А. Р., Тимм, Э. А., Мак, Л. И. младший, Диксон, Г. Дж. И др. (1961). Противовирусный эффект гуанидина. Science 134, 558–559. DOI: 10.1126 / science.134.3478.558

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Родригес П. Л. и Карраско Л. (1993). Белок 2С полиовируса обладает активностью АТФазы и ГТФазы. J. Biol. Chem. 268, 8105–8110.

PubMed Аннотация | Google Scholar

Родригес П. Л. и Карраско Л. (1995). Белок 2C полиовируса содержит две области, участвующие в активности связывания РНК. J. Biol. Chem. 270, 10105–10112. DOI: 10.1074 / jbc.270.17.10105

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Садегипур, С., Бек, Э. Дж., И Макминн, П. К. (2012). Отбор и характеристика гуанидин-устойчивых мутантов энтеровируса человека 71. Virus Res. 169, 72–79. DOI: 10.1016 / j.virusres.2012.07.005

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Сато М., Танака Н., Хата Н., Ода Э. и Танигучи Т. (1998). Участие фактора транскрипции IRF-3 семейства IRF в индуцированной вирусом активации гена IFN-бета. FEBS Lett. 425, 112–116. DOI: 10.1016 / s0014-5793 (98) 00210-5

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Сондерс, К., Кинг, А. М., МакКахон, Д., Ньюман, Дж. У., Слэйд, В. Р., и Форсс, С. (1985). Рекомбинация и олигонуклеотидный анализ мутантов вируса ящура, устойчивого к гуанидину. J. Virol. 56, 921–929. DOI: 10.1128 / JVI.56.3.921-929.1985

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ши, Ю., Хе, X., Чжу, Г., Ту, Х., Лю, З., Ли, В. и др. (2015). Вирус Коксаки A16 вызывает неполную аутофагию с участием путей mTOR и ERK. PLoS One 10: e0122109.DOI: 10.1371 / journal.pone.0122109

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Симидзу, Х., Аго, М., Аго, Й., Йошида, Х., Йошии, К., Йонеяма, Т. и др. (2000). Мутации в области 2C полиовируса, ответственные за изменение чувствительности к производным бензимидазола. J. Virol. 74, 4146–4154. DOI: 10.1128 / jvi.74.9.4146-4154.2000

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Шу, Т., Ган, Т., Бай, П., Ван, X., Qian, Q., Zhou, H., et al. (2019). Вирус Эбола VP35 обладает новой активностью, подобной NTPазе и геликазе. Nucleic Acids Res. 47, 5837–5851. DOI: 10.1093 / nar / gkz340

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Синглтон, М. Р., Диллингем, М. С., Уигли, Д. Б. (2007). Структура и механизм геликаз и транслоказ нуклеиновых кислот. Annu. Rev. Biochem. 76, 23–50. DOI: 10.1146 / annurev.biochem.76.052305.115300

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

вс, Ю.С., Се, П. Ю., Ли, Дж. С., Пао, Ю. Х., Чен, К. Дж. И Хван, Л. Х. (2020). Семейство шаперонов белков теплового шока 70 регулирует все фазы жизненного цикла энтеровируса A71. Фронт. Microbiol. 11: 1656. DOI: 10.3389 / fmicb.2020.01656

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Сухи, Д. А., Гиддингс, Т. Х. мл., И Киркегаард, К. (2000). Ремоделирование эндоплазматического ретикулума под действием полиовирусной инфекции и отдельных вирусных белков: аутофагия происхождения везикул, индуцированных вирусом. J. Virol. 74, 8953–8965. DOI: 10.1128 / jvi.74.19.8953-8965.2000

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Такеучи, О., Акира, С. (2009). Врожденный иммунитет к вирусной инфекции. Immunol. Ред. 227, 75–86. DOI: 10.1111 / j.1600-065X.2008.00737.x

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Tang, Q., Xu, Z., Jin, M., Shu, T., Chen, Y., Feng, L., et al. (2020). Идентификация производных дибукаина как новых эффективных ингибиторов геликазы энтеровируса 2С: исследование in vitro, in vivo и комбинированной терапии. Eur. J. Med. Chem. 202, 112310. DOI: 10.1016 / j.ejmech.2020.112310

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Tang, W. F., Yang, S. Y., Wu, B. W., Jheng, J. R., Chen, Y. L., Shih, C.H., et al. (2007). Ретикулон 3 связывает белок 2C энтеровируса 71 и необходим для репликации вируса. J. Biol. Chem. 282, 5888–5898. DOI: 10.1074 / jbc.M611145200

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Тетерина, Н.Л., Горбаленя А. Э., Эггер Д., Биенц К. и Эренфельд Э. (1997). Белковые детерминанты полиовируса 2С связывания и перестройки мембран в клетках млекопитающих. J. Virol. 71, 8962–8972. DOI: 10.1128 / JVI.71.12.8962-8972.1997

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Тетерина, Н. Л., Левенсон, Э., Ринаудо, М. С., Эггер, Д., Биенц, К., Горбаленя, А. Э. и др. (2006). Доказательства функциональных взаимодействий белков, необходимых для репликации РНК полиовируса. J. Virol. 80, 5327–5337. DOI: 10.1128 / JVI.02684-05

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Толская Е. А., Романова Л. И., Колесникова М. С., Гмыль А. П., Горбаленя А. Е., Агол В. И. (1994). Генетические исследования белка полиовируса 2C, NTPase. Вероятный механизм действия гуанидина на функцию 2C и доказательства важности олигомеризации 2C. J. Mol. Биол. 236, 1310–1323. DOI: 10.1016 / 0022-2836 (94)

-4

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Турвей, С.Э., и Бройде Д. Х. (2010). Врожденный иммунитет. J. Allergy Clin. Иммунол. 125, S24 – S32. DOI: 10.1016 / j.jaci.2009.07.016

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ulferts, R., de Boer, S.M, van der Linden, L., Bauer, L., Lyoo, H.R., Mate, M.J., et al. (2016). Скрининг библиотеки одобренных FDA препаратов позволяет выявить несколько ингибиторов репликации энтеровирусов, нацеленных на вирусный белок 2C. Антимикробный. Агенты Chemother. 60, 2627–2638. DOI: 10.1128 / AAC.02182-15

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ulferts, R., van der Linden, L., Thibaut, H.J., Lanke, K.H., Leyssen, P., Coutard, B., et al. (2013). Селективный ингибитор обратного захвата серотонина флуоксетин подавляет репликацию энтеровирусов B и D человека, воздействуя на вирусный белок 2C. Антимикробный. Агенты Chemother. 57, 1952–1956. DOI: 10.1128 / AAC.02084-12

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Вэнс, Л.М., Москафо, Н., Чоу, М., и Хайнц, Б.А. (1997). Область 2С полиовируса функционирует во время инкапсидации вирусной РНК. J. Virol. 71, 8759–8765. DOI: 10.1128 / JVI.71.11.8759-8765.1997

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Верлинден, Ю., Куконати, А., Виммер, Э., и Ромбо, Б. (2000). Противовирусное соединение 5- (3,4-дихлорфенил) метилгидантоин ингибирует постсинтетические расщепления и сборку полиовируса в бесклеточной системе. Antiviral Res. 48, 61–69. DOI: 10.1016 / s0166-3542 (00) 00119-4

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ван, К., Цзян, П., Санд, К., Пол, А. В., и Виммер, Э. (2012a). Аланиновое сканирование полиовируса 2CATPase обнаруживает новые генетические доказательства того, что взаимодействия капсидный белок / 2CATPase важны для морфогенеза. J. Virol. 86, 9964–9975. DOI: 10.1128 / JVI.00914-12

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ван, Ю., Li, L., Hou, C., Lai, Y., Long, J., Liu, J., et al. (2016). SNARE-опосредованное слияние мембран в аутофагии. Семин. Cell Dev. Биол. 60, 97–104. DOI: 10.1016 / j.semcdb.2016.07.009

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ван Ч., Ма, Х. К., Виммер Э., Цзян П. и Пол А. В. (2014). С-концевой, богатый цистеином сайт полиовируса 2С (АТФаза) необходим для морфогенеза. J. Gen. Virol. 95, 1255–1265. DOI: 10.1099 / vir.0.062497-0

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ван, Т., Ван Б., Хуанг Х., Чжан К., Чжу Ю., Пей Б. и др. (2017). Протеазы 2Apro и 3Cpro энтеровируса 71 по-разному ингибируют путь клеточной деградации, ассоциированной с эндоплазматическим ретикулумом (ERAD), с помощью различных механизмов, а энтеровирус 71 захватывает компонент p97 ERAD, чтобы способствовать его репликации. PLoS Pathog. 13: e1006674. DOI: 10.1371 / journal.ppat.1006674

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ван, С. Х., Ван, А., Лю, П. П., Чжан, В.Y., Du, J., Xu, S., et al. (2018). Дивергентные патогенные свойства циркулирующего вируса Коксаки А6, связанные с развивающейся болезнью рук, ног и рта. J. Virol. 92, e00303 – e00318. DOI: 10.1128 / JVI.00303-18

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Wei, C., Zheng, C., Sun, J., Luo, D., Tang, Y., Zhang, Y., et al. (2018). Виперин подавляет репликацию энтеровируса A71, взаимодействуя с вирусным белком 2C. Вирусы 11:13. DOI: 10.3390 / v11010013

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Wen, W., Yin, M., Zhang, H., Liu, T., Chen, H., Qian, P., et al. (2019). Вирусы 2C и 3C долины Сенека подавляют продукцию интерферона I типа, вызывая деградацию RIG-I. Вирусология 535, 122–129. DOI: 10.1016 / j.virol.2019.06.017

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Wu, K. X., Phuektes, P., Kumar, P., Goh, G. Y., Moreau, D., Chow, V. T., и другие. (2016). Скрининг РНКи по всему геному человека выявляет факторы хозяина, необходимые для репликации энтеровируса 71. Nat. Commun. 7: 13150. DOI: 10.1038 / ncomms13150

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Xia, H., Wang, P., Wang, G.C., Yang, J., Sun, X., Wu, W., et al. (2015). Неструктурный белок 2CATPase энтеровируса человека действует как РНК-геликаза и как АТФ-независимый РНК-шаперон. PLoS Pathog. 11: e1005067. DOI: 10,1371 / журнал.ppat.1005067

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Xie, J., Yang, X. H., Hu, S. Q., Zhan, W. L., Zhang, C. B., Liu, H., et al. (2020). Совместная циркуляция вирусов Коксаки A-6, A-10 и A-16 вызывает заболевание рук, ног и рта в городе Гуанчжоу, Китай. BMC Infect. Дис. 20: 271. DOI: 10.1186 / s12879-020-04992-x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Yi, Z., Fang, C., Zou, J., Xu, J., Song, W., Du, X., и другие. (2016). Аффинная очистка репликазы вируса гепатита С позволяет идентифицировать валозин-содержащий белок, член АТФаз, ассоциированный с семейством различных клеточных активностей, как активный модулятор репликации вируса. J. Virol. 90, 9953–9966. DOI: 10.1128 / JVI.01140-16

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Йонеяма, М., Сухара, В., Фукухара, Ю., Фукуда, М., Нисида, Э., и Фудзита, Т. (1998). Прямой запуск системы интерферона типа I вирусной инфекцией: активация комплекса факторов транскрипции, содержащего IRF-3 и CBP / p300. EMBO J. 17, 1087–1095. DOI: 10.1093 / emboj / 17.4.1087

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Зелл Р., Делварт Э., Горбаленя А. Э., Хови Т., Кинг А. М. К., Ноулз Н. Дж. И др. (2017). Таксономический профиль вируса ICTV: picornaviridae. J. Gen. Virol. 98, 2421–2422. DOI: 10.1099 / jgv.0.000911

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Чжэн, З., Ли, Х., Чжан, З., Мэн, Дж., Мао, Д., Бай, Б., и другие. (2011). Белок 2C энтеровируса 71 ингибирует TNF-альфа-опосредованную активацию NF-kappaB путем подавления фосфорилирования бета-киназы IkappaB. J. Immunol. 187, 2202–2212. DOI: 10.4049 / jimmunol.1100285

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Zoll, J., Heus, H.A., van Kuppeveld, F.J., и Melchers, W.J. (2009). Взаимосвязь структура-функция 3'-UTR энтеровируса. Virus Res. 139, 209–216. DOI: 10.1016 / j.virusres.2008.07.014

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Zust, R., Cervantes-Barragan, L., Habjan, M., Maier, R., Neuman, B.W., Ziebuhr, J., et al. (2011). 2'-O-метилирование рибозы обеспечивает молекулярную сигнатуру для различения собственной и чужой мРНК, зависящей от сенсора РНК Mda5. Nat. Иммунол. 12, 137–143. DOI: 10.1038 / ni.1979

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Обзор энтеровирусных инфекций - инфекционных заболеваний

Энтеровирус D68 (EV-D68) вызывает респираторное заболевание, в первую очередь у детей; симптомы обычно напоминают симптомы простуды (например, ринорея, кашель, недомогание, лихорадка у некоторых детей).У некоторых детей, особенно у детей с астмой, наблюдаются более серьезные симптомы, связанные с нижними дыхательными путями (например, хрипы, респираторный дистресс).

Здоровые взрослые люди могут быть инфицированы, но у них обычно мало симптомов или нет. Взрослые с ослабленным иммунитетом могут иметь тяжелые респираторные заболевания.

Каждый год респираторные инфекции, вызванные EV-D68, выявляются у небольшого числа детей, а небольшие вспышки, как правило, происходят раз в два года. Однако в конце лета и осенью 2014 года было подтверждено более 1000 случаев крупной вспышки в США.У значительного числа детей развился тяжелый респираторный дистресс-синдром, несколько детей умерли. В то же время также были зарегистрированы группы случаев у детей с очаговой слабостью или параличом конечностей с поражением спинного мозга (видно на МРТ), согласующимся с острым вялым миелитом (AFM) после респираторного заболевания; EV-D68 был обнаружен в респираторных образцах в двух третях случаев в двух различных кластерах вспышек и в крови одного ребенка во время прогрессирования паралича. Секвенированные вирусы были почти идентичны и имели общую гомологию с полиовирусом и энтеровирусом D70, которые, как известно, связаны с AFM и подтверждают потенциальную причинную роль EV-D68 в параличе AFM (1).Постоянное наблюдение Центров по контролю и профилактике заболеваний (CDC) выявило 120 случаев AFM осенью 2014 года, что совпало со вспышкой EV-D68. Непрерывное наблюдение в 2015 г. выявило 16 случаев AFM за весь год, при этом случаев EV-D68 в этом году не зарегистрировано (2).

Еще одна крупная вспышка респираторного заболевания, связанного с EV-D68, достигла пика в США в сентябре 2018 года. Активное наблюдение CDC выявило вирус у 13,9% педиатрических пациентов с острым респираторным заболеванием в нескольких крупных медицинских центрах США, по сравнению с 0.08% аналогичных пациентов в 2017 году. Две трети пациентов с EV-D68 нуждались в госпитализации, что подчеркивает тяжесть заболевания. Также одновременно наблюдалось увеличение числа зарегистрированных случаев AFM с более чем 200 подтвержденными CDC случаями в 2018 году по сравнению с всего 35 в 2017 году, что еще раз подтверждает связь между инфекцией EV-D68 и AFM (3).

EV-D68 следует рассматривать как этиологию тяжелой респираторной инфекции, не имеющей другого объяснения, особенно если она связана с группой случаев в конце лета - осенью.Рекомендуется специальное тестирование при потенциальных вспышках, которое может быть организовано через представителей общественного здравоохранения.

.

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *

Copyright © 2008 - 2021
Виды Название вируса Изолят Регистрационный номер Номер RefSeq Доступная последовательность Аббревиатура вируса.
Энтеровирус A coxsackievirus A2 Флитвуд (Делавэр / 47) AY421760 NC_038306 Полный геном CVA2 CVA2 Олсон (Нью-Йорк / 48) AY421761 Полный геном CVA3
Энтеровирус A Вирус Коксаки А4 High Point (Северная Каролина / 50Y3) High Point (Северная Каролина / 50Y3) CVA4
Энтеровирус A coxsackievirus A5 Swartz (New York / 50) AY421763 Полный геном CVA5
Гдула AY421764 Полный геном CVA6
Энтеровирус A coxsackievirus A7 Parker AY421765 Полный геном CVA7 AY421765 Donov Нью-Йорк / 49) AY421766 Полный геном CVA8
Энтеровирус A Вирус Коксаки A10 Ковалик (Нью-Йорк 9029 9029) AY4217300 9029 9029 AY4217300
Энтеровирус A Вирус Коксаки A12 Техас 12 (Техас / 48) AY421768 Полный геном CVA12
Энтеровирус Coxsack (Южная Африка / 50) AY421769 903 00 Полный геном CVA14
Энтеровирус A Вирус Коксаки A16 G-10 (Южная Африка / 51) U05876 Полный геном энтеровирус A71 BrCr U22521 Полный геном EV-A71
Энтеровирус A энтеровирус A76 FRA91-1036390 9029 9029 EV-A76
Энтеровирус A энтеровирус A89 BAN00-10359 AY697459 Полный геном EV-A89
9030AN Энтеровирус ANN -10399 AY697460 Полный генератор оме EV-A90
Энтеровирус A энтеровирус A91 BAN00-10406 ​​ AY697461 Полный геном EV-A91
энтеровирус A91
USA / GA99 / RJg-7 EF667344 Полный геном EV-A92
Энтеровирус A Энтеровирус A114 V13-0285 / IND300 / 2013 EV-A114
Энтеровирус A энтеровирус A119 hu / 09C13CMR (Камерун) KC787153 Частичный геном A0292 EV энтеровирус A120 MAD-2741-11 (Мадагаскар) LK021688 Compl ete genome EV-A120
Энтеровирус A Энтеровирус A121 V13-0682 / IND / 2013 KU355877 Полный геном EV-A6122 энтеровирус A122; обезьяний вирус 19 M19s AF326754 Полный геном EV-A122
Энтеровирус A энтеровирус A123; обезьяний вирус 43 OM112t AF326761 Полный геном EV-A123
Энтеровирус A энтеровирус A124; обезьяний вирус 46 OM22 AF326764 Полный геном EV-A124
Энтеровирус A энтеровирус A125; энтеровирус бабуина A13 A13 AF326750 Полный геном EV-A125
Энтеровирус B coxsackievirus B3 Nancy (Коннектикут) Полный геном CVB3
coxsackievirus B1 Япония M16560 Полный геном CVB1
AF081485 Полный геном CVB2
Энтеровирус B Вирус Коксаки В4 JVB (Нью-Йорк / США / 51) ( Полный геном CVB4
En теровирус B coxsackievirus B5 Faulkner (Kentucky / US / 52) AF114383 Полный геном CVB5
Энтеровирус B (Филиппины) 1-15-21) AF039205 Полный геном CVB6
Энтеровирус B Вирус Коксаки А9 Григгс D00627 9030 9030 9029 Полный геном CVA Энтеровирус B эховирус 1 Фарук (Египет / 51) AF029859 Полный геном E1
Энтеровирус B эховирус 1; эховирус 8 Брайсон (Огайо) AF250874 Частичный геном E1
Энтеровирус B эховирус 2 Корнелис (Коннектикут 25 ) Полный E2
Энтеровирус B эховирус 3 Морриси (Коннектикут / США / 51) AY302553 Полный геном E3
Песачек (Коннектикут / США / 51) AY302557 Полный геном E4
Энтеровирус B эховирус 5 Noyce (Мэн AF029) E5
Энтеровирус B эховирус 6 90 300 Д'Амори (Род-Айленд / 55) AY302558 Полный геном E6
Энтеровирус B эховирус 7 Ген Уоллеса (Огайо) 9 AY30 E7
Энтеровирус B эховирус 9 Hill (Огайо / США / 53) X84981 Полный геном E9
9030 9030
Грегори (Огайо) X80059 Полный геном E11
Энтеровирус B эховирус 12 Трэвис (Филиппины / 53) X79047
Энтеровирус B эховирус 13 Дель Кармен (Филиппины s / 53) AY302539 Полный геном E13
Энтеровирус B эховирус 14 Tow (Род-Айленд / 54) AY302540 908 300 Complete
Энтеровирус B эховирус 15 Ch 96-51 (Чарлстон) (Западная Вирджиния / 51) AY302541 Полный геном E15
Энтервирус Харрингтон (Массачусетс / 51) AY302542 Полный геном E16
Энтеровирус B эховирус 17 CHHE-29 (Мехико AY3 9029) E17
Энтеровирус B эховирус 18 Меткалф (Огайо) AF317694 Полный геном E18
Энтеровирус B эховирус 19 Берк (Огайо) AY302544 AY302544
эховирус 20 JV-1 (Вашингтон, округ Колумбия / 55) AY302546 Полный геном E20
Энтеровирус B Echovirus Массачусетс / 50) AY302547 Полный геном E21
Энтеровирус B echovirus 24 DeCamp (Огайо / 56) AY3024300 9029 9029 Энтеровирус B эховирус 25 JV-4 (Вашингтон DC / 57) AY302549 Полный геном E25
Энтеровирус B эховирус 26 Coronel (11-3-6) (Филиппины / 53) AY301 Complete геном E26
Энтеровирус B эховирус 27 Бекон (1-36-4) (Филиппины / 53) AY302551 Полный геном E27
эховирус 29 JV-10 (Вашингтон, округ Колумбия / 55) AY302552 Полный геном E29
Энтеровирус B эховирус 30 AF162711 Полный геном E30
Энтеровирус B эховирус 31 AY302554 Полный геном E31
Энтеровирус B эховирус 32 PR-10 (Пуэрто-Рико) AY303 E32
Энтеровирус B эховирус 33 Толука-3 (Мексика / 59) AY302556 Полный геном E33
Энтеровирус B Толука-1 (Мексика / 59) AY302560 Полный геном EV-B69
Энтеровирус B Энтеровирус B73 CA55-1988 Ген AF10 Ген AF10 -B73
Энтеровирус B Энтеровирус B74 USA / CA75-1 0213 AY556057 Полный геном EV-B74
Энтеровирус B энтеровирус B75 USA / OK85-10362 AY556070 Энтеровирус B Энтеровирус B77 CF496-99 AJ4 Полный геном EV-B77
Энтеровирус B WINTER AY208120 Частичный геном EV-B78
Энтеровирус B энтеровирус B79 USA / CA79-10384 AY843297 Полный Энтеровирус B Энтеровирус B80 США / CA67-10387 A Y843298 Полный геном EV-B80
Энтеровирус B Энтеровирус B81 США / CA68-10389 AY843299 EV-B80 Энтеровирус B Энтеровирус B82 USA / CA64-10390 AY843300 Полный геном EV-B82
Энтеровирус B энтеровирус B83 / Полный геном EV-B83
Энтеровирус B энтеровирус B84 CIV2003-10603 DQ2 Полный геном энтеровирус B85 BAN00-10353 AY843303 Полный геном EV-B85
Энтеровирус B Энтеровирус B86 BAN00-10354 AY843304 Полный геном
энтеровирус B87 BAN00-10396 AY843305 Полный геном EV-B87
Энтеровирус B энтеровирус B88 BAN30610398 BAN306-10398
Энтеровирус B энтеровирус B93 38-03 (ДР Конго) KM273013 Частичный геном EV-B93
Энтеровирус B BAN99-10355 AY843307 Полный геном 9 0300 EV-B97
Энтеровирус B Энтеровирус B98 T92-1499 AB426608 Полный геном EV-B98
BAN2000-10500 DQ3 Полный геном EV-B100
Энтеровирус B Энтеровирус B101 CIV03-10361 AY84330 9029
Энтеровирус B Энтеровирус B106 148 / YN / CHN / 12 (Китай / 2012) KF9 Полный геном EV-B106
Enterirus B107 TN94-0349 AB426609 Полный геном EV-B107
Энтеровирус B энтеровирус B110 LM1861 (шимпанзе / Камерун / 2006) JF416928; JF416931; JF416934; JF416937 Частичный геном EV-B110
Энтеровирус B Энтеровирус B111 Q0011 / XZ / CHN / 2000 KF312882
Энтеровирус B Энтеровирус B112 GAB130 (шимпанзе / Габон) KJ418244 Полный геном EV-B112
Энтеровирус B112 Энтеровирус ) KJ701249 Полный геном EV-B113
Энтеровирус B энтеровирус B114; обезьяний агент 5 B165 (верветка) AF326751 Полный геном EV-B114
Энтеровирус C Полиовирус 1 Mahoney геном PV1
Энтеровирус C полиовирус 1 Сабин (LSc-2ab) V01150 Полный геном PV1
Лансинг (Мичиган / 37) M12197 Полный геном PV2
Энтеровирус C полиовирус 2 Сабин (P712- Ch-2ab gen00 Полное геном) PV2
Энтеровирус C поли овирус 3 Леон (Калифорния / 37) K01392 Полный геном P-3
Энтеровирус C Полиовирус 3 Сабин (Леон 12a-1-b) Полный геном PV3
Энтеровирус C вирус Коксаки A1 T.T. (Tompkins) (Coxsackie / NY / 47) AF499635 Полный геном CVA-1
Энтеровирус C Вирус Коксаки A11 Бельгия 1 (Бельгия / AF 51) Полный геном CVA-11
Энтеровирус C Вирус Коксаки A13 Флорес (Мексика / 52) AF499637 9029 9029 CVA Энтеровирус С вирус Коксаки А13; coxsackievirus A18 G-13 (South Africa / 50) AF499640 Полный геном CVA-13
Энтеровирус C Coxsackirus A17 AF4 Полный геном CVA-17
Энтеровирус C Вирус Коксаки A19 NIH-8663 (Дохи) (Япония / 52) AF499641
Энтеровирус C Вирус Коксаки A20 IH-35 (Нью-Йорк / 55) AF499642 Полный геном CVA-20
COVA-20 9030 Энтеровирус Cо-вирус 300300 9030 Куйкендалл (Калифорния / 52) AF546702 Полный геном CVA-21
9029 8 Энтеровирус C Вирус Коксаки A22 Чульман (Нью-Йорк / 55) AF499643 Полный геном CVA-22
Энтеровирус C cox300 Полный геном CVA-24
Энтеровирус C Энтеровирус C95 T08-083 / Чад / 2008 JX417822 EVA-24 Частичный геном Энтеровирус C энтеровирус C96 BAN00-10499 EF015886 Полный геном EV-C96
Энтеровирус C E C99 Полный геном EV-C99
En теровирус C энтеровирус C102 BAN99-10424 EF555645 Полный геном EV-C102
Энтеровирус C EE104 Частичный геном EV-C104
Энтеровирус C энтеровирус C105 PER153 (Перу / 2010) JX3 Полный геном энтеровирус C109 NICA08-4327 GQ865517 Полный геном EV-C109
Энтеровирус C энтеровирус C113 EV-C113
Ent эровирус C энтеровирус C116 126 / Россия / 2010 JX514942 Полный геном EV-C116
Энтеровирус C энтеровирус C117 / Литва C117 JX262382 Полный геном EV-C117
Энтеровирус C энтеровирус C118 ISR10 (Израиль / 2011) JX Энтеровирус D Энтеровирус D68 Фермон AY426531 NC_038308 Полный геном EV-D68
Энтеровирус D68; риновирус человека 87 F02-3607-Кукуруза AY355268 Частичный геном EV-D68
Энтеровирус D энтеровирус D70 J670 / 71 300 (Япония) Полный геном EV-D70
Энтеровирус D Энтеровирус D94 E210 (Египет) DQ6 9030 9030 EV-D94 энтеровирус D111 KK2640 (шимпанзе / Камерун / 2006) JF416929; JF416932; JF416935; JF416938 Частичный геном EV-D111
Энтеровирус D Энтеровирус D120 MB6201 (горилла / Камерун) KF genome808
Энтеровирус E Энтеровирус E1; энтеровирус крупного рогатого скота 1 VG-5-27 D00214 NC_001859 Полный геном EV-E1
Энтеровирус E энтеровирус E2 PS42 ( Полный геном EV-E2
Энтеровирус E энтеровирус E3 D 14/3/96 (Германия / 1996) DQ0 EV-E2 Частичный геном
Энтеровирус E Энтеровирус E4 PAK-NIH-21E5 (сточные воды / Карачи / 2009) JQ6 Частичный геном EV-E4
Энтеровирус E Энтеровирус E5 MexKSU / 5 (Мексика / 2015) KU172420 Полный Энтеровирус F энтеровирус F1; энтеровирус крупного рогатого скота 2 BEV-261-M2-RM2 DQ0 NC_021220 Полный геном EV-F1
Энтеровирус F энтеровирус F2 EV-F2
Энтеровирус F энтеровирус F3 PS87 / Белфаст (ATCC VR-774) DQ0 Полный геном EV-F3 энтеровирус F4 W1 (кистохвостый опоссум / Новая Зеландия) AY462106 Полный геном EV-F4
Энтеровирус F энтеровирус F5 / Норфол 9029k F5 / Англия Нет записи в Genbank EV-F5
Энтеровирус F 9 0303 энтеровирус F6 T11f (Великобритания / 1960) Нет записи в Genbank EV-F6
Энтеровирус F энтеровирус F7 AN12 / BosN 2014 LC038188 Полный геном EV-F7
Энтеровирус G энтеровирус G1; энтеровирус свиней 9 UKG / 410/73 AF363453 NC_004441 Полный геном EV-G1
Энтеровирус G энтеровирус G2; ранее энтеровирус 10 LP54 (Англия / 75) AF363455 Полный геном EV-G2
Энтеровирус G энтеровирус G3 sw / K23 / 2008 / HUN300 Полный геном EV-G3
Энтеровирус G энтеровирус G4 дикий кабан / WBD / 2011 / HUN JN807387 EV-G4 Полный геном Энтеровирус G Энтеровирус G5 Овцы / TB4-OEV / 2009 / HUN JQ277724 Полный геном EV-G5
Энтеровирус 9029 / G JQ818253 Полный геном EV-G6
Энтеровирус G энтеровирус G7 овец / 990 / UK-NI MG Полный геном EV-G7
Энтеровирус G энтеровирус G8 Sw / 714418-02 KT265911 Полный геном EV-G8
Энтеровирус G Энтеровирус G9 734087 / ThanBinh_VN / 2012-03-20
Энтеровирус G энтеровирус G10 sw / PoEnV-BEL-12R021 KP982873 Полный геном EV-G10 вирус
KJ156451 Частичный геном EV-G11
Энтеровир us G энтеровирус G12 sw / 714222 / CaoLanh / VN / 2012-02-16 KT265900 Частичный геном EV-G12
энтеровирус G ov KT265903 Частичный геном EV-G13
Энтеровирус G энтеровирус G14 Sw / 714405h / 714405h -02-21 KT265909 Частичный геном EV-G14
Энтеровирус G Энтеровирус G15 sw / 724307 / CaoLanh / VN / 2012-03-14 Частичный геном EV-G15
Энтеровирус G энтеровирус G16 дикий кабан / BS14-17h3 / DakLak_VN / 2014 KT266010 Частичный геном 300 EV-G16
Энтеровирус G энтеровирус G17 sw / 08 / NC_USA / 2015 KY761948 Полный геном EV-G17
энтеровирус G18 sw / GER / F26-2 / 23-12-2013 MF113370 Частичный геном EV-G18
Энтеровирус G энтеровирус G19 / Ger / sw F8-2 / 04-02-2013 MF113372 Частичный геном EV-G19
Энтеровирус G Энтеровирус G20 козий / JL14 / CHA / 2014 KU Полный геном EV-G20
Энтеровирус H энтеровирус h2; обезьяний энтеровирус 1715 UWB AF326759 NC_038309 Полный геном EV-H
Энтеровирус I энтеровирус I1; энтеровирус верблюда верблюда 1 19CC KP345887 NC_038310 Полный геном EV-I1
Энтеровирус I энтеровирус I2; энтеровирус верблюжьего верблюда 2 20CC KP345888 Полный геном EV-I2
Энтеровирус J энтеровирус J1 9029_ SV6-16300 EV-J1
Энтеровирус J энтеровирус J103 USA / GA99-POo-1 FJ007373 Полный геном EV-J103 9030
энтеровирус J108 N125 AF414372 Полный геном EV-J108
Энтеровирус J энтеровирус J112 BAN / 200824300 9029 BAN / 200824300 -J112
Энтеровирус J BAN / 2008/711221 JX537991 Частичный геном EV-J115
Энтеровирус J энтеровирус J121 90_300 CP300 KF648606 Частичный геном EV-J121
Энтеровирус K энтеровирус K1 Грызун / Ee / PicoV / NX2015 KX15615 K1
Энтеровирус K энтеровирус K2 Грызун / Mc / PicoV / Tibet2015 KX156159 Полный кодирующий геном EV-K2 LINVR300
Macaca mulatta / SEV-gx / 2014 / Китай KU587555 NC_029905 Полный геном EV-L1
Риновирус A FJ445111 NC_038311 Полный геном RV-A1
Риновирус A риновирус A1B B632 D00239 Полный геном RV-A1B
Риновирус A 300 rome RV-A2
Риновирус A риновирус A7 68CV11 DQ473503 Полный геном RV-A7 Rhinirus -CV12 FJ445113 Полный геном RV-A8
Риновирус A риновирус A9 211-CV13-ATCC VR489
FJ300
Риновирус A риновирус A10 9 0300 204-CV14 DQ473498 Полный геном RV-A10
Риновирус A риновирус A11 1-CV15 EF1730014 Полный геном EF1730014
Риновирус A риновирус A12 181-CV16 EF173415 Полный геном RV-A12
Rhinovirus 9029 A12 59) FJ445116 Полный геном RV-A13
Риновирус A риновирус A15 1734 (Южная Каролина / 60) DQ4734300 9029
Риновирус A риновирус A16 11757 (Промывка тонна DC / 60) L24917 Полный геном RV-A16
Риновирус A риновирус A18 5986-CV17 FJ gen19
Риновирус A риновирус A19 ATCC VR-1129 FJ445119 Полный геном RV-A19
VR3 FJ445120 Полный геном RV-A20
Риновирус A риновирус A21 ATCC VR-1131 A21 RV-9902 Риновирус A Риновирус A22 ATCC VR-1132 FJ445122 Полный геном RV-A22
Риновирус A риновирус A23 5124-CV24 DQ473497 Полный геном RV-A-9030 риновирус A24 5146-CV25 EF173416 Полный геном RV-A24
Риновирус A риновирус A45 VR-1100 RV-A25
Риновирус A риновирус A28 6101-CV29 DQ473508 Полный геном RV-A28
Rhinirus 9029 Rhinirus Rhinirus VR-1139 FJ445125 Полный геном RV -A29
Риновирус A риновирус A30 106F DQ473512 Полный геном RV-A30
Rhinovirus AT300 FJ445126 Полный геном RV-A31
Риновирус A риновирус A32 ATCC VR-1142
риновирус A33 ATCC VR-330 FJ445128 Полный геном RV-A33
Риновирус A Rhinovirus A Полный геном RV-A34
Ринов irus A риновирус A36 342H DQ473505 Полный геном RV-A36
Риновирус A Rhinovirus8 A38
Риновирус A риновирус A39 209 (Мэриленд / 62) AY751783 Полный геном RV-A39
ATCC VR-341 FJ445129 Полный геном RV-A40
Риновирус A риновирус A41 56110 (Геном Северная Каролина8 / 61300 RV-A41
Риновирус A rhinovi rus A43 ATCC VR-1153 FJ445131 Полный геном RV-A43
Риновирус A риновирус A45 Геном ATCC VR-1155 RV-A45
Риновирус A Риновирус A46 Crell (Baylor 2) (Техас / 64) DQ473506 Полный геном RV-A46
риновирус A47 ATCC VR-1157 FJ445133 Полный геном RV-A47
Риновирус A риновирус A49 -A49
Риновирус A риновирус A50 ATCC VR -517 FJ445135 Полный геном RV-A50
Риновирус A риновирус A51 ATCC VR-1161 FJ gen445136 FJ gen445136 Риновирус A риновирус A53 F01-3928 DQ473507 Полный геном RV-A53
Rhinovirus A 9029 VR3 Rhinovirus A 9030 r3 Полный геном RV-A54
Риновирус A риновирус A55 Wis315E (Висконсин / 64) DQ473511 DQ473511 Риновирус A риновирус A56 CH82 [V-151-011-021] FJ4 45140 Полный геном RV-A56
Риновирус A риновирус A57 fs номер корабля1-hrv-57 FJ445141 Полный геном RV-A57
Риновирус A риновирус A58 ATCC VR-1168 FJ445300 9029
Риновирус A риновирус A59 611-CV35 DQ473500 Полный геном RV-A59
VR3 FJ445143 Полный геном RV-A60
Риновирус A риновирус A61 ATCC VR-1171
Риновирус A62 ATCC VR-1172 FJ445145 Полный геном RV-A62
Риновирус A риновирус A63 ATCC VR-1173 FJ445146 Полный геном RV296
риновирус A64 6258-CV44 EF173417 Полный геном RV-A64
Риновирус A риновирус A65 ATCC RV-A65
Риновирус A риновирус A66 ATCC VR-1176 FJ445148 Полный геном RV2 A66 Rhinov Rhinov ATCC VR-1177 FJ445149 Полный геном
Риновирус A риновирус A68 ATCC VR-1178 FJ445150 Полный геном RV-A68
Rhinirus 9030 A68 ATCC VR-1181 FJ445152 Полный геном RV-A71
Риновирус A риновирус A73 107E DQ473492 Риновирус A риновирус A74 328A DQ473494 Полный геном RV-A74
Rhinovirus A 00 Rhinovirus A 00 RV-A75
Риновир us A риновирус A76 H00062 DQ473502 Полный геном RV-A76
Риновирус A Rhinovirus A3 AT4 RV-A77
Риновирус A риновирус A78 2030-65 EF173418 Полный геном RV-A78
ATCC VR-1190 FJ445156 Полный геном RV-A80
Риновирус A риновирус A81 ATCC VR-1191 FJ4
Риновирус A риновирус A82 Санта-Круз (Калифорния) DQ473509 Полный геном RV-A82
Риновирус A риновирус A85 ATCC VR-1195 903 FJ4 A85
Риновирус A риновирус A88 CVD 01-0165-Dambrauskas DQ473504 Полный геном RV-A88 RV-A-A88 41467-Gallo M16248 Полный геном RV-A89
Риновирус A риновирус A90 ATCC VR-1291 FJ gen345167
Риновирус A Риновирус A94 SF-1803 9 0300 EF173419 Полный геном RV-A94
Риновирус A риновирус A96 ATCC VR-1296 FJ445171
FJ445171
риновирус A100 ATCC VR-1300 FJ445175 Полный геном RV-A100
Rhinovirus A 00 rhinovirus A r Полный геном RV-A101
Риновирус A риновирус A102 AMS323 EF155421 Полный геном RV2 A6-A102 WA327E / 09 JF

5
Полный геном RV-A103
Риновирус A риновирус A104 p1025_sR2625_2009 JN562727 Полноценный геном A300 p1064_sR985_2009 JN614995 Полный геном RV-A105
Риновирусная риновирусы A106 p1044_sR114_2008 JQ245971 Полный геном RV-A106
Риновирус A риновирус A107 S07259 KC859319 Частичный геном RV-A107
Риновирус A 98 RV-A108
Риновирус B риновирус B3 FEB DQ473485 NC_038312 Полный геном RV2198 RV-B3 16/60 DQ473490 Полный геном RV-B4
Риновирус B риновирус B5 Norman / ATCC VR-485
Rhinovirus B риновирус B6 Thompson DQ473486 Полный геном RV-B6
Rhinirus Rhinirus K02121 Полный геном RV-B14
Риновирус B риновирус B17 33342 (Северная Каролина / 59) EF173420 Полный геном RV-B17
Вирус
-CV27 / ATCC VR-1136 FJ445124 Полный геном RV-B26
Риновирус B риновирус B27 5870-CV28 / ATCC геном RV-B27
Риновирус B риновирус B35 164A DQ473487 Полный геном RV2 B35 Rhinovirus 9030 Rhinov 151-1 EF173423 Полный геном RV-B37
Риновирус B риновирус B42 56822 (Северная Каролина / 61) / ATCC VR-338 FJ445130 Полный геном RV-B42
1505 DQ473488 Полный геном RV-B48
Риновирус B риновирус B52 F01-3772 / ATCC VR-1162J4 F01-3772 / ATCC VR-1162J4 -B52
Риновирус B риновирус B69 F01-2513-Митчинсон / ATCC VR-1179 FJ445151 Полный геном RV-B692 риновирус B70 F02-2547-Treganza DQ473489 Полный геном RV-B70
Риновирус B риновирус B72 K2207 / ATCC VR-1182 FJ445153 Полный геном RV-B72
FJ445155 Полный геном RV-B79
Риновирус B риновирус B83 Baylor 7 / ATCC VR-1193J RV-B83
Риновирус B риновирус B84 432D / ATCC VR-1194 FJ445162 Полный геном RV-B84 Rhinirus B86 121564-Johnson / ATCC VR-1196 FJ445164 Полный геном RV-B86 9 0300
Риновирус B риновирус B91 JM1 / ATCC VR-1292 FJ445168 Полный геном RV-B91
Rhinovirus -1662 / ATCC VR-1293 FJ445169 Полный геном RV-B92
Риновирус B риновирус B93 SF-1492 EF1734 B93
Риновирус B риновирус B97 SF-1372 / ATCC VR-1297 FJ445172 Полный геном RV-B97
604 / ATCC VR-1299 FJ445174 Полный геном RV-B99
Риновирус B риновирус B100 CU211 (Таиланд / 2006) HQ123444 Полный кодирующий геном RV-B100
9010 Rhinov_irus Rhinov_2006 JF781500 Полный геном RV-B101
Риновирус B риновирус B102 p1044_sR122_2007 JX0740300 R122_2007 JX0740300 риновирус B103 p1160_sR1153_2009 JN614996 Полный геном RV-B103
Риновирус B 9029 B 9029 B 9029 B 9029 B 9029 9029 B 9029 9029 B 9029
Риновирус C риновирус C1 NAT001 EF077279 NC_038878 Полный геном RV-C1
Rhinirus Полный геном RV-C2
Риновирус C риновирус C3 QPM EF186077 Полный геном RV6-C3 RV-C3 O24 EF582385 Полный геном RV-C4
Риновирус C риновирус C5 O25 EF582386 Геном EF582386 EF582386 Риновирус C rh иновирус C6 O26 EF582387 Полный геном RV-C6
Риновирус C геновирус C7 NY-074 (1078)
Риновирус C риновирус C8 N4 GQ223227 Полный геном RV-C8
Rhinov Rhinov Rhinov Полный геном RV-C9
Риновирус C Риновирус C10 QCE GQ323774 Полный геном RV-C10 риновирус C11 CL-170085 EU840952 Co mplete genome RV-C11
Rhinovirus C rhinovirus C12 Resp_3922 / 07 HM236958 Частичный геном R3196 RV-C12 C13 Resp_2951 / 06 HM236908 Частичный геном RV-C13
Риновирус C риновирус C14 Resp_30 Resp_1129300 Частичный
Риновирус C Риновирус C15 W10 (США / 2007) GU219984 Полный геном RV-C15
C15
/ TAN / 2008 KR997882 Частичный геном RV-C16
Риновирус C риновирус C17 Resp_5145 / 07 HM236936 Частичный геном RV-C17
Rhinovirus
HM236918 Частичный геном RV-C18
Риновирус C риновирус C19 CL-Fnp5 EU840728 EU840728
риновирус C20 Resp_3995 / 07 HM236923 Частичный геном RV-C20
Риновирус C 90_303 Rhinovirus C 90_303 RV-C21
Rhin овирус C риновирус C22 3430-MY-10 KJ675507 Полный геном RV-C22
Риновирус C Полный геном RV-C23
Риновирус C риновирус C24 Resp_7147 / 07 HM236939 RV-C23 Частичный геном C2 риновирус C25 Resp_2832 / 06 HM236952 Частичный геном RV-C25
Риновирус C rhinovirus C26_25 9029 9029 rhinovirus C26_25 9029 9029 RV-C26
Риновирус C риновирус C2 7 Resp_2784 / 06 HM236906 Частичный геном RV-C27
Риновирус C риновирус C28 Resp_3105 / 06300 Resp_3105 / 06300 Resp_3104298
Риновирус C риновирус C29 Resp_5345 / 07 HM236949 Частичный геном RV-C29
Rhinovirus
HM236968 Частичный геном RV-C30
Риновирус C риновирус C31 Resp_4923 / 07 HM23ome6964
C риновирус C32 Resp_6131 / 07 HM236897 Частичный геном RV-C32
Риновирус C риновирус C33 Resp_4917 / 07 HM236934
Частичный C32 риновирус C34 Mex14 / Мексика / 2014 KM486097 Полный кодирующий геном RV-C34
Риновирус C Rhinovirus L25 Rinovirus L25R Полный геном RV-C35
Риновирус C риновирус C36 Resp_2480 / 07 JF416311 RV-C35 903 Частичный геном 903 C риновирус C37 Resp_6135 / 08 JF416321 Частичный геном RV-C37
Риновирус C риновирус C38 Resp_6142 / 08 JF416322 RV-C37 903 Rhinovirus Rhinovirus 903 риновирус C39 WA823M02 JN205461 Полный геном RV-C39
Риновирус C _Rhinovirus C4021 90_300 p12300
Риновирус C риновирус C41 2536 / USA / 2000 KF1 Полный геном RV-C41
MY 9029 Rhinovirus C 9029 10 KJ675505 Полный геном
Риновирус C Риновирус C43 p1281_s6410_1999 JN815249 Полный геном Вирус RV-Cov3 9030_3 RV-Cov3 9030_3 09 JF416310 Неполный геном RV-C44
Риновирус C риновирус C45 cpz1-2013 / UGA KY624849 9029 Риновирус C Риновирус C46 Resp_5153 / 07 JF416318 Частичный геном RV-C46
C46
Rhinovirus C Rhinovirus Частичный геном RV-C47
Риновирус C риновирус C48 PNG7293-3193 JF519762 Частичный геном RV-C48
Rhinovirus3 Rhinovirus C 9029_2 Полный геном RV-C49
Риновирус C риновирус C50 SG1 / AUS / 2008 KF688606 Полный геном риновирус C51 LZ508 / Китай / 2007 JF317015 Полный геном RV-C51
Риновирус C риновирус C54 D34 геном RV-C54
Риновир us C риновирус C55 ID529T / TAN / 2008 KR997885 Частичный геном RV-C55
Риновирус C rhinovum / LC298 Rhinovum rhinovum Частичный геном RV-C56
Риновирус C риновирус C57 7383-MY-10 KP8 Полное название RV-C56 выбор образцов изолятов и аббревиатуры вирусов не являются официальными обозначениями ICTV.

Определенные вирусы, первоначально описанные как новые эховирусы, позже были идентифицированы неправильно. Таким образом, эховирус 8 - это тот же серотип, что и эховирус 1, эховирус 10 теперь - реовирус 1, эховирус 28 - теперь человеческий риновирус A1A, эховирус 22 - теперь человеческий пареховирус 1, эховирус 23 - теперь человеческий пареховирус 2. Точно так же, вирус Коксаки А23 - тот же серотип. как эховирус 9, и вирус Коксаки А15 является тем же серотипом, что и вирус Коксаки А11, и вирус Коксаки А18 является тем же серотипом, что и вирус Коксаки А13.Вирусу гепатита A (род Hepatovirus ) ранее было присвоено название энтеровирус 72. Было обнаружено, что человеческий риновирус 87 является штаммом энтеровируса D68. Ряд обезьяньих вирусов (SV), ранее перечисленных как предварительные члены этого рода, были перемещены в род Sapelovirus , вид Sapelovirus B и переименованы в обезьяний сапеловирус (SSV) 1 (ранее SV2), SSV-2 ( ранее SV 49) и SSV-3 (ранее SV16, SV-18, SV42, SV44 и SV45). Обезьяний агент 4 (SA4), SV4, SV28 и вирус бляшек A2 были отнесены к виду Enterovirus H .Обезьяньи энтеровирусы N125 и N203 были помещены в новый тип, энтеровирус 108, который был отнесен к виду Энтеровирус J , наряду с энтеровирусом 103 и обезьяньим вирусом 6. Тип SV-47 остается не привязанным к виду. Энтеровирусы свиней (PEV), принадлежащие к группе I CPE (типы 1-7 и 11-13), были перемещены в род Teschovirus , вид Teschovirus A и переименованы в тешовирус свиней (PTV) 1-10. Представители исчезнувшего вида Свиной энтеровирус A (PEV тип 8; CPE группа II) были перемещены в род Sapelovirus и переименованы в Sapelovirus A (серотип свиной сапеловирус 1).Умерший вид энтеровирус свиней B (PEV типы 9, 10; CPE группа III) был переименован в Enterovirus G .

LOINC 88721-6 - РНК риновируса + энтеровируса [присутствие] в носоглотке по NAA с обнаружением зонда

Описание деталей

LP35705-0 Риновирус + энтеровирус
Риновирусы человека (ВСР) можно разделить на три генетически различных группы ВСР, обозначенные группами A, B и C, в пределах рода Enterovirus и семейства Picornaviridae.ВСР представляют собой вирусы с положительной одноцепочечной РНК (оцРНК) длиной примерно 7200 п.н. ВСР, которые являются причиной более половины простудных заболеваний, обычно связаны с инфекциями верхних дыхательных путей, средним отитом и синуситом. ПЦР-тестирование для обнаружения респираторных вирусов привело к признанию ВСР патогеном нижних дыхательных путей, особенно у пациентов с астмой, младенцев, пожилых пациентов и лиц с ослабленным иммунитетом. В настоящее время нет одобренных противовирусных препаратов, и лечение носит преимущественно поддерживающий характер. Источник: Regenstrief LOINC, PMCID: PMC3553670

LP35705-0 Риновирус + энтеровирус
Энтеровирусы представляют собой небольшие одноцепочечные РНК-вирусы без оболочки в семействе пикорнавирусов, в том числе вирусы Коксаки, риновирусы, эховирусы и полиовирусы. Они являются наиболее распространенным вирусным патогеном во всем мире, и клинические проявления варьируются от легких, похожих на простуду симптомов до тяжелых инфекций, включая энцефалит, асептический (вирусный) менингит и миокардит.Энтеровирусная инфекция также связана с началом сахарного диабета I типа. [PMID: 23764548] Источник: Regenstrief LOINC, PMID: 23764548

Авторские права третьих лиц

Этот материал включает клинические термины SNOMED® (SNOMED CT®), которые используются с разрешения Международной организации по разработке стандартов терминологии здравоохранения (IHTSDO) по лицензии. Все права защищены. SNOMED CT® был первоначально создан Колледжем американских патологов.«SNOMED» и «SNOMED CT» являются зарегистрированными товарными знаками IHTSDO.

Этот материал включает содержимое версии SNOMED CT для США, которая разработана и поддерживается Национальной медицинской библиотекой США и доступна авторизованным лицензиатам UMLS Metathesaurus на сайте UTS Downloads по адресу https: //uts.nlm.nih. губ.

Использование содержимого SNOMED CT регулируется условиями, изложенными в Партнерском лицензионном соглашении SNOMED CT. Лица, внедряющие этот продукт, несут ответственность за обеспечение надлежащей лицензии, а дополнительную информацию о лицензии, в том числе о том, как зарегистрироваться в качестве Аффилированного лицензиата, можно найти по адресу http: // www.snomed.org/snomed-ct/get-snomed-ct или [email protected] . За это может взиматься плата в странах, не являющихся членами SNOMED International.

Вторая открытая рамка считывания энтеровируса человека определяет репликацию вируса в эпителиальных клетках кишечника

Плазмиды и реагенты

Плазмиды pEGFP-LC3 (Addgene, 24920), pRSV-Rev (Addgene, 12253), pMDLg / pRRE (Addgene, 12251 ) и pCMV-VSV-G (Addgene, 8454) были приобретены у Addgene. EV-A71 BrCr / USA / 1970 (GenBank: U22521), EV-A71 10857 / NED / 1966 (GenBank: AB575912), EV-A71 11977 / NED / 1971 (GenBank: AB575913), EV-A71 20233 / NED / 1983 (GenBank: AB575923), EV-A71 MY821-3 / 1997 (GenBank: DQ341367), EV-A71 5865 / sin / 000009 / SIN / 2000 (GenBank: AF316321), EV-A71 5511-SIN-00 (GenBank: DQ341364 ), EV-A71 5511-SIN-00 (GenBank: DQ341364), EV-A71 NED / 1991 (GenBank: AB575935), EV-A71 Tainan / 5746/98 / TW / 1998 (GenBank: AF304457), EV-A71 06 -KOR-00 / KOR / 2000 (GenBank: DQ341355), EV-A71 SHZH98 / CHN / 1998 (GenBank: AF302996), EV-A71 2007-07364 / TW / 2007 (GenBank: EU527983), CV-A16 G-10 (Генбанк: U05876.1), CV-B3 Nancy (GenBank: JX312064.1), Echovirus 6 D'Amori (GenBank: AY302558.1), Echovirus 19 Burke (GenBank: AY302544.1), EV-B73 088 / SD / CHN / 04 ( GenBank: KF874626.1), векторы экспрессии ORF2p полиовируса 1 Mahoney (GenBank: V01149.1), CV-A24 Joseph (GenBank: EF026081.1) и EV-C96 BAN00-10488 (GenBank: EF015886.1) были получены из Generay Biotech Co. Ltd. (Шанхай, Китай). Вкратце, фрагменты, содержащие кодирующие последовательности вариантов ORF2p, фланкированные 5'-сайтами EcoR I и 3'BamH I-сайтами, вставляли в вектор pCDH-CMV-MCS-EF1-Puro (System Biosciences, LLC).Мутанты pCDH-CMV-MCS-EF1-Puro-ORF2p, использованные в этом исследовании, были получены путем одноцентровой мутации. pEV-A71 ORF2p-HA амплифицировали с помощью ПЦР и клонировали в вектор VR1012. Инфекционный клон кДНК pA12-EV-A71 (AH08 / 06) был любезно предоставлен доктором Т. Ченгом. Мутанты EV-A71ΔORF2p получали с использованием набора для сайт-направленного мутагенеза Q5® (New England Biolabs) для введения стоп-кодона на остатке 6 ORF2p. EV-A71 (OR-HA-F2), EV-A71 WIG / AAA и EV-A71 HPV / AAA также были получены посредством сайт-специфического мутагенеза.Олигонуклеотиды, использованные в этом исследовании, перечислены в дополнительной таблице 1.

Антисыворотка была получена путем иммунизации кроликов полипептидом, содержащим 20 С-концевых остатков ORF2p, и антитело было очищено с использованием колонки с антигеном ORF2p (HuaBio, Ханчжоу, США). Китай). Антитело против энтеровируса 71 VP1 (разведение 1: 1000; GTX132338) и антитело против энтеровируса D68 VP1 (разведение 1: 1000; GTX132313) были приобретены в GeneTex (Сан-Антонио, США). Моноклональные мышиные антитела против α-тубулина (разведение 1: 2000; A01410) были приобретены у GenScript (Piscataway, USA).Поликлональное кроличье антитело против НА (разведение 1: 2000; 71-5500) было приобретено в Thermo Fisher Scientific (Рочестер, Нью-Йорк, США). HA-Tag (6E2) мышиные mAb (разведение 1: 800; конъюгат Alexa Fluor® 488) (2350) и реагент ProLong® Gold Antifade с DAPI (8961) были получены от Cell Signaling Technology, Inc. (Миннесота, США). Антитело против LC3B (разведение 1: 1000; L7543) было приобретено у Sigma (Дармштадт, Германия).

Клетки

НТ-29 человека IEC (банк клеток Китайской академии наук, TCHu103) культивировали в среде McCoy's 5a с добавлением 10% фетальной бычьей сыворотки (FBS) и раствора пенициллина / стрептомицина.LS 174 T человеческие IECs (ATCC, CL-188), 293 T человеческие эмбриональные клетки почек (ATCC, CRL-3216), RD клетки рабдомиосаркомы человека (ATCC, CCL-136), эпителиальные клетки шейки матки человека HeLa (ATCC, CCL-2 ), Клетки почек африканской зеленой мартышки Vero (ATCC, CCL-81), клетки гепатоцеллюлярной карциномы человека HepG2 (ATCC, HB-8065), A549 (ATCC, CRM-CCL-185) и клетки мотонейрона мыши NSC-34 (Cedarlane Laboratories, CLU140) культивировали в среде Игла, модифицированной Дульбекко, с добавлением 10% FBS и раствора пенициллина / стрептомицина.Клетки лимфомы человека U937 (ATCC, CRL-1593.2), IEC человека HCT-8 (ATCC, CCL-244), IEC человека Hce-8693 (банк клеток Китайской академии наук, TCHu 70) и IEC человека LS513 (банк клеток Китайской академии наук, TCHu237) культивировали в среде RPMI-1640 с добавлением 10% FBS и раствора пенициллина / стрептомицина. Клетки U937 дифференцировали добавлением 100 нМ форбол-12-миристат-13-ацетата (PMA) в течение 48 часов. IECs человека LoVo (банк клеток Китайской академии наук, TCHu 82) культивировали в среде F-12K с добавлением 10% фетальной бычьей сыворотки (FBS) и раствора пенициллина / стрептомицина.МЭК человека RKO (ATCC, CRL-2577) культивировали в минимальной необходимой среде Игла с добавлением 10% фетальной бычьей сыворотки (FBS) и раствора пенициллина / стрептомицина.

ИЭК человека были предоставлены компанией Fenghbio, Inc. (Чанша, Китай). Все исследования были одобрены этическим комитетом Института вирусологии и исследования СПИДа Первой больницы Цзилиньского университета. Письменное информированное согласие было получено от родителей, участвовавших в нашем исследовании. Для выделения IEC человека свежую нормальную ткань человека, окружающую карциному кишечника, получали от донора рака и трижды промывали промывочным буфером (1% пенициллин / стрептомицин в буфере PBS).Человеческую ткань разрезали на сегменты размером 1 мм, а затем переносили в буфер для расщепления коллагеназы на 30 мин при 37 ° C. Клетки центрифугировали при 1000 g в течение 5 мин, осажденные клетки промывали, ресуспендировали в свежей культуральной среде и культивировали при 37 ° C с 5% CO 2 .

Для создания клеток HT-29, экспрессирующих ORF2p, мы котрансфицировали Т-клетки HEK 293 с помощью pCDH, pCDH-ORF2p плюс pRSV-Rev, pMDLg / pRRE и pCMV-VSV-G с использованием липофектамина 2000 (Invitrogen) в соответствии с инструкции производителя.Через два дня после трансфекции собирали среду для культивирования клеток. Клеточный дебрис удаляли центрифугированием при 10000 × g в течение 5 минут, и супернатанты хранили при -80 ° C. Супернатанты инкубировали с клетками HT-29 в течение 6 ч, а затем среду заменяли свежей культуральной средой. Трансдуцированные клетки отбирали в 10% FBS-DMEM с добавлением пуромицина (2 мкг / мл; Sigma) через день после заражения.

Вирусы

EV-D68 прототип Fermon (ATCC, VR-1826) размножали в клетках RD.Вирусы EV-D68 в супернатантах инфицированных клеток собирали, осветляли низкоскоростным центрифугированием и пропускали через фильтр 0,22 мм, а вирусные частицы осаждали через подушку из 20% сахарозы в роторе SW28 при 28000 об / мин в течение 90 мин. Очищенные вирионы хранили при -80 ° C.

Выделение вируса из инфекционной кДНК

Синтезированные in vitro РНК-транскрипты были получены с использованием набора RiboMAX ™ Large Scale RNA Production Systems-Sp6 kit (Madison, Promega) с MluI-линеаризованным pA12-EV-A71 или мутантным клоном в качестве шаблон.Полученные РНК трансфицировали в клетки RD с помощью липофектамина 3000 в соответствии с инструкциями производителя.

Анализ титра вирусов

Титры вирусов определяли по появлению ЦПЭ в клетках RD с помощью микротитрования по методу Рида-Мюнча 46 . Титры вирусов выражали как инфекционную дозу в культуре ткани 50% (TCID50).

Иммуноблоттинг

Образцы клеток собирали соскабливанием, дважды промывали холодным PBS, лизировали в буфере для лизиса (150 мМ Трис, pH 7.5, с 150 мМ NaCl, 1% Triton X-100 и полным коктейлем в таблетках с ингибитором протеазы [Roche]) при 4 ° C в течение 30 минут и центрифугировании при 10000 g в течение 30 минут. Супернатанты смешивали с 1X загрузочным буфером (0,08 М Трис, pH 6,8, с 2,0% SDS, 10% глицерина, 0,1 М DTT и 0,2% бромфенолового синего) и кипятили в течение 5 мин. Лизаты клеток разделяли с помощью SDS-PAGE и переносили на нитроцеллюлозные мембраны с использованием полусухого аппарата (Bio-Rad). Мембраны зондировали различными первичными антителами против интересующих белков; вторичными антителами были конъюгированные с щелочной фосфатазой антитела против козьего IgG и против мышиного IgG (Jackson ImmunoResearch Laboratories).Окрашивание проводили растворами 5-бром-4-хлор-3-индолилфосфата и NBT, приготовленными из химикатов, полученных от Sigma-Aldrich (Милуоки, США). Необрезанные кляксы предоставляются в виде файла исходных данных.

Количественная ПЦР в реальном времени (qRT-PCR)

Общую РНК из клеток выделяли с использованием TRIzol (Life Technologies) в соответствии с инструкциями производителя, включая стадию расщепления ДНКазой I. Образцы инкубировали в 10 мкл воды, обработанной диэтилпирокарбонатом (DEPC), с 1x буфером для ДНКазы без РНКазы RQ1, 1 мкл ДНКазы без РНКазы RQ1 (Promega) и ингибитором РНКазы 4 ед. (New England Biolabs) в течение 30 мин при 37 °. С.Активность ДНКазы инактивировали добавлением 1 мкл стоп-раствора ДНКазы RQ1 и инкубацией при 65 ° C в течение 10 мин. РНК подвергали обратной транскрипции с использованием случайных праймеров и обратной транскриптазы Multiscribe из набора High-Capacity cDNA Archive (Applied Biosystems) в соответствии с инструкциями производителя. КДНК либо использовали в неразбавленном виде, либо серийно разбавляли в воде, обработанной DEPC, перед ПЦР в реальном времени, чтобы гарантировать, что амплификация находится в линейном диапазоне обнаружения. Для амплификаций qRT-PCR использовали систему StepOne Real-Time PCR (Applied Biosystems, Carlsbad, CA).Реакции проводили при следующих условиях: 50 ° C в течение 2 минут и 95 ° C в течение 10 минут; 40 циклов 95 ° C в течение 15 с и 60 ° C в течение 1 мин; и протокол диссоциации. Отдельные пики в анализе кривой плавления указывают на конкретные ампликоны.

Люциферазный анализ

Для оценки вирусной транскрипционной активности EV-A71 и EV-A71ΔORF2p мы сконструировали управляемую промотором плазмиду люциферазы светлячка p5'UTR WT-pGL3, p5'UTR ΔORF2p-pGL3 и экспрессионную плазмиду VR1012 p3D. p5'UTR-Luc (200 нг) трансфицировали или котрансфицировали p3D-VR1012 (800 нг) в клетки 47 .Люциферазную активность оценивали через 48 ч после трансфекции. Вкратце, клетки собирали и лизировали с помощью буфера для пассивного лизиса, а затем центрифугировали при 12000 × g в течение 10 мин. Супернатанты и субстрат люциферазы (Promega, E190) смешивали в 96-луночном планшете, и флуоресценцию определяли количественно с помощью прибора Fluoroskan Ascent TM FL (Thermo Fisher, 5210450).

Иммуноокрашивание и конфокальная микроскопия

Клетки HT-29 трансфицировали pEV-A71 ORF2p-HA.Через 36 часов обработанные клетки переносили на покровные стекла на ночь и затем фиксировали в течение 15 минут 4% параформальдегидом в PBS, проницаемость в течение 10 минут в 0,1% Triton X-100 в PBS и блокировали с использованием 5% BSA в течение 1 часа. Затем клетки инкубировали с мышиным mAb HA-Tag (6E2) (конъюгат Alexa Fluor® 488) при 4 ° C в течение 16 часов. Ядра контрастировали 4,6-диамидино-2-фенилиндолом (DAPI). Изображения были получены с помощью лазерного сканирующего конфокального микроскопа ZEISS. Для сбора данных использовалось программное обеспечение ZEISS ZEN Microscope.Для визуализации живых клеток клетки HT-29 трансфицировали в стеклянных чашках для культивирования клеток со стеклянным дном и затем визуализировали через 24 часа под конфокальным лазерным сканирующим микроскопом Olympus FV3000 (Olympus; Токио, Япония). Все изображения были получены с использованием объектива × 63, а анализ изображений и обработка изображений были выполнены с помощью программного обеспечения ImageJ.

Анализы прикрепления вирусов

Для экспериментов по прикреплению вирусов клетки сначала промывали холодной DMEM, а затем к клеткам добавляли вирусы EV-A71.После инкубации при 4 ° C или 37 ° C в течение 2 ч обработанные клетки промывали холодной DMEM для удаления несвязавшихся вирусов. Тотальную РНК экстрагировали с помощью набора RNeasy Mini Kit (Qiagen). Связанную вирусную РНК определяли с помощью qRT-PCR.

Определение pH внутриэндосом

Мы использовали амино-реактивные pHrodo красители (Life Technologies, каталожный номер P35368) для обнаружения изменений pH вирусосодержащих эндосом 47 . Вирус EV-A71 очищали и растворяли в PBS и инкубировали с амино-реактивными красителями pHrodo в течение 40 мин при комнатной температуре в темноте, затем повторно очищали осаждением через подушку из сахарозы перед заражением.Затем клетки высевали на стеклянные пластины на ночь. Затем клетки инфицировали вирусом EV-A71, конъюгированным с красителем, при 4 ° C в течение 30 мин, промывали PBS, инкубировали при 37 ° C и наблюдали в указанный момент времени с помощью конфокального микроскопа.

Модель инфекции новорожденных мышей

Неонатальных мышей без специфических патогенов (SPF) ICR в течение 24 часов после рождения (Центр экспериментальных животных, Колледж базовой медицины, Университет Цзилинь) использовали для создания модели вирусной инфекции на животных. Все протоколы для животных были одобрены институциональным комитетом по уходу за животными и их использованию и строго соблюдались.Были приложены все усилия, чтобы минимизировать страдания животных. Новорожденных мышей случайным образом разделили на 5 групп ( n = 8–10 на группу) и интрацеребрально инокулировали двумя разными дозами вируса EV-A71, вируса EV-A71ΔORF2p или DMEM. Уровень выживаемости контролировали ежедневно в течение 20 дней после заражения. Контрольные мыши оставались здоровыми на протяжении всего эксперимента. Все эксперименты на животных проводились в соответствии с протоколами, утвержденными Подкомитетом по исследованию животных Института вирусологии и СПИДа.

Статистический анализ

Различия между тестовыми группами анализировали с помощью ANOVA (Stata Corp, College Station, TX). Значение p <0,05 считалось значимым.

Сводка отчетов

Дополнительная информация о дизайне исследований доступна в Сводке отчетов по исследованиям природы, связанной с этой статьей.

Границы | Структура, функция и механизмы действия неструктурного белка энтеровируса 2C

Введение

Род Enterovirus (EV) состоит из большого количества РНК-вирусов, принадлежащих к семейству Picornaviridae , включая группы энтеровирусов человека A, B, C и D, а также энтеровирусы нечеловеческого происхождения (Zoll et al., 2009). Из этих патогенов энтеровирус A71 (EV-A71) и вирус Коксаки A16 (CV-A16) являются наиболее частыми возбудителями болезней рук, ног и рта (HFMD), от которых ежегодно страдают миллионы людей, особенно младенцев и детей младше 10 лет. 5-летнего возраста в Азиатско-Тихоокеанском регионе (Wang et al., 2018). Хотя HFMD обычно самоограничивается, он может привести к серьезным осложнениям, таким как асептический менингит, острый вялый паралич, неврологический респираторный синдром или смертельное респираторное заболевание (Chang et al., 1998; Zell et al., 2017). Однако другие патогены группы EV-A человека, не относящиеся к EV-A71 и не-CV-A16, такие как CV-A6, CV-A10 и CV-A4, являются преобладающими совместно циркулирующими серотипами, которые вызывают HFMD в Китае с тех пор. 2013 г. (He et al., 2013; Li et al., 2018a; Ji et al., 2019; Xie et al., 2020).

Энтеровирусы - это вирусы сферической формы без оболочки с диаметром от 28 до 30 нм и одиночной положительно -цепочечной РНК. Геном этих энтеровирусов имеет длину примерно 7,5-8,0 т.п.н. и содержит одну открытую рамку считывания (ORF), фланкированную высокоструктурированной 5'-нетранслируемой областью (5 'UTR) и 3' UTR с поли (A) хвостом. .5 'UTR состоит из структуры РНК клеверного листа, за которой следует внутренний сайт входа в рибосомы (IRES). IRES - это высокоструктурированная РНК, которая напрямую рекрутирует рибосомы для трансляции вирусных белков независимым от кэпа образом (Fitzgerald and Semler, 2009). Как показано на рисунке 1, геном изначально транслируется в один большой полипротеин, состоящий примерно из 2200 аминокислотных остатков. Этот полипротеин протеолизируется в белки-предшественники P1, P2 и P3, а затем расщепляется ко- и посттрансляционно вирусными протеазами 2A, 3C и 3CD (Cameron et al., 2010; Lyoo et al., 2017). Белок-предшественник P1 расщепляется на капсидные белки VP3, VP1 и VP0. Затем VP0 делится на VP4 и VP2. Белок-предшественник P2 процессируется с образованием вирусной протеазы 2A и полипротеина 2BC, а полипротеин 2BC далее расщепляется на два неструктурных белка, 2B и 2C. Белок-предшественник P3 сначала протеолизируется до 3AB и 3CD, а затем протеолизируется с образованием белков 3A, 3B, 3C и 3D (McMinn, 2002).

Рисунок 1 .Схематическое изображение генома энтеровируса A71 (EV-A71) и протеолитический процессинг полипротеина. Полипротеин был расщеплен на четыре вирусных белка, VP1 – VP4, и семь неструктурных белков, включая 2A – 2C и 3A – 3D.

Большинство опубликованных исследований сосредоточено на структурных белках энтеровирусов или неструктурных протеазах 2A и 3C и 3D-полимеразе, тогда как важность неструктурного белка 2C практически игнорируется. В этой статье мы обобщаем структуру, функцию и механизм регуляции врожденной иммунной системы хозяина и противовирусных препаратов белка энтеровируса 2С.

Общая функция белков энтеровируса 2C

Белок

Enterovirus 2C является наиболее консервативным и сложным неструктурным белком, но его функции недостаточно изучены (Norder et al., 2011). Сообщалось о многочисленных биологических функциях белка 2C как части жизненного цикла вируса (таблица 1), включая снятие оболочки вируса (Li and Baltimore, 1990), перестройку мембран клетки-хозяина (Cho et al., 1994; Aldabe and Carrasco, 1995). ; Teterina et al., 1997; Suhy et al., 2000), связывание РНК (Rodriguez, Carrasco, 1995; Banerjee et al., 1997, 2001; Banerjee and Dasgupta, 2001), репликация РНК (Li and Baltimore, 1988; Rieder et al., 2000; Paul et al., 2003; Teterina et al., 2006; Tang et al., 2007), инкапсидация и морфогенез (Vance et al., 1997; Verlinden et al., 2000; Liu et al., 2010; Wang et al., 2012a, 2014) и активности АТФазы (Rodriguez, Carrasco, 1993; Mirzayan and Wimmer, 1994).

Таблица 1 . Функция неструктурных белков 2С энтеровирусов.

Было предсказано, что белок 2C является геликазой SF3 на основании его активности AAA + ATPase и консервативных мотивов SF3 (Gorbalenya and Koonin, 1989; Rodriguez and Carrasco, 1993; Pfister and Wimmer, 1999).В 2015 году было впервые продемонстрировано, что белок 2C EV-A71 и CV-A16 обладает АТФ-зависимой РНК-геликазой и АТФ-независимой шаперонирующей активностью, которая имеет решающее значение для репликации вирусной РНК (Xia et al., 2015). Эти результаты показывают, что активности РНК-геликазы и РНК-шаперонирования, две разные активности ремоделирования РНК, могут быть интегрированы в белок 2C, что предполагает жизненно важную роль белка 2C в ремоделировании белков вирусной РНК (Xia et al., 2015) .

Взаимосвязь между структурой и функцией белков 2С в жизненном цикле энтеровирусов

Белок 2C обычно имеет 330 аминокислотных остатков.Он содержит N-концевой мембранно-связывающий домен, центральный домен АТФазы, богатый цистеином домен и C-концевой спиральный домен (рис. 2A; Banerjee et al., 2004). Домен АТФазы 2С проявляет структурные характеристики геликаз SF3 суперсемейства ААА + АТФаз, которое состоит из мотивов Уокера A и Уокера B и мотива C (рис. 2B; Singleton et al., 2007). Недавно Guan et al. Сообщили о кристаллической структуре растворимой части (116–329 а.о.) геликазы EV-A71 2C. (2017), первая 2С структура высокого разрешения в семействе Picornaviridae .EV-A71 2C имеет необычный цинковый палец с тремя цистеиновыми лигандами. Однако, в отличие от других АТФаз, С-конец EV-A71 2C образует амфипатическую спираль, которая опосредует самоолигомеризацию через специфическое взаимодействие между 2C-2C, а самоолигомеризация является фундаментальной для активности 2C-АТФазы и репликации вируса EV-A71.

Рисунок 2 . Функциональные мотивы и выравнивание последовательностей белка энтеровируса 2С. (A) Функциональные мотивы в белке 2C АТФазы показаны подробно, включая мотивы связывания с мембраной, связывания РНК, связывания цинка, олигомеризации и амфипатические мотивы.Расположение известных мутаций, соответствующих морфогенезу, инкапсидации, непокрытию, взаимодействию капсида, активности АТФазы, гомоолигомеризации и температурной чувствительности, показано разными символами. Точные положения R-пальца и сайтов связывания цинка указаны в соответствии с кристаллической структурой белка EV-A71 2C. Позиции аминокислот в каждом мотиве пронумерованы и проиллюстрированы, а точный вид каждой мутации указан позади положения аминокислоты. (B) Выравнивание последовательностей белка энтеровируса 2C.Положения аминокислот, упомянутые в (A) , выделены поверх последовательностей разными цветами, причем PV 2C - красным, EV-A71 2C - зеленым, а положения, общие для обеих последовательностей, - синим. Прочерки обозначают аминокислотные остатки, идентичные аминокислотным остаткам белка PV 2C.

Белок 2C

Полиовируса (PV) является наиболее интенсивно изучаемым белком 2C в семействе Picornaviridae . Недавно Guan et al. (2018) сообщили о структуре части белка PV 2C с высоким разрешением (116–329 а.о.).Их результаты показали, что самоолигомеризация, опосредованная С-концевой спиралью белка PV 2C, также происходит через специфическое взаимодействие между 2C-2C, как у EV-A71 2C. Это взаимодействие жизненно важно для активности АТФазы белка и является общей чертой белков энтеровируса 2С. PV 2C и EV-A71 2C обладают почти идентичной геометрией и каталитическими остатками активного центра АТФазы, который образуется между этими субъединицами 2C, и должны иметь сходные функции (Mirzayan and Wimmer, 1994; Pfister and Wimmer, 1999).Однако часть белка, которая наиболее структурно отличается между PV 2C и EV-A71 2C, - это цинковый палец. PV 2C имеет четыре потенциальных координационных сайта цинка (PCS1-4) в мотиве, богатом цистеином, что указывает на канонический цинковый палец типа CCCC, в то время как EV-A71 2C и многие другие белки энтеровируса 2C имеют только цинковый палец типа CCC, который не имеет Остаток цистеина PCS2 (рис. 2В). Сообщалось, что PCS2 PV 2C связан с чувствительными к температуре фенотипами и дефектами инкапсидации (Klein et al., 2000; Wang et al., 2014), но цинковый палец EV-A71 2C, к которому PCS2 был добавлен в результате мутации, не смог улучшить его инфекционность. Дальнейшие исследования показали, что PCS2 и PCS4 могут взаимодействовать с другими белками во время инкапсидации, в то время как PCS1 и PCS3 необходимы для поддержания сворачивания цинкового пальца и всего гексамера (Guan et al., 2018). Следовательно, различие в последовательности и структуре белка 2C может лежать в основе специфичности белка 2C энтеровируса и может определять процессы, в которых он может участвовать.

В неструктурных белках 2C энтеровируса были идентифицированы многочисленные остатки, сайты устойчивости к лекарствам и функциональные мотивы, которые имеют решающее значение для различий в соответствующей функции 2C (рис. 2A). На активность АТФазы и геликазы белка 2C в основном влияют мутации в мотиве Walker A (позиции 129–136; Wang et al., 2014), мотиве Walker B (положения 172–177; Wang et al., 2014), Мотив C (позиции 217–223; Xia et al., 2015) и палец R (R240 и R241; Guan et al., 2017). Было обнаружено, что остатки, скрытые в гидрофобном ядре белка 2C, важны для общей укладки (Guan et al., 2018). Сообщалось, что мутации белка 2C в положениях Q65, L125 и V218 важны для инкапсидации и морфогенеза (Vance et al., 1997; Wang et al., 2014; Asare et al., 2016), в то время как мутации в V218, M246 и I248 учитывали температурную чувствительность (Li and Baltimore, 1988; Dove and Racaniello, 1997). Мутации в L327 и F328, которые оба расположены в кармане-связывающем домене (PBD), могут отменять АТФазную активность и гомоолигомеризацию как PV 2C ATPase , так и EV-A71 2C геликаз, а также могут подавлять EV-A71. инфекция, что указывает на их важную роль в активности 2C (Guan et al., 2017, 2018). Остатки между 21–45 и 312–319 в белке PV 2C имеют решающее значение для связывания РНК (Tolskaya et al., 1994), тогда как остатки 21–54 важны для связывания с мембраной (Echeverri and Dasgupta, 1995), а положения 269– 286 необходимы для связывания цинка (Klein et al., 2000). Кроме того, 2C ATPase содержит две амфипатические спирали на N- и C-концах, которые могут помочь закрепить белок на мембранах и связываться с цинком (Рисунок 2; Paul et al., 1994; Teterina et al., 1997; Wang et al., 2014).

Liu et al. (2010) обнаружили, что сайт взаимодействия находится между остатком N252 PV 2C и E180 капсидного белка VP3 CV-A20, используя химеру PV / CV-A20, что указывает на важную роль N252 в инкапсидации. Было обнаружено, что мутант K259A PV 2C играет жизненно важную роль в инкапсидации и последующей стадии удаления оболочки во время следующего цикла инфекции (Asare et al., 2016). Wang et al. (2012a) идентифицировали остатки K279 и R280, которые расположены на С-конце белка PV 2C, как участвующие в репликации и инкапсидации РНК.Было показано, что C270, C281 и C286 цинкового пальца важны для правильного сворачивания белка EV-A71 2C (Guan et al., 2017). Предыдущие исследования показали, что и 2C, и его предшественник 2BC обладают активностью АТФазы и могут способствовать образованию комплекса репликации РНК, с помощью которого она прикрепляется к мембранам (Pfister et al., 2000). Продукция вируса EV-A71 была полностью подавлена ​​ключевыми мутациями в K135A и D176N, которые расположены в мотивах Walker A и B, что указывает на важную роль АТФазной активности 2C в репликации вируса.Активность АТФазы 2C также может подавляться мутациями в R240 и R241, независимо от того, была ли аминокислота мутирована в A или K, что позволяет предположить, что «палец R» может играть важную роль в гидролизе АТФ (Guan et al., 2017).

Ремоделеры РНК

бывают двух разных типов: РНК-геликазы и РНК-шапероны. Сообщалось, что эти высокоструктурированные РНК-элементы вирусов, особенно РНК-вирусов, используют РНК-геликазы или шапероны для обеспечения правильного сворачивания и повторного сворачивания (Xia et al., 2015). РНК-геликазы могут раскручивать дуплексы РНК, используя энергию гидролиза АТФ. Однако РНК-шапероны представляют собой группу белков, которые обладают способностью дестабилизировать дуплексы РНК и могут преобразовывать их в более стабильные структуры РНК без связывания РНК или с использованием энергии гидролиза АТФ (Musier-Forsyth, 2010; Yang et al., 2015 ). Как и в случае с АТФазой PV 2C , активность АТФазы и геликазы EV-A71 2C может быть ингибирована мутацией GK134AA, которая отменяет репликацию РНК и производство вируса EV-A71, что позволяет предположить, что активность ремоделирования РНК, вводимая АТФазой 2C необходимы для репликации энтеровирусной РНК и жизненного цикла.Эти активности ремоделирования РНК также законсервированы в CV-A16 2C ATPase (Xia et al., 2015). Дальнейшие исследования показали, что C-конец является критическим для активности геликазы, а домены, которые отвечают за связывание РНК, необходимы для функции шаперонирования РНК 2C ATPase (Xia et al., 2015).

Внутренний сайт входа в рибосомы, который является высокоструктурированным элементом в геноме РНК, был обнаружен во всех пикорнавирусах и играет важную роль в процессе репликации и трансляции вирусов (Shih et al., 2011; Cheng et al., 2013). Во-первых, IRES может потребоваться РНК-шаперонирующая активность 2C АТФазы для облегчения отжига цепи РНК для правильного сворачивания и повторного сворачивания во время репликации вируса. Кроме того, во время репликации РНК в жизненном цикле вируса раскручивание промежуточной дцРНК важно для эффективного рециклинга вирусной РНК-матрицы и последующего продуцирования вирусной РНК потомства. Что касается репликации РНК энтеровируса, вполне вероятно, что раскручивание дцРНК осуществляется за счет активности РНК-геликазы белка 2C, поскольку сообщалось, что АТФазная активность EV-A71 2C может способствовать 3D-опосредованному синтезу энтеровирусной РНК. in vitro , способствуя рециклингу вирусной РНК-матрицы (Xia et al., 2015). Между тем, дефектная активность АТФазы и геликазы у EV-A71 2C может почти уничтожить репликацию РНК и жизнеспособность вируса в эксперименте с инфекционными клонами.

Сообщалось, что суперсемейство AAA + ATPase обычно собирается в гексамерную кольцевую структуру для выполнения соответствующих функций (Gai et al., 2004; Enemark and Joshua-Tor, 2006). Поскольку EV-A71 2C и PV 2C принадлежат к этому суперсемейству, известно, что они образуют гексамерное кольцо, которое облегчит дальнейшее понимание функций 2C и обеспечит важные сайты для развития ингибиторов 2C (Guan et al., 2017, 2018).

Энтеровирусы Белки 2C участвуют в различных процессах и выполняют множество функций в жизненном цикле вируса на основе консервативных структур 2C. N-конец белка 2C обладает несколькими важными мотивами, которые связаны со связыванием РНК, связыванием с мембраной, амфипатической активностью и олигомеризацией. Дальнейшие исследования будут сосредоточены на экспрессии более растворимых полноразмерных белков 2C и определении кристаллической структуры белков энтеровируса 2C.Кристаллографические данные помогут нам лучше понять взаимосвязь между функцией и структурой белков 2C, а также выяснить подробный механизм роли белков 2C в репликации и упаковке вирусов.

Связывание белка энтеровируса 2С с различными факторами хозяина

Факторы хозяина играют важную роль в жизненном цикле энтеровирусов, от проникновения вируса до процессов литического высвобождения (Wu et al., 2016). На сегодняшний день сообщается, что несколько факторов хозяина, связанных с неструктурным белком 2C, регулируют репликацию вируса (рис. 3).В 2007 году Tang et al. (2007), используя двухгибридный эксперимент, сообщили об идентификации ретикулона 3 (RTN3), члена семейства белков ретикулонов, в качестве партнера по связыванию белка EV-A71 2C в регуляции образования комплекса репликации вируса. , общий клеточный фактор среди белков CV-A16 и PV 2C. Эти результаты показывают, что N-конец белка 2C может взаимодействовать с RTN3. Было обнаружено, что аминокислотный остаток I25 EV-A71 2C играет ключевую роль во взаимодействии между 2C и доменом гомологии ретикулона (RHD) RTN3.Сходную функцию можно также наблюдать в белке PV 2C, в котором мутация I25K 2C может регулировать процессинг вирусного белка и репликацию РНК (Paul et al., 1994). Также были продемонстрированы специфические взаимодействия между C-терминальными RHDs всех четырех белков семейства RTN и EV-A71 2C (Tang et al., 2007).

Рисунок 3 . Обзор функций белков энтеровируса 2C, которые взаимодействуют с несколькими факторами хозяина и регулируют репликацию вируса и инфекцию.

В 2016 году Wu et al.(2016) использовали полногеномный скрининг РНКи в клетках RD человека и идентифицировали 256 факторов хозяина, участвующих в репликации EV-A71. Среди этих факторов регуляторы клеточного цикла авроракиназа B (AURKB) и циклин-зависимая киназа 6 (CDK6), как было показано, являются факторами устойчивости, ограничивающими инфекцию EV-A71, причем ядерный выход CDK6 регулируется EV-A71. Однако компоненты деградации, связанной с эндоплазматическим ретикулумом (ER), N-гликаназа 1 (NGLY1) и валозин-содержащий белок (VCP) были идентифицированы как факторы, поддерживающие хозяина, которые способствуют инфицированию и репликации EV-A71.Дальнейшие исследования выявили совместную локализацию репликационных комплексов NGLY1 и EV-A71 в ER для поддержки репликации EV-A71 (Wu et al., 2016). Предыдущие исследования показали, что p97 является фактором хозяина для PV (Arita et al., 2012) и необходим для репликации вируса гепатита C (HCV) (Yi et al., 2016). Wang et al. сообщили, что p97 является новым фактором хозяина, который является компонентом ERAD и участвует в репликации EV-A71. Механизм действия включает совместную локализацию RTN3 с 2C и p97 в инфицированных EV-A71 клетках и, таким образом, перераспределение и концентрацию в перинуклеарной области.RTN3, следовательно, перераспределяется от мембраны ER к вирусным органеллам во время инфекции EV-A71 (Wang et al., 2017). В 2020 году Су и др. (2020) показали, что множественные белки теплового шока 70 (HSP70s) использовались EV-A71 для участия во всех фазах жизненного цикла вируса, при этом HSPA9 помогал сворачиваться и стабилизировать белок 2C, а затем способствовал образованию комплекса репликации.

Кроме того, сообщалось, что комплекс белков оболочки I (COPI) и COPII участвует в образовании везикул, индуцированных пикорнавирусами.Wang et al. (2012b) сообщили, что COPI, но не COPII, необходим для репликации и продукции EV-A71, с механизмом регуляции, основанным на том факте, что только белок 2C может взаимодействовать с субъединицей катомера COPI. Совсем недавно TRIM4, exportin2 и ARFGAP1 были идентифицированы как новые факторы хозяина с помощью анализа GST pull-down с использованием протеомного анализа. Эти три белка были подтверждены как партнеры по связыванию 2C, и было продемонстрировано, что они являются новыми факторами зависимости от хозяина для EV-A71 (Li et al., 2019b). В частности, взаимодействия между 2C-exportin2 и 2C-ARFGAP1 были консервативными среди других энтеровирусов. Понимание взаимодействий вирус-хозяин важно для выяснения вирусного патогенеза и может предоставить целевые противовирусные препараты широкого спектра действия для энтеровирусной инфекции, поэтому будущие исследования будут сосредоточены на открытии новых факторов хозяина, которые взаимодействуют с белками 2C. Дальнейшие исследования также должны выяснить, участвуют ли эти факторы хозяина специфически или обычно в инфекциях, вызванных энтеровирусами.Необходимо изучить степень сохранения этих факторов хозяина среди других энтеровирусов и даже пикорнавирусов.

Влияние на иммунный ответ хозяина

Врожденная иммунная система является первой линией защиты человека от чужеродных и опасных материалов или патогенов и связана с активацией и программированием адаптивных иммунных ответов (Takeuchi and Akira, 2009). Врожденная иммунная система оснащена рецепторами распознавания образов (PRR) для обнаружения вторгающихся патогенов (Jin et al., 2018). Существует три пути, с помощью которых врожденная иммунная система обнаруживает и распознает вторгшиеся микроорганизмы (Turvey and Broide, 2010). Во-первых, PRR распознают чужеродные патогены как «чужеродные микроби» путем выявления молекулярных паттернов, связанных с патогенами (PAMP). Во-вторых, PRR могут распознавать общие метаболические последствия инфекции и воспаления и реагировать на них с помощью молекулярных паттернов, связанных с опасностями (DAMPs; Bianchi, 2007). Наконец, молекулы «отсутствующего я», полученные из нормальных здоровых клеток, но не инфицированных клеток или микробов, также могут распознаваться рецепторами врожденного иммунитета (Jin et al., 2018). Ретиноевой кислотой индуцируемый ген I (RIG-I) -подобные рецепторы (RLR), Toll-подобные рецепторы (TLR) и NOD-подобные рецепторы (NLR) являются тремя основными PRR, ответственными за индукцию продукции IFN типа I и воспалительные процессы. цитокины, которые являются важными регуляторами врожденного иммунитета при вирусных инфекциях (Akira et al., 2006). На сегодняшний день было показано, что семейство RLR состоит из трех членов: RIG-I, белок 5, связанный с дифференцировкой меланомы (MDA5), и лаборатория генетики и физиологии 2 (LGP2; Chen and Ling, 2019).И RIG-I, и MDA5 являются внутриклеточными сенсорами дцРНК. Различия между ними заключаются в том, что RIG-I распознает короткую двухцепочечную РНК (дцРНК) или 5'-трифосфатную одноцепочечную РНК (оцРНК) с поли (U / A) мотивами во время заражения РНК-вирусом, тогда как MDA5 распознает длинную дцРНК> 2 kb или вирусная РНК, лишенная 2-O-метилирования (Hornung et al., 2006; Kato et al., 2008; Zust et al., 2011; Goubau et al., 2014). RIG-I и MDA5 оба содержат два N-концевых домена рекрутирования каспаз (CARD), центральный DExD / H-бокс-АТФазный / геликазный домен и C-концевой регуляторный / репрессивный домен (Li et al., 2016а). После распознавания вирусной инфекции активированные RIG-I и MDA5 высвобождают свой домен CARD для взаимодействия с одним и тем же доменом митохондриального антивирусного сигнального белка (MAVS, также известного как IPS-1, VISA или CARDIF). Факторы транскрипции IFN-регуляторный фактор 3 (IRF3) и NF-κB активируются при взаимодействии с активированным MAVS (Kang et al., 2002; Yoneyama and Fujita, 2008; Fitzgerald et al., 2014). Активированные IRF3 и NF-κB впоследствии перемещаются в ядро ​​и стимулируют экспрессию IFN типа I, интерферон-стимулированных генов (ISG) и воспалительных цитокинов (Sato et al., 1998; Йонеяма и др., 1998). Таким образом, RIG-I и MDA5 играют важную роль в активации сигнального пути IFN.

Многие вирусы развили механизмы регуляции пути NF-κB для вирусной репликации и выживания клеток, чтобы избежать иммунных ответов хозяина. Как показано на рисунке 4, Zheng et al. (2011) обнаружили, что фосфорилирование IKKβ ингибируется белком EV-A71 2C, тем самым блокируя TNF-α-опосредованную активацию NF-κB. В частности, 2C может напрямую связываться с доменом KD IKKβ через 1–125 аминокислотных остатков N-конца, чтобы ингибировать фосфорилирование IKKβ (Zheng et al., 2011). Дальнейшие исследования Zheng et al. показали, что EV-A71 2C взаимодействует с протеинфосфатазой 1 (PP1), рекрутирует PP1 в IKKβ и, наконец, образует комплекс 2C-PP1-IKKβ для ингибирования фосфорилирования IKKβ и последующего пути передачи сигнала NF-κB. CV-A16 2C, CV-B3 2C и PV 2C также обладают способностью подавлять фосфорилирование IKKβ так же, как EV-A71 2C (Li et al., 2016b). Белок 2C связан как с репликацией вируса, так и с уклонением от врожденного иммунитета. Du et al. (2015) сообщили о двух разных путях, с помощью которых активация NF-κB подавляется белком EV-A71 2C.Одним из них был RelA (p65) / p50, преобладающая форма NF-κB; его димеризация ингибируется 105–125 и 126–203 а.о. EV-A71 2C, конкурируя за взаимодействие с доменом IPT p65, тем самым освобождая ассоциацию между p65 и p50. Другой механизм - подавление активации NF-κB с помощью 1–104 и 105–121 аминокислот 2C посредством ассоциации с IKKβ (Рисунок 4; Таблица 2).

Рисунок 4 . Взаимодействие между белком пикорнавируса 2C и путями NF-κB и индуцируемого ретиноевой кислотой гена I (RIG-I) -подобного рецептора (RLR).Белки энтеровируса 2C в основном участвуют в подавлении провоспалительных цитокинов, воздействуя на путь NF-κB, тогда как вирус ящура 2C регулирует соответствующий путь, подавляя экспрессию NOD-2. Показано, что два белка пикорнавируса 2С, включая вирус энцефаломиокардита (EMCV) и вирус долины сенека (SVV), нацелены на MDA5 и RIG-I пути RLR, что может побуждать нижестоящие медиаторы противодействовать противовирусному врожденному иммунитету.

Таблица 2 .Механизм подавления продукции IFN, подавления репликации вируса и индукции аутофагии белками пикорнавируса 2C.

На сегодняшний день было проведено относительно немного исследований белков энтеровируса 2C в путях RLR и NLR. Однако сообщалось, что неструктурные белки 2C других РНК-вирусов семейства Picornaviridae связаны с путем RLR. Как показано на рисунке 4, белок 2C вируса энцефаломиокардита (EMCV, род Cardiovirus ) взаимодействует с MDA5, подавляя индукцию экспрессии IFN-β (Li et al., 2019а). Подавление активности промотора IFN-β и способность взаимодействовать с MDA5 были уменьшены или утрачены мутацией V26 белка EMCV 2C. Кроме того, мутанты V26A и K25-3A EMCV 2C отменяли эффект снижения фосфорилирования IRF3. Wen et al. (2019) показали, что белки 2C и 3C вируса долины сенека (SVV, род Senecavirus ) могут ослаблять врожденную иммунную систему хозяина за счет деградации RIG-I через сигнальный путь каспазы. Недавно было продемонстрировано, что NLR играют жизненно важную роль в иммунном ответе хозяина во время вирусной инфекции (Lupfer and Kanneganti, 2013).Лю и др. продемонстрировали, что, наряду с 2B и 3C, белок 2C вируса ящура (FMDV, род Aphthovirus ) также может снижать экспрессию уровней белка NOD2, нового рецептора распознавания цитоплазматического вирусного паттерна, идентифицированного в 2009 г. ( Лю и др., 2019). Однако механизм восстановления NOD2 ящуром 2C не включает протеасомы, лизосомы, каспазы, клеточный апоптоз или расщепление eIF4G. Укорочение 116-260 FMDV 2C, как было продемонстрировано, играет жизненно важную роль во взаимодействиях с NOD2, но снижение экспрессии NOD2 не индуцируется усеченными мутантами 2C (Figure 4; Table 2).В заключение, клетки-хозяева разработали несколько стратегий против вирусных инфекций; однако у вирусов появилось много антагонистических механизмов, позволяющих избежать врожденного иммунного ответа хозяина. Эти исследования привели к идентификации критической роли белков 2C как регуляторов иммуномодулирующих свойств. Дальнейшие исследования будут не только изучать подавление активации иммунного ответа хозяина белками 2C основных циркулирующих энтеровирусов, но также обеспечат общее понимание белков пикорнавируса 2C как жизненно важных механизмов, которые, вероятно, сохраняются в большинстве пикорнавирусов.

Регуляция аутофагии клетки-хозяина

Аутофагия - это консервативный внутриклеточный процесс, который действует, удаляя ненужные или дисфункциональные цитоплазматические белки и поврежденные или устаревшие органеллы, доставляя их в лизосомы для деградации и повторного использования (Klionsky, 2005; Esclatine et al., 2009). Наше предыдущее исследование было первым, в котором сообщалось, что вирусный белок 2C CV-A6 вносит вклад в патогенность CV-A6, вызывая гибель клеток через путь аутофагии (Wang et al., 2018), но механизм, лежащий в основе этого явления, требует дальнейшего выяснения (таблица 2).

В 2009 году Хуанг и др. (2009) сообщили, что инфекция EV-A71 может вызывать аутофагию и увеличивать репликацию вируса как in vitro , так и in vivo . EV-A71 2C, как было установлено, колокализуется с ассоциированным с микротрубочками белком 1 легкой цепи 3 (LC3) и маннозо-6-фосфатным рецептором (MPR), что указывает на потенциал образования амфисом и индукции аутофагии (Lee et al., 2014).Недавно Ли и др. (2018c) сообщили, что белок 2C EV-A71 может преодолевать подавление фактора рестрикции хозяина APOBEC3G (A3G) посредством пути аутофагия-лизосома, функции которого сохраняются среди EV-D68, CV-A6 и CV-A16. Процесс слияния аутофагосома-лизосома регулируется семейством белков рецептора прикрепления фактора, чувствительного к N -этилмалеимиду (SNARE) (Wang et al., 2016). Для функционирования пучков слияния SNARE требуется четыре α-спирали, включая Qa, Qb, Qc и R (Rizo, 2003).Syntaxin-17 (STX17) представляет собой Qa SNARE на завершенной аутофагосоме, который может координировать его слияние с др. Пузырьками (Itakura et al., 2012). Связанный с синаптосомами белок 29 (SNAP29) представляет собой цитозольный Qbc SNARE, который может отдавать свои спирали для образования пучка слияния посредством взаимодействия с STX17 (Morelli et al., 2014). Сообщается, что неструктурный белок 2BC EV-A71, который является белком-предшественником 2B и 2C, запускает образование автолизосом, которые облегчают репликацию вируса, взаимодействуя с обоими белками SNARE STX17 и SNAP29 (Таблица 2; Lai et al. al., 2017). Недавно Shi et al. (2015) обнаружили, что белка 2C CV-A16 достаточно для индукции неполной аутофагии. Связанная с иммунитетом активность промотора GTPase семейства M (IRGM) и уровни экспрессии белка повышаются за счет экспрессии CV-A16 2C, что впоследствии вызывает аутофагию. Неструктурный белок 2C EMCV участвует в запуске аутофагии, индуцированной EMCV-инфекцией в клетках BHK-21 (Hou et al., 2014). Аутофагия индуцируется EMCV 2C через активацию пути стресса ER путем регулирования экспрессии PERK и ATF6α, которые участвуют в пути UPR.Белок 2C вируса ящура локализован совместно с LC3, маркером аутофагосомы, в клетках, инфицированных вирусом ящура, что указывает на возможность индукции аутофагии вирусом ящура 2C (O’Donnell et al., 2011). Белок 2C ящура связывается с Beclin1, центральным регулятором пути аутофагии, тем самым подавляя слияние лизосом с аутофагосомами и последующую выживаемость вирусов (Table 2; Gladue et al., 2012). Взаимосвязь между вирусным белком 2C и белками, связанными с аутофагией клетки-хозяина, требует дальнейшего изучения, чтобы лучше оценить роль белка 2C в вирусной инфекции.

Влияние антивирусных препаратов на белок 2C

В пределах рода Enterovirus существуют две эффективные вакцины против двух патогенов человека, PV и EV-A71. Однако в настоящее время общее количество энтеровирусов человека превышает несколько сотен серотипов, и разработка вакцин против всех энтеровирусов маловероятна. Энтеровирусная инфекция может вызвать тяжелое, опасное для жизни заболевание, особенно у детей раннего возраста. Таким образом, существует острая необходимость в разработке новых противовирусных препаратов против различных типов энтеровирусов (Ulferts et al., 2016).

Поскольку 2C является высококонсервативным вирусным неструктурным белком, обладающим АТФазной активностью и функционально незаменимым, он является многообещающей мишенью для разработки лекарств, включающих ингибиторы энтеровирусов широкого спектра действия (Bauer et al., 2017). На сегодняшний день идентифицировано несколько противовирусных ингибиторов, нацеленных на белок 2C, включая гидрохлорид гуанидина (GuHCl; Pfister and Wimmer, 1999; Sadeghipour et al., 2012), HBB (Hadaschik et al., 1999), MRL-1237. (Shimizu et al., 2000) и TBZE-029 (De Palma et al., 2008а). Кроме того, ряд других соединений, таких как метрифудил (Arita et al., 2008), N 6 -бензиладенозин (Arita et al., 2008), аналоги хинолина (Musharrafieh et al., 2019), производные дибукаина ( Tang et al., 2020), аналоги флуоксетина (Manganaro et al., 2020), R523062 (Ma et al., 2020) и виперин (Wei et al., 2018), которые также нацелены на белок энтеровируса 2C. в таблице 3.

Таблица 3 . В литературе сообщалось о противовирусных препаратах, нацеленных на белки энтеровируса 2С.

Гуанидин гидрохлорид

Из этих препаратов наиболее изученным является GuHCl (Rightsel et al., 1961; Loddo et al., 1962). GuHCl - это одобренное FDA небольшое сложное лекарственное средство, которое использовалось для лечения миастенического синдрома Ламберта-Итона при аутоиммунном расстройстве (Lambert, 1966). GuHCl может ингибировать репликацию нескольких пикорнавирусов, включая PV, вирусы Коксаки, эховирусы и ящур, но не HAV (De Palma et al., 2008b). Ранние исследования in vitro показали, что инициация синтеза вирусной РНК ингибируется GuHCl (Tershak, 1982).Было показано, что GuHCl подавляет функцию 2C, которая необходима для инициации синтеза отрицательной, но не положительной цепи РНК, и удлинения цепи РНК PV (Barton and Flanegan, 1997). В нескольких исследованиях устойчивости и / или зависимости PV и FMDV к GuHCl эта устойчивость объяснялась белком 2C (Saunders et al., 1985; Pincus et al., 1986, 1987; Baltera, Tershak, 1989; Tolskaya et al., 1994). Устойчивость PV к GuHCl объяснялась в первую очередь мутациями в положениях 179 и 187 2C (Pincus et al., 1986; Толская и др., 1994). Пфистер и др. (2000) обнаружили, что активность гидролиза АТФ может подавляться GuHCl в миллимолярных концентрациях, а устойчивость и зависимость GuHCl также приписывались 2C (Pfister and Wimmer, 1999).

Долгое время считалось, что геликаза вирусов является потенциальной мишенью для разработки противовирусных лекарств из-за ее важности в репликации вирусной РНК (Kwong et al., 2005). Предыдущие исследования показали, что АТФазная активность PV 2C может ингибироваться GuHCl (Pfister and Wimmer, 1999).Точно так же серийные исследования показали, что GuHCl может ингибировать активность NTPase и геликазы нескольких геликаз, включая белок 2C EV-A71, белок NS3 норовируса человека и белок VP35 вируса Эбола (EBOV), а также ингибировать РНК. репликация энтеровируса, норовируса и EBOV (Xia et al., 2015; Li et al., 2018b; Shu et al., 2019). Гуанидины повсеместно присутствуют в окружающей среде и могут связываться с поверхностью белков ремоделирования вирусной РНК, изменяя их конформации, электростатические состояния и взаимодействия белок-белок или белок-РНК, в конечном итоге ингибируя соответствующие активности ремоделирования РНК (Shu et al., 2019). Поскольку опасения по поводу токсичности GuHCl могут препятствовать его клиническому применению, недавняя разработка лекарств для производных гуанидина выявила несколько потенциальных противовирусных препаратов против HCV, вируса иммунодефицита человека (ВИЧ) и флавивирусов (Frick, 2007; Saczewski and Balewski, 2009, 2013; Линдквист и Стэнджел, 2011).

Перепрофилирование лекарств

В последнее время все больший интерес вызывает перепрофилирование лекарств, так как фармакологическая и токсикологическая информация, относящаяся ко многим лекарствам, уже доступна, и когда перепрофилированное лекарство используется в той же дозировке, что и при первоначальном применении, оно может сразу перейти в фазу II. клинические испытания, что позволяет сэкономить время и средства на разработку.На сегодняшний день флуоксетин, пирлиндол, дибукаин и зуклопентиксол, все одобренные FDA препараты, были идентифицированы с помощью фильтров перепрофилирования лекарств как нацеленные на белки 2C и ингибирующие репликацию энтеровирусов видов B и D (Ulferts et al., 2013, 2016). ).

Флуоксетин, который является селективным ингибитором обратного захвата серотонина, избирательно подавляет репликацию EV-B и EV-D, но не EV-A, EV-C или риновируса A или B (RV-A или -B; Ulferts et al. ., 2013). TBZE-029, который также является соединением, нацеленным на 2C, может ингибировать рост EV-B и EV-D, но не EV-A или EV-C (Ulferts et al., 2013). В 2019 году Bauer et al. (2019) сообщили, что S -энантиомер флуоксетина ингибирует репликацию энтеровируса путем прямого связывания с белком 2C CV-B3. Замена в положениях A224, I227 и A229 белка 2C, которые расположены на коротком участке аминокислоты 224AGSINA229 и на C-конце АТФазного мотива C, может придавать устойчивость к флуоксетину (Ulferts et al., 2013). Этот мотив 224AGSINA229 является консервативным между EV-B (CV-B3) и EV-D (EV-D68), но не у других видов энтеровирусов (Bauer et al., 2019). Различия означают, что некоторые из этих мутаций могут придавать устойчивость к флуоксетину, указывая на жизненно важную роль чувствительности этих вирусов к замещению этого ингибитора (Ulferts et al., 2013). Мутация в петле 224AGSINA229 придает устойчивость не только к флуоксетину, но и к нескольким другим соединениям, включая TBZE-029, HBB, MRL-1237 и GuHCl (De Palma et al., 2008a; Ulferts et al., 2013). Авторы построили модель гомологии CV-B3 2C на основе кристаллической структуры опубликованного EV-A71 2C (Guan et al., 2017) для изучения механизма связывания флуоксетина с CV-B3 2C (Bauer et al., 2019). К сожалению, мутации 2C внизу (положения I227V, C179F и F190L) и на границах (положения V187M и D245N) предсказанного кармана против активности связывания ( S ) -флуоксетина были полностью противоположными, поэтому сайты входа, которые флуоксетин, использованный в гидрофобной полости 2C, не может быть подтвержден (Bauer et al., 2019).

Недавно Ulferts et al. (2016) идентифицировали пирлиндол как новый ингибитор путем скрининга одобренных FDA препаратов против CV-B3.Они обнаружили, что и EV-B, и EV-D могут подавляться пирлиндолом и дибукаином, а дибукаин также может ингибировать EV-A, но ни одно из этих соединений не может ингибировать EV-C или RV. Все эти соединения оказывают ингибирующее действие, действуя на стадии репликации генома. Дальнейшие исследования показали, что мутации A224V, I227V и A229V в 2C обеспечивают устойчивость к пирлиндолу, дибукаину и зуклопентиксолу, что согласуется с эффектами GuHCl и флуоксетина при лечении энтеровирусами.Однако формотерол, который может ингибировать все протестированные энтеровирусы и RV, не нацелен на 2C, и его механизм действия требует дальнейшего выяснения (Ulferts et al., 2016).

Outlook

В совокупности будущая разработка противовирусных препаратов против энтеровирусной инфекции будет сосредоточена на активности ремоделирования РНК белка 2C, чтобы модифицировать и скринировать различные производные гуанидина с лучшими ингибирующими эффектами и более низкой токсичностью. Флуоксетин, который когда-то использовался для лечения большой депрессии и тревожных расстройств, в последнее время стал использоваться в качестве эффективного ингибитора для детей с ослабленным иммунитетом и хроническим энтеровирусным энцефалитом (Gofshteyn et al., 2016), демонстрируя его потенциал для клинического использования в качестве ингибитора энтеровируса 2С. До сих пор эти ингибиторы 2C не были одобрены для клинического применения при лечении энтеровирусных инфекций. Следовательно, нам нужно больше кристаллографических данных о типах белков энтеровируса 2C, чтобы прояснить основные механизмы эффективности ингибиторов, лекарственной устойчивости и точного стиля связывания, а также для облегчения рационального проектирования производных флуоксетина и разработки новых широкого спектра действия. энтеровирусные препараты.

Заключение и перспективы на будущее

Энтеровирусы являются основными причинами HFMD, при этом EV-A71, CV-A16, CV-A6 и CV-A10 являются основными циркулирующими патогенами HFMD, особенно в Азиатско-Тихоокеанском регионе. Неструктурный белок 2C является наиболее консервативным из энтеровирусных белков, но все еще плохо изучен. В этом обзоре мы сосредоточились на текущем понимании структуры и многофункциональности белков 2C энтеровирусов, а также различных ролей белков 2C и врожденного иммунитета хозяина.В последние два десятилетия PV 2C был наиболее изученным неструктурным белком 2C. Предыдущие исследования показали, что белок PV 2C обладает множеством активностей в жизненном цикле вируса (таблица 1). Белки 2C EV-A71 и CV-A16 были впервые обнаружены как обладающие АТФ-зависимой РНК-геликазой и АТФ-независимой шаперонирующей активностью, которые имеют решающее значение для репликации вирусной РНК (Xia et al., 2015). В настоящем обзоре мы обобщили и обсудили текущее понимание взаимосвязей между структурой и функцией белков энтеровируса 2С, особенно ключевых мутаций и мотивов, участвующих в вирусной инфекции и репликации (рис. 2).Будущие исследования будут сосредоточены на определении дополнительных кристаллических структур белков энтеровируса 2C, данные, которые помогут нам выяснить подробный механизм участия белка 2C в репликации и упаковке вируса.

В этом обзоре мы суммировали новые факторы хозяина, такие как RTN3, COPI, TRIM4, exportin2 и ARFGAP1, которые, как было продемонстрировано, взаимодействуют с белками энтеровируса 2C, способствуя репликации вируса (Рисунок 3; Таблица 2). Дальнейшие исследования выявят дополнительные факторы хозяина, которые взаимодействуют с 2С, помогут нам лучше понять биологию энтеровирусов и предоставят новые цели для разработки противовирусной терапии.Важно исследовать сохранение этих факторов хозяина среди других энтеровирусов и даже пикорнавирусов.

Врожденная иммунная система является первой линией защиты от вирусных инфекций и, таким образом, запускает адаптивный иммунитет, который играет жизненно важную роль в борьбе с вирусными инфекциями, особенно в индукции ответа IFN типа I. В нескольких исследованиях сообщалось, что белки пикорнавируса 2C участвуют во врожденном иммунитете хозяина, связываясь с сигнальными путями NF-κB, MDA5, RIG-I, NOD2 и IFN (Рисунок 4; Таблица 2), которые обеспечивают механизмы уклонения от врожденного иммунитета. иммунный ответ при вирусной инфекции.Дальнейшие исследования будут сосредоточены на детальных механизмах, с помощью которых белки 2C нацелены и регулируют путь NF-κB и три основных класса PRR, что в конечном итоге приведет к прояснению взаимодействия между PRR и врожденной иммунной системой.

В настоящее время, несмотря на успешное использование вакцины против EV-A71, новая вакцина против всех энтеровирусов или множественных циркулирующих возбудителей болезней недоступна. Таким образом, существует острая потребность в новых противовирусных препаратах, особенно в противовирусных препаратах широкого спектра действия, для лечения множественных энтеровирусных инфекций.Антиэнтеровирусный флуоксетин широкого спектра действия считается наиболее многообещающим ингибитором 2C, но подробные исследования механизма действия все еще отсутствуют, поскольку кристаллическая структура белка 2C, полученного из чувствительных к флуоксетину энтеровирусов, еще не изучена. решена (таблица 3). Недавно кристаллические структуры EV-A71 2C и PV 2C были разрешены (Guan et al., 2017, 2018). Однако кристаллические структуры других белков энтеровируса 2C, особенно основных циркулирующих патогенов, таких как CV-A16, CV-A6 и CV-A10, не определены.Будущие исследования будут сосредоточены на определении кристаллической структуры различных типов белков энтеровируса 2C и скрининге более широких противовирусных препаратов, которые помогут нам выяснить патогенез энтеровирусных инфекций и облегчить разработку и применение ингибиторов 2C в клинической практике. лечение энтеровирусных инфекций.

Авторские взносы

S-HW является первым автором этой статьи, написавшим рукопись. KW и KZ внесли свой вклад в эту статью.S-CH и JD обсудили и отредактировали эту статью. Все авторы внесли свой вклад в статью и одобрили представленную версию.

Финансирование

Это исследование было поддержано финансированием Национального фонда естественных наук Китая (№ 819), Департамента науки и технологий провинции Цзилинь (20200201525JC), Фондов фундаментальных исследований для центральных университетов (2017TD-08) и Фонда ключевых Лаборатория молекулярной вирусологии, провинция Цзилинь (20102209).

Конфликт интересов

Авторы заявляют, что исследование проводилось при отсутствии каких-либо коммерческих или финансовых отношений, которые могут быть истолкованы как потенциальный конфликт интересов.

Список литературы

Акира, С., Уэмацу, С., Такеучи, О. (2006). Распознавание патогенов и врожденный иммунитет. Ячейка 124, 783–801. DOI: 10.1016 / j.cell.2006.02.015

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Арита, М., Вакита, Т., и Симидзу, Х. (2008). Характеристика фармакологически активных соединений, подавляющих инфекционность полиовирусов и энтеровирусов 71. J. Gen. Virol. 89, 2518–2530. DOI: 10.1099 / vir.0.2008 / 002915-0

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Арита, М., Вакита, Т., и Симидзу, Х. (2012). Белок, содержащий валозин (VCP / p97), необходим для репликации полиовируса и участвует в пути секреции клеточного белка при инфекции полиовируса. J. Virol. 86, 5541–5553. DOI: 10.1128 / JVI.00114-12

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Асаре, Э., Мугаверо, Дж., Цзян, П., Виммер, Э., и Пол, А. В. (2016). Одна аминокислотная замена в неструктурной протеине 2CATPase полиовируса вызывает условные дефекты инкапсидации и непокрытия. J. Virol. 90, 6174–6186. DOI: 10.1128 / JVI.02877-15

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Балтера, Р. Ф. младший, и Тершак, Д. Р. (1989). Устойчивые к гуанидину мутанты полиовируса имеют различные мутации в пептиде 2C. J. Virol. 63, 4441–4444. DOI: 10.1128 / JVI.63.10.4441-4444.1989

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Банерджи Р. и Дасгупта А. (2001). Взаимодействие полипептида пикорнавируса 2С с вирусной РНК с отрицательной цепью. J. Gen. Virol. 82, 2621–2627. DOI: 10.1099 / 0022-1317-82-11-2621

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Банерджи Р., Эчеверри А. и Дасгупта А. (1997). Полипептид 2С, кодируемый полиовирусом, специфически связывается с 3'-концевыми последовательностями вирусной РНК с отрицательной цепью. J. Virol. 71, 9570–9578. DOI: 10.1128 / JVI.71.12.9570-9578.1997

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Банерджи, Р., Цай В., Ким В. и Дасгупта А. (2001). Взаимодействие полипептидов 2C / 2BC, кодируемых полиовирусом, с 3'-концом клеверного листа с отрицательной цепью требует наличия интактной петли-стебля b. Вирусология 280, 41–51. DOI: 10.1006 / viro.2000.0770

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Банерджи, Р., Вайдман, М. К., Эчеверри, А., Кунду, П., и Дасгупта, А. (2004). Регулирование протеазы 3C полиовируса полипептидом 2C. J. Virol. 78, 9243–9256.DOI: 10.1128 / JVI.78.17.9243-9256.2004

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Бартон Д. Дж. И Фланеган Дж. Б. (1997). Синхронная репликация РНК полиовируса: для инициации синтеза РНК с отрицательной цепью требуется гуанидин-ингибируемая активность белка 2С. J. Virol. 71, 8482–8489. DOI: 10.1128 / JVI.71.11.8482-8489.1997

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Бауэр, Л., Лио, Х., ван дер Шаар, Х.М., Стрейтинг, Дж. Р., и ван Куппевельд, Ф. Дж. (2017). Противовирусные препараты прямого действия и стратегии нацеливания на хозяина для борьбы с энтеровирусными инфекциями. Curr. Opin. Virol. 24, 1–8. DOI: 10.1016 / j.coviro.2017.03.009

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Бауэр Л., Манганаро Р., Зонсикс Б., Стрейтинг Дж., Эль Каззи П., Лоренцо Лопес М. и др. (2019). Флуоксетин подавляет репликацию энтеровируса, нацеливаясь на вирусный белок 2С стереоспецифическим образом. ACS Infect. Дис. 5, 1609–1623. DOI: 10.1021 / acsinfecdis.9b00179

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Чанг, Л. Ю., Хуанг, Ю. К., Линь, Т. Ю. (1998). Фульминантный нейрогенный отек легких с заболеваниями рук, ног и рта. Ланцет 352, 367–368. DOI: 10.1016 / S0140-6736 (98) 24031-1

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Cheng, Z., Yang, J., Xia, H., Qiu, Y., Wang, Z., Han, Y., и другие. (2013). Неструктурный белок 2C пикорна-подобного вируса проявляет дестабилизирующую активность спирали нуклеиновых кислот, которая может быть функционально отделена от его активности АТФазы. J. Virol. 87, 5205–5218. DOI: 10.1128 / JVI.00245-13

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Чо, М. В., Тетерина, Н., Эггер, Д., Биенц, К., и Эренфельд, Э. (1994). Перестройка мембраны и индукция везикул рекомбинантным полиовирусом 2C и 2BC в клетках человека. Вирусология 202, 129–145. DOI: 10.1006 / viro.1994.1329

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Де Пальма, А. М., Хеггермонт, В., Ланке, К., Кутар, Б., Бергманн, М., Монфорте, А. М. и др. (2008a). Тиазолобензимидазол TBZE-029 ингибирует репликацию энтеровируса, воздействуя на короткую область непосредственно ниже мотива C в неструктурном белке 2C. J. Virol. 82, 4720–4730. DOI: 10.1128 / JVI.01338-07

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ду, Х., Инь, П., Ян, X., Чжан, Л., Цзинь, К., и Чжу, Г. (2015). Белок 2C энтеровируса 71 ингибирует активацию NF-каппа B путем связывания с RelA (p65). Sci. Реп. 5: 14302. DOI: 10.1038 / srep14302

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Фицджеральд М. Э., Роулинг Д. К., Вела А. и Пайл А. М. (2014). Развивающийся арсенал: обнаружение вирусной РНК рецепторами, подобными RIG-I. Curr. Opin. Microbiol. 20, 76–81. DOI: 10.1016 / j.mib.2014.05.004

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Фицджеральд, К.Д., и Семлер Б. Л. (2009). Связывание элементов IRES в мРНК с аппаратом трансляции эукариот. Biochim. Биофиз. Acta 1789, 518–528. DOI: 10.1016 / j.bbagrm.2009.07.004

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Фрик, Д. Н. (2007). Белок NS3 вируса гепатита С: модельная РНК-геликаза и потенциальная лекарственная мишень. Curr. Вопросы Мол. Биол. 9, 1–20.

PubMed Аннотация | Google Scholar

Гай Д., Чжао Р., Ли, Д., Финкельштейн, К. В., и Чен, X. С. (2004). Механизмы конформационного изменения репликативной гексамерной геликазы большого опухолевого антигена SV40. Ячейка 119, 47–60. DOI: 10.1016 / j.cell.2004.09.017

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Глэду, Д. П., О’Доннелл, В., Бейкер-Бранстеттер, Р., Холинка, Л. Г., Пачеко, Дж. М., Фернандес-Сайнс, И. и др. (2012). Неструктурный белок 2C вируса ящура взаимодействует с Beclin1, модулируя репликацию вируса. J. Virol. 86, 12080–12090. DOI: 10.1128 / JVI.01610-12

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Гофштейн Дж., Карденас А. М., Берден Д. (2016). Лечение хронического энтеровирусного энцефалита флуоксетином у пациента с Х-сцепленной агаммаглобулинемией. Pediatr. Neurol. 64, 94–98. DOI: 10.1016 / j.pediatrneurol.2016.06.014

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Губау, Д., Шлее, М., Deddouche, S., Pruijssers, A.J., Zillinger, T., Goldeck, M., et al. (2014). Противовирусный иммунитет через RIG-I-опосредованное распознавание РНК, несущей 5'-дифосфаты. Nature 514, 372–375. DOI: 10.1038 / природа13590

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Гуань, Х., Тиан, Дж., Цинь, Б., Войдыла, Дж. А., Ван, Б., Чжао, З. и др. (2017). Кристаллическая структура 2С геликазы энтеровируса 71. Sci. Adv. 3: e1602573. DOI: 10.1126 / sciadv.1602573

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Гуань, Х., Тянь, Дж., Чжан, К., Цинь, Б., и Цуй, С. (2018). Кристаллическая структура растворимого фрагмента 2CATPase полиовируса. PLoS Pathog. 14: e1007304. DOI: 10.1371 / journal.ppat.1007304

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Hadaschik, D., Klein, M., Zimmermann, H., Eggers, H.J., and Nelsen-Salz, B. (1999). Зависимость эховируса 9 от ингибитора репликации РНК энтеровируса 2- (альфа-гидроксибензил) -бензимидазол отображается на неструктурный белок 2C. J. Virol. 73, 10536–10539. DOI: 10.1128 / JVI.73.12.10536-10539.1999

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

He, Y. Q., Chen, L., Xu, W. B., Yang, H., Wang, H.Z., Zong, W. P., et al. (2013). Возникновение, циркуляция и пространственно-временной филогенетический анализ инфекций рук, ног и рта, ассоциированных с вирусом Коксаки a6 и вирусом Коксаки a10, с 2008 по 2012 год в Шэньчжэне, Китай. J. Clin. Microbiol. 51, 3560–3566. DOI: 10.1128 / JCM.01231-13

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Hornung, V., Ellegast, J., Kim, S., Brzozka, K., Jung, A., Kato, H., et al. (2006). 5'-трифосфатная РНК является лигандом для RIG-I. Science 314, 994–997. DOI: 10.1126 / science.1132505

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Hou, L., Ge, X., Xin, L., Zhou, L., Guo, X., and Yang, H. (2014). Неструктурные белки 2C и 3D участвуют в аутофагии, индуцированной вирусом энцефаломиокардита. Virol. J. 11: 156. DOI: 10.1186 / 1743-422X-11-156

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Хуанг С.С., Чанг С.Л., Ван П.С., Цай Ю. и Лю Х. С. (2009). Аутофагия, индуцированная энтеровирусом 71, обнаруженная in vitro и in vivo, способствует репликации вируса. J. Med. Virol. 81, 1241–1252. DOI: 10.1002 / jmv.21502

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Итакура, Э., Киши-Итакура, К., и Мидзусима, Н.(2012). Синтаксин 17 SNARE, закрепленный на хвосте шпильки, нацелен на аутофагосомы для слияния с эндосомами / лизосомами. Cell 151, 1256–1269. DOI: 10.1016 / j.cell.2012.11.001

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ji, T., Guo, Y., Lv, L., Wang, J., Shi, Y., Yu, Q., et al. (2019). Возникающая рекомбинация субгенотипа C2 HFMD-ассоциированного CV-A4 постоянно и широко циркулирует в Китае. Sci. Отчет 9: 13668. DOI: 10.1038 / s41598-019-49859-7

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Цзинь, Ю., Чжан, Р., Ву, В., и Дуань, Г. (2018). Врожденное уклонение от иммунитета со стороны энтеровирусов, связанное с эпидемической болезнью рук-ящура. Фронт. Microbiol. 9: 2422. DOI: 10.3389 / fmicb.2018.02422

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Канг Д. К., Гопалкришнан Р. В., Ву К., Янковский Е., Пайл А. М. и Фишер П. Б. (2002). mda-5: индуцируемая интерфероном предполагаемая РНК-геликаза с двухцепочечной РНК-зависимой АТФазной активностью и свойствами подавления роста меланомы. Proc. Natl. Акад. Sci. США 99, 637–642. DOI: 10.1073 / pnas.022637199

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Като, Х., Такеучи, О., Микамо-Сато, Э., Хираи, Р., Кавай, Т., Мацусита, К., и др. (2008). Зависимое от длины распознавание двухцепочечных рибонуклеиновых кислот геном-I, индуцируемым ретиноевой кислотой, и геном 5, ассоциированным с дифференцировкой меланомы. J. Exp. Med. 205, 1601–1610. DOI: 10.1084 / jem.20080091

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Кляйн, М., Hadaschik, D., Zimmermann, H., Eggers, H.J., and Nelsen-Salz, B. (2000). Ингибиторы репликации пикорнавирусов HBB и гуанидин в системе эховируса-9: значение вирусного белка 2C. J. Gen. Virol. 81, 895–901. DOI: 10.1099 / 0022-1317-81-4-895

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Lai, J.K.F., Sam, I.C., Verlhac, P., Baguet, J., Eskelinen, E.L., Faure, M., et al. (2017). Неструктурный белок 2BC энтеровируса A71 взаимодействует с белками SNARE, вызывая образование автолизосом. Вирусы 9: 169. DOI: 10.3390 / v